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条形बैनर-03

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विशिष्ट-स्थान प्रवर्धित फ़्रैगमेंट अनुक्रमण (SLAF-Seq)

उच्च-थ्रूपुट जीनोटाइपिंग, विशेष रूप से बड़े पैमाने पर आबादी पर, आनुवंशिक संघ अध्ययन में एक मौलिक कदम है, जो कार्यात्मक जीन खोज, विकासवादी विश्लेषण आदि के लिए आनुवंशिक आधार प्रदान करता है। गहन संपूर्ण जीनोम पुन: अनुक्रमण के बजाय, कम प्रतिनिधित्व जीनोम अनुक्रमण (आरआरजीएस) ) आनुवंशिक मार्कर खोज पर उचित दक्षता बनाए रखते हुए, प्रति नमूना अनुक्रमण लागत को कम करने के लिए पेश किया गया है।यह आमतौर पर दिए गए आकार सीमा के भीतर प्रतिबंध खंड को निकालकर हासिल किया जाता है, जिसे कम प्रतिनिधित्व लाइब्रेरी (आरआरएल) नाम दिया गया है।विशिष्ट-स्थान प्रवर्धित खंड अनुक्रमण (SLAF-Seq) संदर्भ जीनोम के साथ या उसके बिना एसएनपी जीनोटाइपिंग के लिए एक स्व-विकसित रणनीति है।
प्लेटफ़ॉर्म: इलुमिना नोवासेक प्लेटफ़ॉर्म


सेवा विवरण

डेमो परिणाम

विशेष प्रकाशन

सेवा विवरण

तकनीकी योजना

111

कार्य प्रवाह

流程图

सेवा लाभ

उच्च मार्कर खोज दक्षता- उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण तकनीक पूरे जीनोम के भीतर सैकड़ों हजारों टैग खोजने में SLAF-Seq की सहायता करती है।

जीनोम पर कम निर्भरता- इसे संदर्भ जीनोम के साथ या उसके बिना प्रजातियों पर लागू किया जा सकता है।

लचीली योजना डिजाइन- एकल-एंजाइम, दोहरे-एंजाइम, बहु-एंजाइम पाचन और विभिन्न प्रकार के एंजाइम, सभी को विभिन्न अनुसंधान लक्ष्य या प्रजातियों को पूरा करने के लिए चुना जा सकता है।सिलिको में पूर्व-मूल्यांकन का उपयोग इष्टतम एंजाइम डिज़ाइन को सुनिश्चित करने के लिए किया जाता है।

कुशल एंजाइमैटिक पाचन- स्थितियों को अनुकूलित करने के लिए पूर्व-प्रयोग किया गया, जो औपचारिक प्रयोग को स्थिर और विश्वसनीय बनाता है।खंड संग्रह दक्षता 95% से अधिक प्राप्त कर सकती है।

समान रूप से वितरित एसएलएएफ टैग- एसएलएएफ टैग सभी गुणसूत्रों में सबसे बड़ी सीमा तक समान रूप से वितरित होते हैं, जिससे औसतन 1 एसएलएएफ प्रति 4 केबी प्राप्त होता है।

पुनरावृत्ति से प्रभावी बचाव- SLAF-Seq डेटा में दोहराव अनुक्रम 5% से कम हो गया है, विशेष रूप से उच्च स्तर की दोहराव वाली प्रजातियों में, जैसे गेहूं, मक्का, आदि।

विस्तृत अनुभव-पौधों, स्तनधारियों, पक्षियों, कीड़ों, जलीय जीवों आदि को कवर करने वाली सैकड़ों प्रजातियों पर 2000 से अधिक बंद SLAF-Seq परियोजनाएं।

स्व-विकसित जैव सूचनात्मक वर्कफ़्लो- अंतिम आउटपुट की विश्वसनीयता और सटीकता सुनिश्चित करने के लिए BMKGENE द्वारा SLAF-Seq के लिए एक एकीकृत जैव सूचनात्मक वर्कफ़्लो विकसित किया गया था।

 

सेवा विशिष्टताएँ

 

प्लैटफ़ॉर्म

सांद्र(एनजी/जीएल)

कुल (ug)

ओडी260/280

इलुमिना नोवासेक

>35

>1.6(खंड>15μl)

1.6-2.5

नोट: तीन नमूने, प्रत्येक तीन एंजाइम योजनाओं के साथ, पूर्व-प्रयोग के लिए प्रदर्शित किए जाएंगे।

