जीनोम-व्यापी एसोसिएशन विश्लेषण
कार्यप्रवाह
सेवा के लाभ
●व्यापक विशेषज्ञता और प्रकाशन रिकॉर्डजीडब्ल्यूएस में संचित अनुभव के साथ, बीएमकेजीन ने जनसंख्या जीडब्ल्यूएस अनुसंधान में सैकड़ों प्रजाति परियोजनाओं को पूरा किया है, शोधकर्ताओं को 100 से अधिक लेख प्रकाशित करने में सहायता की है, और संचयी प्रभाव कारक 500 तक पहुंच गया है।
● व्यापक जैवसूचना विश्लेषणइस वर्कफ़्लो में एसएनपी-विशेषता संबंध विश्लेषण शामिल है, जो संभावित जीनों का एक सेट और उनके संबंधित कार्यात्मक एनोटेशन प्रदान करता है।
●उच्च कुशल जैवसूचना विज्ञान टीम और कम समय में विश्लेषण प्रक्रिया।उन्नत जीनोमिक्स विश्लेषण में व्यापक अनुभव के साथ, बीएमकेजीन की टीम त्वरित समय सीमा के भीतर व्यापक विश्लेषण प्रदान करती है।
●बिक्री के बाद सहायता:परियोजना पूर्ण होने के बाद भी हमारी प्रतिबद्धता 3 महीने की बिक्री पश्चात सेवा अवधि तक विस्तारित है। इस दौरान, हम परियोजना का अनुवर्ती कार्रवाई, समस्या निवारण सहायता और परिणामों से संबंधित किसी भी प्रश्न के समाधान हेतु प्रश्नोत्तर सत्र प्रदान करते हैं।
सेवा विनिर्देश और आवश्यकताएँ
| अनुक्रमण का प्रकार | अनुशंसित जनसंख्या पैमाना | अनुक्रमण रणनीति | न्यूक्लियोटाइड आवश्यकताएँ |
| संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण | 200 नमूने | 10 गुना | सांद्रता: ≥ 1 एनजी/µएल कुल मात्रा ≥ 30 एनजी सीमित या नगण्य क्षरण या संदूषण |
| विशिष्ट-स्थान प्रवर्धित खंड (एसएलएएफ) | टैग की गहराई: 10x टैग की संख्या: < 400 एमबी: WGS की अनुशंसा की जाती है < 1 जीबी: 100K टैग 1 जीबी > 2 जीबी: 300K टैग अधिकतम 500k टैग | सांद्रता ≥ 5 एनजी/µएल कुल मात्रा ≥ 80 एनजी एगारोज जेल: इसमें क्षरण या संदूषण बहुत कम या न के बराबर होता है।
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सामग्री चयन
विभिन्न किस्में, उपप्रजातियाँ, स्थानीय प्रजातियाँ/जीन बैंक/मिश्रित परिवार/वन्य संसाधन
विभिन्न किस्में, उप-प्रजातियाँ, स्थानीय नस्लें
सौतेले भाई-बहन परिवार/पूर्ण भाई-बहन परिवार/वन्य संसाधन
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिजाइन
नमूना वितरण
आरएनए निष्कर्षण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री पश्चात सेवाएं
इसमें निम्नलिखित विश्लेषण शामिल है:
- जीनोम-व्यापी सहसंबंध विश्लेषण: एलएम, एलएमएम, ईएममैक्स, फास्टएलएमएम मॉडल
- संभावित जीनों का कार्यात्मक एनोटेशन
एसएनपी-लक्षण संबंध विश्लेषण – मैनहट्टन प्लॉट
एसएनपी-लक्षण संबंध विश्लेषण – क्यूक्यू प्लॉट
बीएमकेजीन की डीजीडब्ल्यूएस सेवाओं द्वारा सुगम बनाई गई प्रगति का अन्वेषण प्रकाशनों के एक सुनियोजित संग्रह के माध्यम से करें:
एलवी, एल. एट अल. (2023) 'जीनोम-वाइड एसोसिएशन अध्ययन द्वारा रेजर क्लैम सिनोनोवाकुला कॉन्स्ट्रिक्टा में अमोनिया सहनशीलता के आनुवंशिक आधार में अंतर्दृष्टि'एक्वाकल्चर, 569, पृ. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
ली, एक्स. एट अल. (2022) '398 फॉक्सटेल बाजरा किस्मों के मल्टी-ओमिक्स विश्लेषण से घरेलूकरण, मेटाबोलाइट लक्षणों और सूजन-रोधी प्रभावों से जुड़े जीनोमिक क्षेत्रों का पता चलता है'आणविक पादप, 15(8), पृ. 1367-1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003।
ली, जे. एट अल. (2022) 'सूखे के वातावरण में बिना छिलके वाली जौ के फेनोटाइप का जीनोम-व्यापी एसोसिएशन मैपिंग'पादप विज्ञान में सीमांत, 13, पृ. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
झाओ, एक्स. एट अल. (2021) 'जीएमएसटी1, जो एक सल्फोट्रांसफेरेज को एनकोड करता है, सोयाबीन मोज़ेक वायरस स्ट्रेन जी2 और जी3 के प्रति प्रतिरोध प्रदान करता है',पादप, कोशिका और पर्यावरण, 44(8), पृ. 2777-2792। डीओआई: 10.1111/पीसीई.14066।
