यूकेरियोटिक mRNA अनुक्रमण-NGS
विशेषताएँ
● स्ट्रैंड-विशिष्ट अनुक्रमण डेटा प्राप्त करने के लिए वैकल्पिक दिशात्मक mRNA लाइब्रेरी तैयार करना।
● विभिन्न प्रकार के BI विश्लेषण हमारे सभी ग्राहकों की आवश्यकताओं को पूरा करते हैं।
लाभ
●व्यापक विशेषज्ञताहमने 6 लाख से अधिक नमूनों का प्रसंस्करण किया है, जिनमें कोशिका संवर्धन, ऊतक और शारीरिक तरल पदार्थ जैसे विभिन्न प्रकार के नमूने शामिल हैं। हम प्रत्येक परियोजना में अपनी विशेषज्ञता का भरपूर उपयोग करते हैं।
●कठोर गुणवत्ता नियंत्रणहम नमूना तैयार करने से लेकर लाइब्रेरी तैयार करने, अनुक्रमण और जैवसूचना विज्ञान तक, सभी चरणों में मुख्य नियंत्रण बिंदुओं को लागू करते हैं। हमारी सावधानीपूर्वक निगरानी से लगातार उच्च गुणवत्ता वाले परिणाम सुनिश्चित होते हैं।
●व्यापक व्याख्याहम विभेदक रूप से व्यक्त जीनों (DEGs) को कार्यात्मक रूप से एनोटेट करने और संबंधित संवर्धन विश्लेषण करने के लिए कई डेटाबेस का उपयोग करते हैं। यह व्यापक दृष्टिकोण ट्रांसक्रिप्टोम प्रतिक्रिया के अंतर्निहित कोशिकीय और आणविक प्रक्रियाओं की जानकारी प्रदान करता है, जिससे यह सुनिश्चित होता है कि आपको अपने प्रयोग के डेटा के बारे में सभी संभावित जानकारी प्राप्त हो।
●बिक्री के बाद सहायताहम समझते हैं कि उपस्थित रहना कितना महत्वपूर्ण है, इसीलिए हमारी प्रतिबद्धता परियोजना पूर्ण होने के बाद भी 3 महीने की बिक्रीोत्तर सेवा अवधि तक विस्तारित है। इस दौरान, हम परियोजना का फॉलो-अप, समस्या निवारण सहायता और परिणामों से संबंधित किसी भी प्रश्न के समाधान के लिए प्रश्नोत्तर सत्र प्रदान करते हैं।
नमूना संबंधी आवश्यकताएँ और वितरण
| पुस्तकालय | अनुक्रमण रणनीति | डेटा की अनुशंसा की गई | गुणवत्ता नियंत्रण |
| पॉली ए समृद्ध | इलुमिना PE150 डीएनएसबीएसईक्यू-टी7 | 6-10 जीबी | Q30≥85% |
नमूना आवश्यकताएँ:
न्यूक्लियोटाइड:
न्यूनतम नमूना आवश्यकताएँ:
| सांद्रता (एनजी/एमएल) | मात्रा (मिग्रा) | पवित्रता | अखंडता | |
| मानक पुस्तकालय | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 जेल पर प्रोटीन या डीएनए की संदूषण की मात्रा बहुत कम या न के बराबर दिखाई दी। | पौधों के लिए: RIN≥4.0; पशुओं के लिए: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; सीमित या कोई आधारभूत उन्नयन नहीं |
| दिशात्मक पुस्तकालय | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 जेल पर प्रोटीन या डीएनए की संदूषण की मात्रा बहुत कम या न के बराबर दिखाई दी। | पौधों के लिए: RIN≥4.0; पशुओं के लिए: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; सीमित या कोई आधारभूत उन्नयन नहीं |
| पौधे | जानवर | ऑर्थ्रोपोड | संपूर्ण रक्त | प्रकोष्ठों |
| जड़, तना या पंखुड़ी: 450 मिलीग्राम पत्ती या बीज: 300 मिलीग्राम फल: 1.2 ग्राम | हृदय या आंत: 300 मिलीग्राम आंतरिक अंग या मस्तिष्क: 240 मिलीग्राम मांसपेशी: 450 मिलीग्राम हड्डियाँ, बाल या त्वचा: 1 ग्राम | कीड़े-मकोड़े: 6 ग्राम क्रस्टेशिया: 300 मिलीग्राम | 1 ट्यूब | 106 कोशिकाएँ |
अनुशंसित नमूना वितरण
कंटेनर: 2 मिलीलीटर सेंट्रीफ्यूज ट्यूब (टिन फॉयल का उपयोग करने की सलाह नहीं दी जाती है)
नमूना लेबलिंग: समूह + प्रतिकृति जैसे A1, A2, A3; B1, B2, B3...
