मेटाट्रांसक्रिपटोम अनुक्रमण
सेवा सुविधाएँ
● आरआरएनए की कमी के बाद दिशात्मक एमआरएनए लाइब्रेरी की तैयारी।
● इलुमिना नोवासेक पर अनुक्रमण।
सेवा लाभ
●जटिल माइक्रोबियल समुदायों के परिवर्तनों का अध्ययन करें:यह ट्रांसक्रिप्शनल स्तर पर होता है और संभावित नए जीन का पता लगाता है।
●मेजबान या पर्यावरण के साथ माइक्रोबियल समुदाय की बातचीत की व्याख्या करना।
●व्यापक जैव सूचनात्मक विश्लेषण: यह सामुदायिक वर्गीकरण और कार्यात्मक रचनाओं के साथ-साथ विभेदक जीन अभिव्यक्ति विश्लेषण पर अंतर्दृष्टि प्रदान करता है।
●व्यापक जीन एनोटेशन:माइक्रोबियल समुदायों की सूचनात्मक जीन अभिव्यक्ति जानकारी के लिए अद्यतन जीन फ़ंक्शन डेटाबेस का उपयोग करना।
●बिक्री के बाद का समर्थन:हमारी प्रतिबद्धता 3 महीने की बिक्री-पश्चात सेवा अवधि के साथ परियोजना को पूरा करने से आगे तक फैली हुई है। इस समय के दौरान, हम परिणामों से संबंधित किसी भी प्रश्न के समाधान के लिए प्रोजेक्ट फॉलो-अप, समस्या निवारण सहायता और प्रश्नोत्तर सत्र की पेशकश करते हैं।
सेवा विशिष्टताएँ
| अनुक्रमण मंच | अनुक्रमण रणनीति | डेटा अनुशंसित | डेटा गुणवत्ता नियंत्रण |
| इलुमिना नोवासेक | पीई150 | 12जीबी | Q30≥85% |
नमूना आवश्यकताएँ
| एकाग्रता (एनजी/μL) | कुल मात्रा (µg) | आयतन (μL) | ओडी260/280 | ओडी260/230 | रिन |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
सेवा कार्य प्रवाह
नमूना वितरण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री के बाद की सेवाएँ
निम्नलिखित विश्लेषण शामिल है:
● अनुक्रमण डेटा गुणवत्ता नियंत्रण
● प्रतिलेख सभा
● टैक्सोनॉमिक एनोटेशन और प्रचुरता
● कार्यात्मक एनोटेशन और प्रचुरता
● अभिव्यक्ति परिमाणीकरण और विभेदक विश्लेषण
प्रत्येक नमूने का वर्गीकरण वितरण:
बीटा विविधता विश्लेषण: यूपीजीएमए
कार्यात्मक एनोटेशन - बहुतायत जाओ
विभेदक वर्गीकरण बहुतायत - LEFSE
प्रकाशनों के क्यूरेटेड संग्रह के माध्यम से BMKGene की मेटा ट्रांसक्रिपटॉमिक्स अनुक्रमण सेवाओं द्वारा सुगम की गई प्रगति का अन्वेषण करें।
लू, जेड एट अल. (2023) 'बैक्टेरॉइडेल्स क्रम के लैक्टेट-उपयोग करने वाले बैक्टीरिया की एसिड सहनशीलता उच्च-केंद्रित आहार के लिए अनुकूलित बकरियों में रूमिनल एसिडोसिस की रोकथाम में योगदान करती है',पशुओं का आहार, 14, पृ. 130-140. डीओआई: 10.1016/जे.एएनआईएनयू.2023.05.006।
सॉन्ग, जेड एट अल। (2017) 'उच्च-थ्रूपुट एम्प्लिकॉन्स और मेटाट्रांसक्रिपटॉमिक्स अनुक्रमण द्वारा पारंपरिक ठोस-अवस्था किण्वन में कोर कार्यात्मक माइक्रोबायोटा को उजागर करना',माइक्रोबायोलॉजी में फ्रंटियर्स, 8(जुलाई). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/पूर्ण।
वांग, डब्ल्यू. एट अल. (2022) 'फाइटोपैथोजेनिक अल्टरनेरिया फंगस के मेटाट्रांसक्रिपटॉमिक्स सर्वे से खोजे गए नए माइकोवायरस',वायरस, 14(11), पृ. 2552. डीओआई: 10.3390/वी14112552/एस1।
वेई, जे. एट अल. (2022) 'समानांतर मेटाट्रांसक्रिपटोम विश्लेषण से भृंगों और उनके आंत सहजीवों द्वारा पौधों के द्वितीयक मेटाबोलाइट्स के क्षरण का पता चलता है',मोलेकुलर परिस्थितिकी, 31(15), पीपी 3999-4016। डीओआई: 10.1111/एमईसी.16557।
