● नैनोपोर P48 (10Kb लाइब्रेरी) और पैकबियो रेवियो (8Kb लाइब्रेरी) पर लॉन्ग रीड सीक्वेंसिंग।
● त्रुटि सुधार: इलुमिना नोवासेक (PE150 लाइब्रेरी) पर अनुक्रमण
●उच्च गुणवत्ता वाली मेटाजीनोम असेंबली:कम संख्या में ऐसे कॉन्टिग्स जिनमें निरंतरता अधिक हो।
●उच्चतर सटीकता:प्रजाति की पहचान और कार्यात्मक जीन का पूर्वानुमान।
●बेहतर असेंबलीजीवाणु जीनोम पृथक्करण और तुलनात्मक मेटाजीनोम विश्लेषण को सुगम बनाना।
●व्यापक जैवसूचना विश्लेषण:हमारा विश्लेषण न केवल वर्गीकरण संबंधी विविधता पर बल्कि समुदाय की कार्यात्मक विविधता पर भी केंद्रित है।
●विस्तृत अनुभवहमारी टीम हर परियोजना में व्यापक अनुभव लेकर आती है, विभिन्न अनुसंधान क्षेत्रों में कई मेटाजेनोमिक्स परियोजनाओं को सफलतापूर्वक पूरा करने और 200,000 से अधिक नमूनों को संसाधित करने का एक सफल ट्रैक रिकॉर्ड है।
| अनुक्रमण प्लेटफ़ॉर्म | अनुक्रमण रणनीति | डेटा की अनुशंसा की गई |
| इलुमिना नोवासेक | पीई150 | 6 जीबी |
| नैनोपोर पी48 | 10 केबी | 6 / 10 जीबी |
| पैकबियो रेवियो | 8 केबी | 10 / 20 जीबी |
| सांद्रता (एनजी/µएल) | कुल मात्रा (µg) | आयतन (µL) | |
| इलुमिना PE150 लाइब्रेरी | ≥1 | ≥0.03 | ≥20 |
| नैनोपोर 10 केबी लाइब्रेरी | ≥40 | ≥2 | ≥20 |
| PacBio 8 kb लाइब्रेरी | ≥50 | 10 माइक्रोग्राम/कोशिका | ≥20 |
इसमें निम्नलिखित विश्लेषण शामिल है:
● अनुक्रमण डेटा गुणवत्ता नियंत्रण
● मेटाजीनोम संयोजन और जीन भविष्यवाणी
● जीन एनोटेशन
● वर्गीकरण संबंधी अल्फा विविधता विश्लेषण
● समुदाय का कार्यात्मक विश्लेषण: जैविक कार्य, चयापचय, एंटीबायोटिक प्रतिरोध
● कार्यात्मक और वर्गीकरण संबंधी विविधता दोनों का विश्लेषण:
बीटा विविधता विश्लेषण
अंतर-समूह विश्लेषण
सहसंबंध विश्लेषण: पर्यावरणीय कारकों और बाहरी संरचना एवं विविधता के बीच
गैर-अनावश्यक जीन सेट वितरण:
जीन एनोटेशन: केईजीजी पाथवे
जीन एनोटेशन: eggNOG
जीन एनोटेशन: CAZY कार्बोहाइड्रेट
प्रजाति सहसंबंध नेटवर्क:
इस विशेष प्रकाशन के माध्यम से नैनोपोर + इलुमिना के साथ बीएमकेजीन की मेटाजेनोमिक्स अनुक्रमण सेवा द्वारा सुगम बनाई गई प्रगति का अन्वेषण करें:
जिन, एच. एट अल. (2023) 'इनर मंगोलियाई लोगों के मानव आंत माइक्रोबायोम का एक उच्च-गुणवत्ता वाला जीनोम संकलन', नेचर माइक्रोबायोलॉजी 2023 8:1, 8(1), पृ. 150–161. doi: 10.1038/s41564-022-01270-1.