mRNA-seq (NGS) – डी नोवो

mRNA अनुक्रमण विशिष्ट परिस्थितियों में कोशिकाओं में मौजूद सभी mRNA प्रतिलेखों की प्रोफाइलिंग की अनुमति देता है और विभिन्न अनुसंधान क्षेत्रों में व्यापक रूप से उपयोग की जाने वाली तकनीक है। BMKCloud डी नोवो mRNA-seq पाइपलाइन को पॉली-ए समृद्ध अनुक्रमण पुस्तकालयों का विश्लेषण करने के लिए डिज़ाइन किया गया है जब कोई संदर्भ जीनोम उपलब्ध नहीं होता है। पाइपलाइन गुणवत्ता नियंत्रण से शुरू होती है, जिसके बाद...डी नोवोट्रांसक्रिप्ट संयोजन और यूनिजीन सेट चयन। यूनिजीन संरचना विश्लेषण कोडिंग अनुक्रम (सीडीएस) और सरल अनुक्रम दोहराव (एसएसआर) की भविष्यवाणी करता है। इसके बाद, विभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषण परीक्षण की गई स्थितियों के बीच विभेदक रूप से व्यक्त जीन (डीईजी) का पता लगाता है, जिसके बाद जैविक अंतर्दृष्टि प्राप्त करने के लिए डीईजी का कार्यात्मक एनोटेशन और संवर्धन किया जाता है।