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क्रोमैटिन इम्यूनोप्रेसिपिटेशन सीक्वेंसिंग (चिप-सीक)
ChIP-Seq हिस्टोन संशोधन, प्रतिलेखन कारकों और अन्य डीएनए से जुड़े प्रोटीन के लिए डीएनए लक्ष्यों की जीनोम-वाइड प्रोफाइलिंग प्रदान करता है।यह विशिष्ट प्रोटीन-डीएनए कॉम्प्लेक्स को पुनर्प्राप्त करने के लिए क्रोमैटिन इम्यूनो-वर्षा (चिप) की चयनात्मकता को, पुनर्प्राप्त डीएनए के उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण के लिए अगली पीढ़ी के अनुक्रमण (एनजीएस) की शक्ति के साथ जोड़ती है।इसके अतिरिक्त, क्योंकि प्रोटीन-डीएनए कॉम्प्लेक्स जीवित कोशिकाओं से पुनर्प्राप्त होते हैं, बंधन स्थलों की तुलना विभिन्न प्रकार की कोशिकाओं और ऊतकों में या विभिन्न परिस्थितियों में की जा सकती है।अनुप्रयोग ट्रांसक्रिप्शनल विनियमन से लेकर विकासात्मक मार्गों से लेकर रोग तंत्र और उससे आगे तक होते हैं।
प्लेटफ़ॉर्म: इलुमिना नोवासेक प्लेटफ़ॉर्म
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संपूर्ण जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रमण
साइटोसिन (5-एमसी) में पांचवें स्थान पर डीएनए मिथाइलेशन का जीन अभिव्यक्ति और सेलुलर गतिविधि पर मौलिक प्रभाव पड़ता है।असामान्य मिथाइलेशन पैटर्न कैंसर जैसी कई स्थितियों और बीमारियों से जुड़े हुए हैं।WGBS एकल आधार रिज़ॉल्यूशन पर जीनोम-वाइड मिथाइलेशन का अध्ययन करने के लिए स्वर्ण मानक बन गया है।
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उच्च थ्रूपुट अनुक्रमण (एटीएसी-सीक्यू) के साथ ट्रांसपोज़ेज़-सुलभ क्रोमैटिन के लिए परख
ATAC-seq जीनोम-वाइड क्रोमैटिन पहुंच के विश्लेषण के लिए एक उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण विधि है, जो जीन अभिव्यक्ति के वैश्विक एपिजेनेटिक नियंत्रण के लिए महत्वपूर्ण है।हाइपरएक्टिव Tn5 ट्रांसपोज़ेज़ द्वारा अनुक्रमण एडेप्टर को खुले क्रोमैटिन क्षेत्रों में डाला जाता है।पीसीआर प्रवर्धन के बाद, एक अनुक्रमण पुस्तकालय का निर्माण किया जाता है।सभी खुले क्रोमैटिन क्षेत्रों को एक विशिष्ट स्थान-समय की स्थिति के तहत प्राप्त किया जा सकता है, न केवल प्रतिलेखन कारक की बाध्यकारी साइटों या एक निश्चित हिस्टोन संशोधित क्षेत्र तक सीमित है।
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कम प्रतिनिधित्व बिसल्फाइट अनुक्रमण (आरआरबीएस)
डीएनए मिथाइलेशन अनुसंधान हमेशा रोग अनुसंधान में एक गर्म विषय रहा है, और यह जीन अभिव्यक्ति और फेनो-टाइपिक लक्षणों से निकटता से संबंधित है।आरआरबीएस डीएनए मिथाइलेशन अनुसंधान के लिए एक सटीक, कुशल और किफायती तरीका है।एंजाइमैटिक क्लीवेज (एमएसपी I) द्वारा प्रमोटर और सीपीजी द्वीप क्षेत्रों का संवर्धन, बिसल्फ़ाइट अनुक्रमण के साथ मिलकर, उच्च रिज़ॉल्यूशन डीएनए मेथिलिकरण का पता लगाता है।
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