शिपमेंट:
1. ड्राई आइस: नमूनों को बैग में पैक करके ड्राई आइस में दबा देना चाहिए।
2. आरएनए स्टेबल ट्यूब: आरएनए के नमूनों को आरएनए स्टेबलाइजेशन ट्यूब (जैसे आरएनएस्टेबल®) में सुखाया जा सकता है और कमरे के तापमान पर भेजा जा सकता है।
नमूना संबंधी आवश्यकताएँ और वितरण
प्रयोग डिजाइन
नमूना वितरण
आरएनए निष्कर्षण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री पश्चात सेवाएं
बायोइनफॉरमैटिक्स
जिन नमूनों के लिए संदर्भ जीनोम उपलब्ध है, उनके लिए बीआई विश्लेषण इस प्रकार है:
Øकच्चे डेटा की गुणवत्ता नियंत्रण
Øसंदर्भ जीनोम संरेखण
Øप्रतिलेख संरचना विश्लेषण
Øअभिव्यक्ति मात्रा निर्धारण
Øविभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषण
Øफ़ंक्शन एनोटेशन और संवर्धन
जिन नमूनों में संदर्भ जीनोम उपलब्ध नहीं है, उनके लिए निम्नलिखित विकल्प उपलब्ध हैं:
• कच्चे डेटा की गुणवत्ता नियंत्रण
•संरचना अनुकूलन के साथ संयोजन
•विभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषण
•फ़ंक्शन एनोटेशन और संवर्धन
संदर्भ जीनोम संरेखण
डेटा संतृप्ति
नमूना सहसंबंध और जैविक प्रतिकृतियों का आकलन
विभेदक रूप से व्यक्त जीन (डीईजी)
डीईजी का कार्यात्मक एनोटेशन
डीईजी का कार्यात्मक संवर्धन
बीएमकेजीन की यूकेरियोटिक एनजीएस एमआरएनए अनुक्रमण सेवाओं द्वारा सुगम बनाई गई प्रगति का अन्वेषण प्रकाशनों के एक सुनियोजित संग्रह के माध्यम से करें।
हुआंग, एल. एट अल. (2023) 'ट्राइक्लोसन और ट्राइक्लोकार्बन गंध पहचान को सीमित करके, घ्राण संकेत संचरण को बाधित करके और घ्राण सूचना प्रसंस्करण को बाधित करके सुनहरी मछली की घ्राण क्षमता को कमजोर करते हैं',जल अनुसंधान, 233, पृ. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
जिया, एल.जे. एट अल. (2023) 'एस्परजिलस फ्यूमिगेटस मानव पी11 को हाईजैक करके कवक युक्त फागोसोम को गैर-अपघटनकारी मार्ग की ओर पुनर्निर्देशित करता है',कोशिका मेजबान और सूक्ष्मजीव, 31(3), पृ. 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
जिन, के. एट अल. (2022) 'मा बांस (डेन्ड्रोकैलामस लैटिफ्लोरस मुनरो) के शूट विकास में शामिल टीसीपी ट्रांसक्रिप्शन कारक',पादप विज्ञान में सीमांत, 13, पृ. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
वेन, एक्स. एट अल. (2022) 'क्राइसेन्थेमम लावंडुलिफोलियम जीनोम और विविध कैपिटुलम प्रकारों के अंतर्निहित आणविक तंत्र',बागवानी अनुसंधान, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
झांग, युजी एट अल. (2023) 'सिनर्जिस्टिक आरओएस वृद्धि और ऑटोफैगी अवरोध के माध्यम से कोलोरेक्टल कैंसर पर सोनोडायनामिक थेरेपी को बढ़ाने के लिए एक कैस्केड नैनोरिएक्टर',नैनो टुडे, 49, पृ. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
