विकासवादी आनुवंशिकी
सेवा के लाभ
ताकागी एट अल.,पादप पत्रिका, 2013
●व्यापक जैवसूचना विश्लेषण:यह प्रजातियों की विकासवादी क्षमता को दर्शाने वाली आनुवंशिक विविधता का अनुमान लगाने में सक्षम बनाता है और अभिसारी विकास और समानांतर विकास के न्यूनतम प्रभाव के साथ प्रजातियों के बीच विश्वसनीय फाइलोजेनेटिक संबंध प्रकट करता है।
●वैकल्पिक अनुकूलित विश्लेषणउदाहरण के लिए, न्यूक्लियोटाइड और अमीनो एसिड स्तर पर भिन्नताओं के आधार पर विचलन समय और गति का अनुमान लगाना।
●व्यापक विशेषज्ञता और प्रकाशन रिकॉर्डबीएमकेजीन ने जनसंख्या और विकासवादी आनुवंशिकी परियोजनाओं में 15 वर्षों से अधिक का व्यापक अनुभव प्राप्त किया है, जिसमें हजारों प्रजातियां आदि शामिल हैं, और नेचर कम्युनिकेशंस, मॉलिक्यूलर प्लांट्स, प्लांट बायोटेक्नोलॉजी जर्नल आदि में प्रकाशित 1000 से अधिक उच्च-स्तरीय परियोजनाओं में योगदान दिया है।
● उच्च कुशल जैवसूचना विज्ञान टीम और संक्षिप्त विश्लेषण चक्रउन्नत जीनोमिक्स विश्लेषण में व्यापक अनुभव के साथ, बीएमकेजीन की टीम त्वरित समय सीमा के भीतर व्यापक विश्लेषण प्रदान करती है।
● बिक्री के बाद सहायता:परियोजना पूर्ण होने के बाद भी हमारी प्रतिबद्धता 3 महीने की बिक्री पश्चात सेवा अवधि तक विस्तारित है। इस दौरान, हम परियोजना का अनुवर्ती कार्रवाई, समस्या निवारण सहायता और परिणामों से संबंधित किसी भी प्रश्न के समाधान हेतु प्रश्नोत्तर सत्र प्रदान करते हैं।
सेवा विनिर्देश और आवश्यकताएँ
| अनुक्रमण का प्रकार | अनुशंसित जनसंख्या पैमाना | अनुक्रमण रणनीति | न्यूक्लियोटाइड आवश्यकताएँ |
| संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण | कम से कम 30 व्यक्ति, जिनमें से प्रत्येक उपसमूह से कम से कम 10 व्यक्ति हों।
| 10 गुना | सांद्रता: ≥ 1 एनजी/µएल कुल मात्रा ≥ 30 एनजी सीमित या नगण्य क्षरण या संदूषण |
| विशिष्ट-स्थान प्रवर्धित खंड (एसएलएएफ) | टैग की गहराई: 10 गुना टैग की संख्या: <400 Mb: WGS की अनुशंसा की जाती है <1Gb: 100K टैग 1 जीबी >2 जीबी: 300K टैग अधिकतम 500k टैग | सांद्रता ≥ 5 एनजी/µएल कुल मात्रा ≥ 80 एनजी नैनोड्रोप OD260/280=1.6-2.5 एगारोज जेल: इसमें क्षरण या संदूषण बहुत कम या न के बराबर होता है।
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सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिजाइन
नमूना वितरण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री पश्चात सेवाएं
इस सेवा में जनसंख्या संरचना (फाइलोजेनेटिक ट्री, पीसीए, जनसंख्या स्तरीकरण चार्ट), जनसंख्या विविधता और जनसंख्या चयन (लिंकेज असंतुलन, लाभकारी स्थलों का चयनात्मक स्वीप-सिलेक्शन) का विश्लेषण शामिल है। इस सेवा में अनुकूलित विश्लेषण (जैसे विचलन समय, जीन प्रवाह) भी शामिल किया जा सकता है।
