पूर्ण लंबाई वाले प्रतिलेख

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PACBIO फुल-लेंथ ट्रांसक्रिपटोम अनुक्रमण, ISOSEQ, ट्रांसक्रिप्ट आइसोफॉर्म की सटीक पहचान को सक्षम करता है, वैकल्पिक पॉलीडेनाइलेशन और स्प्लिसिंग पर प्रकाश बहाता है, और अधिक सटीक जीन अभिव्यक्ति विश्लेषण के लिए अग्रणी होता है। BMKCLOUD PACBIO फुल-लेंथ ट्रांसक्रिपटोम पाइपलाइन को परिपत्र सर्वसम्मति अनुक्रमण (CCS) मोड में अनुक्रमित सीडीएनए पुस्तकालयों का विश्लेषण करने के लिए डिज़ाइन किया गया है और पूर्ण-लंबाई गैर-चिमेरिक (FLNC) अनुक्रमों की पहचान करता है, जो तब गैर-निरर्थक लिपियों में क्लस्टर किए जाते हैं। एक बाद में Busco विश्लेषण ट्रांसक्रिपटोम असेंबली की पूर्णता का आकलन करता है। इकट्ठे ट्रांसक्रिपटोम से, कई विश्लेषण किए जाते हैं: वैकल्पिक splicing, सरल अनुक्रम दोहराने (SSR), lnCRNA की भविष्यवाणी और इसी लक्ष्य जीन, उपन्यास जीन की भविष्यवाणी, जीन परिवार विश्लेषण, प्रतिलेखन कारक विश्लेषण, और टेप के कार्यात्मक एनोटेशन।

 

बायोइनफॉरमैटिक्स

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