पैकबियो पूर्ण-लंबाई ट्रांसक्रिप्टोम

PacBio फुल-लेंथ ट्रांसक्रिप्टोम सीक्वेंसिंग (Isoseq) ट्रांसक्रिप्ट आइसोफॉर्म की सटीक पहचान करने में सक्षम बनाती है, जिससे वैकल्पिक पॉलीएडेनाइलेशन और स्प्लिसिंग पर प्रकाश पड़ता है और जीन अभिव्यक्ति का अधिक सटीक विश्लेषण संभव होता है। BMKCloud PacBio फुल-लेंथ ट्रांसक्रिप्टोम पाइपलाइन को सर्कुलर कंसेंसस सीक्वेंसिंग (CCS) मोड में अनुक्रमित cDNA लाइब्रेरी का विश्लेषण करने और फुल-लेंथ नॉन-काइमेरिक (FLNC) अनुक्रमों की पहचान करने के लिए डिज़ाइन किया गया है, जिन्हें बाद में गैर-अनावश्यक ट्रांसक्रिप्ट में क्लस्टर किया जाता है। इसके बाद BUSCO विश्लेषण ट्रांसक्रिप्टोम असेंबली की पूर्णता का आकलन करता है। असेंबल किए गए ट्रांसक्रिप्टोम से कई विश्लेषण किए जाते हैं: वैकल्पिक स्प्लिसिंग, सरल अनुक्रम दोहराव (SSR), lncRNA और संबंधित लक्ष्य जीन का पूर्वानुमान, नए जीन का पूर्वानुमान, जीन परिवार विश्लेषण, ट्रांसक्रिप्शन कारक विश्लेषण और ट्रांसक्रिप्ट का कार्यात्मक एनोटेशन।