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प्रोकैरियोटिक आरएनए अनुक्रमण

प्रोकैरियोटिक आरएनए अनुक्रमण, बदलते सेलुलर ट्रांस्क्रिप्टोम का विश्लेषण करके, एक निश्चित समय पर आरएनए की उपस्थिति और मात्रा को प्रकट करने के लिए अगली पीढ़ी के अनुक्रमण (एनजीएस) का उपयोग करता है।हमारी कंपनी की प्रोकैरियोटिक आरएनए अनुक्रमण, विशेष रूप से संदर्भ जीनोम के साथ प्रोकैरियोट्स पर लक्षित है, जो आपको ट्रांसक्रिप्टोम प्रोफाइलिंग, जीन संरचना विश्लेषण आदि प्रदान करती है। इसे व्यापक रूप से बुनियादी विज्ञान अनुसंधान, दवा अनुसंधान और विकास, और बहुत कुछ में लागू किया गया है।

प्लेटफ़ॉर्म: इलुमिना नोवासेक प्लेटफ़ॉर्म


सेवा विवरण

सेवा विशिष्टताएँ

प्लेटफ़ॉर्म: इलुमिना नोवासेक प्लेटफ़ॉर्म, PE150

लाइब्रेरी प्रकार: 350bp सम्मिलित सीडीएनए लाइब्रेरी (पीक वितरण पर निर्भर करता है)

अनुक्रमण रणनीति: युग्मित-अंत 150 बीपी

अनुशंसित डेटा मात्रा: 2 जीबी कच्चा डेटा/नमूना

बायोइनफॉरमैटिक्स

(1) अनुक्रमण डेटा गुणवत्ता नियंत्रण: न्यूक्लियोटाइड वितरण, आधार गुणवत्ता वितरण, आरआरएनए अनुपात मूल्यांकन;

(2) अनुक्रम संरेखण विश्लेषण: संरेखण परिणाम आँकड़े, अनुक्रम की संतृप्ति, अनुक्रम की कवरेज;

(3) संदर्भ जीनोम एनोटेशन (एनआर, स्विस-प्रोट, पीएफएएम, सीओजी, जीओ, केईजीजी);

(4) अभिव्यक्ति विश्लेषण: अभिव्यक्ति वितरण (दो या अधिक नमूनों के साथ), नमूनों के बीच अभिव्यक्ति का विश्लेषण (वेन विश्लेषण, सहसंबंध विश्लेषण, पीसीए विश्लेषण);

(5) विभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषण (दो या दो से अधिक नमूनों के साथ);

(6) जीन सेट विश्लेषण: वेन विश्लेषण, क्लस्टर विश्लेषण, फ़ंक्शन एनोटेशन विश्लेषण (सीओजी, जीओ, केईजीजी), फ़ंक्शन संवर्धन विश्लेषण (जीओ, केईजीजी), फ़ंक्शन संवर्धन कॉर्डल ग्राफ, आईपैथ विश्लेषण;

(7) एसआरएनए विश्लेषण: एसआरएनए भविष्यवाणी, एसआरएनए एनोटेशन (ब्लास्ट, एसआरएनएमैप, एसआरएनएटारबेस, एसआईपीएचटी, आरएफएएम), एसआरएनए माध्यमिक संरचना भविष्यवाणी, एसआरएनए लक्ष्य जीन भविष्यवाणी;

(8) ट्रांसक्रिप्ट संरचना विश्लेषण: ऑपेरॉन विश्लेषण, ट्रांसक्रिप्शन प्रारंभ और अंत साइट भविष्यवाणी, यूटीआर एनोटेशन और विश्लेषण, प्रमोटर अनुक्रम भविष्यवाणी, एसएनपी/इनडेल विश्लेषण (एसएनपी/इनडेल एनोटेशन, एसएनपी/इनडेल क्षेत्रीय वितरण, एसएनपी सांख्यिकी)।

सेवा कार्य प्रवाह

नमूना वितरण

नमूना वितरण

पुस्तकालय की तैयारी

पुस्तकालय निर्माण

अनुक्रमण

अनुक्रमण

डेटा विश्लेषण

डेटा विश्लेषण

बिक्री के बाद सेवाएँ

बिक्री के बाद की सेवाएँ


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