अनुशंसित अनुक्रमण रणनीति

अनुक्रमण गहराई: 10X/टैग

जीनोम का आकार

अनुशंसित एसएलएएफ टैग

<500 एमबी

100K या WGS

500 एमबी- 1 जीबी

100 कि

1 जीबी -2 जीबी

200 कि

विशाल या जटिल जीनोम

300 - 400K

 

अनुप्रयोग

 

अनुशंसित

जनसंख्या पैमाना

 

अनुक्रमण रणनीति और गहराई

 

गहराई

 

टैग संख्या

 

जीडब्ल्यूएएस

 

नमूना संख्या ≥ 200

 

10X

 

 

 

 

 

के अनुसार

जीनोम का आकार

 

आनुवंशिक विकास

 

प्रत्येक के व्यक्ति

उपसमूह ≥ 10;

कुल नमूने ≥ 30

 

10X

 

अनुशंसित नमूना वितरण

कंटेनर: 2 मिली सेंट्रीफ्यूज ट्यूब

अधिकांश नमूनों के लिए, हम इथेनॉल में संरक्षित न करने की सलाह देते हैं।

नमूना लेबलिंग: नमूनों को स्पष्ट रूप से लेबल किया जाना चाहिए और सबमिट किए गए नमूना सूचना प्रपत्र के समान होना चाहिए।

शिपमेंट: सूखी बर्फ: नमूनों को पहले बैग में पैक करना होगा और सूखी बर्फ में दबाना होगा।

सेवा कार्यप्रवाह

नमूना QC
पायलट प्रयोग
एसएलएएफ प्रयोग
पुस्तकालय की तैयारी
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री के बाद सेवाएँ

नमूना QC

पायलट प्रयोग

एसएलएएफ-प्रयोग

पुस्तकालय की तैयारी

अनुक्रमण

डेटा विश्लेषण

बिक्री के बाद सेवाएँ


  • पहले का:
  • अगला:

  • 1. मानचित्र परिणाम के आँकड़े

    छवि 1

    ए 1

    2. एसएलएएफ मार्कर विकास

    ए2

    3. विविधता एनोटेशन

    ए3

    वर्ष

    पत्रिका

    IF

    शीर्षक

    अनुप्रयोग

    2022

    प्रकृति संचार

    17.694

    वृक्ष चपरासी के गीगा-गुणसूत्र और गीगा-जीनोम का जीनोमिक आधार

    पेओनिया ओस्टी

    SLAF-GWAS

    2015

    नये फाइटोलॉजिस्ट

    7.433

    घरेलूकरण के पदचिह्न कृषि संबंधी महत्व के जीनोमिक क्षेत्रों को स्थापित करते हैं

    सोयाबीन

    SLAF-GWAS

    2022

    उन्नत अनुसंधान जर्नल

    12.822

    जी. हिर्सुटम में गॉसिपियम बार्बडेंस का जीनोम-व्यापी कृत्रिम अंतर्मुखीकरण

    कपास फाइबर की गुणवत्ता और उपज में एक साथ सुधार के लिए बेहतर लोकी को प्रकट करें

    लक्षण

    एसएलएएफ-विकासवादी आनुवंशिकी

    2019

    आण्विक पौधा

    10.81

    जनसंख्या जीनोमिक विश्लेषण और डी नोवो असेंबली से वीडी की उत्पत्ति का पता चलता है

    चावल एक विकासवादी खेल के रूप में

    एसएलएएफ-विकासवादी आनुवंशिकी

    2019

    प्रकृति आनुवंशिकी

    31.616

    सामान्य कार्प, साइप्रिनस कार्पियो का जीनोम अनुक्रम और आनुवंशिक विविधता

    एसएलएएफ-लिंकेज मानचित्र

    2014

    प्रकृति आनुवंशिकी

    25.455

    खेती की गई मूंगफली का जीनोम फलियां कैरियोटाइप, पॉलीप्लोइड में अंतर्दृष्टि प्रदान करता है

    विकास और फसल वर्चस्व।

    एसएलएएफ-लिंकेज मानचित्र

    2022

    प्लांट बायोटेक्नोलॉजी जर्नल

    9.803

    एसटी1 की पहचान से बीज आकृति विज्ञान के हिचहाइकिंग से जुड़े चयन का पता चलता है

    और सोयाबीन के घरेलू उपयोग के दौरान तेल की मात्रा

    एसएलएएफ-मार्कर विकास

    2022

    आणविक विज्ञान के अंतर्राष्ट्रीय जर्नल

    6.208

    व्हीट-लेयमस मोलिस 2एन (2डी) के लिए पहचान और डीएनए मार्कर विकास

    डिसोमिक क्रोमोसोम प्रतिस्थापन

    एसएलएएफ-मार्कर विकास

    एक कहावत कहना

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