*यहां दिखाए गए डेमो परिणाम BMKGENE के साथ प्रकाशित जीनोम से लिए गए हैं।
1. विकास विश्लेषण में आनुवंशिक भिन्नताओं के आधार पर फाइलोजेनेटिक ट्री, जनसंख्या संरचना और पीसीए का निर्माण शामिल है।
फाइलोजेनेटिक ट्री उन प्रजातियों के बीच वर्गीकरण और विकासवादी संबंधों को दर्शाता है जिनका एक सामान्य पूर्वज है।
पीसीए का उद्देश्य उप-आबादी के बीच निकटता को दर्शाना है।
जनसंख्या संरचना एलील आवृत्तियों के संदर्भ में आनुवंशिक रूप से भिन्न उप-जनसंख्या की उपस्थिति दर्शाती है।
चेन, एट अल.,पीएनएएस, 2020
2. चयनात्मक स्वीप
सेलेक्टिव स्वीप एक ऐसी प्रक्रिया को संदर्भित करता है जिसके द्वारा एक लाभकारी साइट का चयन किया जाता है और लिंक्ड न्यूट्रल साइटों की आवृत्तियों को बढ़ाया जाता है और अनलिंक्ड साइटों की आवृत्तियों को घटाया जाता है, जिसके परिणामस्वरूप क्षेत्रीय कमी होती है।
चयनात्मक स्वीप क्षेत्रों पर जीनोम-व्यापी पहचान को एक निश्चित चरण (10 केबी) पर स्लाइडिंग विंडो (100 केबी) के भीतर सभी एसएनपी के जनसंख्या आनुवंशिक सूचकांक (π, Fst, ताजिमा का डी) की गणना करके संसाधित किया जाता है।
न्यूक्लियोटाइड विविधता (π)
ताजिमा का डी
निर्धारण सूचकांक (Fst)
वू, एट अल.,आणविक पादप, 2018
3. जीन प्रवाह
वू, एट अल.,आणविक पादप, 2018
4. जनसांख्यिकीय इतिहास
झांग, एट अल.,प्रकृति पारिस्थितिकी और विकास, 2021
5. विचलन समय
झांग, एट अल.,प्रकृति पारिस्थितिकी और विकास, 2021
बीएमकेजीन की विकासवादी आनुवंशिकी सेवाओं द्वारा सुगम बनाई गई प्रगति का अन्वेषण प्रकाशनों के एक सुनियोजित संग्रह के माध्यम से करें:
हसन्यार, एके एट अल. (2023) 'संपूर्ण जीनोम पुनर्अनुक्रमण द्वारा एपिस सेराना सेराना लार्वा में सैकब्रूड वायरस प्रतिरोध से जुड़े एसएनपी आणविक मार्करों और उम्मीदवार जीनों की खोज'आणविक विज्ञान की अंतर्राष्ट्रीय पत्रिका, 24(7). डीओआई: 10.3390/आईजेएमएस24076238।
चाय, जे. एट अल. (2022) 'एक जंगली, आनुवंशिक रूप से शुद्ध चीनी विशाल सैलामैंडर की खोज से संरक्षण के नए अवसर पैदा होते हैं',प्राणीशास्त्रीय अनुसंधान, 2022, खंड 43, अंक 3, पृष्ठ: 469-480, 43(3), पृ. 469–480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.
हान, एम. एट अल. (2022) 'किंगहाई-तिब्बती पठार पर स्वदेशी एल्यमस सिबिरिकस एल. का फाइलोजियोग्राफिकल पैटर्न और जनसंख्या विकास इतिहास'पादप विज्ञान में सीमांत, 13, पृ. 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.
वांग, जे. एट अल. (2022) 'क्रोमोसोम-स्तर जीनोम असेंबली और लोंगान एक्सेसन्स के जनसंख्या जीनोमिक्स से लोंगान विकास में जीनोमिक अंतर्दृष्टि'बागवानी अनुसंधान, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.
