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फुल-लेंथ एमआरएनए सीक्वेंसिंग-नैनोपोर
आरएनए अनुक्रमण व्यापक प्रतिलेख विश्लेषण के लिए एक अमूल्य उपकरण रहा है।निस्संदेह, पारंपरिक शॉर्ट-रीड सीक्वेंसिंग ने यहां कई महत्वपूर्ण विकास हासिल किए।फिर भी, यह अक्सर पूर्ण-लंबाई वाली आइसोफॉर्म पहचान, परिमाणीकरण, पीसीआर पूर्वाग्रह में सीमाओं का सामना करता है।
नैनोपोर अनुक्रमण खुद को अन्य अनुक्रमण प्लेटफार्मों से अलग करता है, जिसमें न्यूक्लियोटाइड सीधे डीएनए संश्लेषण के बिना पढ़े जाते हैं और दसियों किलोबेस पर लंबे समय तक पढ़ा जाता है।यह सीधे रीड-आउट को पूर्ण-लंबाई वाले ट्रांसक्रिप्ट को पार करने और आइसोफॉर्म-स्तरीय अध्ययनों में चुनौतियों से निपटने का अधिकार देता है।
प्लैटफ़ॉर्ममैंनैनोपोर प्रोमेथियन
पुस्तकालय:सीडीएनए-पीसीआर
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डे नोवो फुल-लेंथ ट्रांसक्रिप्टोम सीक्वेंसिंग -PacBio
डे नोवोपूर्ण-लंबाई प्रतिलेख अनुक्रमण, जिसे के रूप में भी जाना जाता हैडे नोवोIso-Seq रीड लेंथ में PacBio सीक्वेंसर के फायदे लेता है, जो बिना किसी ब्रेक के फुल-लेंथ सीडीएनए अणुओं की सीक्वेंसिंग को सक्षम बनाता है।यह ट्रांसक्रिप्ट असेंबली चरणों में उत्पन्न किसी भी त्रुटि से पूरी तरह से बचा जाता है और आइसोफॉर्म-स्तरीय रिज़ॉल्यूशन के साथ यूनीजीन सेट का निर्माण करता है।यह स्वदेशी सेट प्रतिलेख-स्तर पर "संदर्भ जीनोम" के रूप में शक्तिशाली आनुवंशिक जानकारी प्रदान करता है।इसके अलावा, अगली पीढ़ी के अनुक्रमण डेटा के संयोजन से, यह सेवा आइसोफॉर्म-स्तरीय अभिव्यक्ति की सटीक मात्रा का निर्धारण करती है।
प्लेटफार्म: पैकबायो सीक्वल IIपुस्तकालय: एसएमआरटी घंटी पुस्तकालय -
यूकेरियोटिक एमआरएनए अनुक्रमण-इलुमिना
mRNA अनुक्रमण विशिष्ट परिस्थितियों में कोशिकाओं से प्रतिलेखित सभी mRNAs की रूपरेखा को सक्षम बनाता है।यह कुछ जैविक प्रक्रियाओं के जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइल, जीन संरचनाओं और आणविक तंत्र को प्रकट करने के लिए एक शक्तिशाली तकनीक है।आज तक, एमआरएनए अनुक्रमण को मौलिक अनुसंधान, नैदानिक निदान, दवा विकास, आदि में व्यापक रूप से नियोजित किया गया है।
प्लेटफार्म: इल्लुमिना नोवासेक 6000
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गैर-संदर्भ आधारित एमआरएनए अनुक्रमण-इलुमिना
एमआरएनए अनुक्रमण अगली पीढ़ी की अनुक्रमण तकनीक (एनजीएस) को अपनाता है ताकि विशिष्ट अवधि में मैसेंजर आरएनए (एमआरएनए) फॉर्म यूकेरियोट को कैप्चर किया जा सके जो कुछ विशेष कार्य सक्रिय कर रहे हैं।सबसे लंबी ट्रांसक्रिप्ट को 'यूनिजीन' कहा जाता था और बाद के विश्लेषण के लिए संदर्भ अनुक्रम के रूप में उपयोग किया जाता था, जो बिना संदर्भ के प्रजातियों के आणविक तंत्र और नियामक नेटवर्क का अध्ययन करने का एक प्रभावी साधन है।
ट्रांसक्रिप्टोम डेटा असेंबली और यूनीजीन फंक्शनल एनोटेशन के बाद
(1) एसएनपी विश्लेषण, एसएसआर विश्लेषण, सीडीएस भविष्यवाणी और जीन संरचना विकृत हो जाएगी।
(2) प्रत्येक नमूने में स्वदेशी अभिव्यक्ति की मात्रा का प्रदर्शन किया जाएगा।
(3) नमूनों (या समूहों) के बीच विभेदित रूप से व्यक्त स्वदेशी की खोज स्वदेशी अभिव्यक्ति के आधार पर की जाएगी
(4) विभेदित रूप से व्यक्त स्वदेशी का क्लस्टरिंग, कार्यात्मक एनोटेशन और संवर्धन विश्लेषण किया जाएगा
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लंबी गैर-कोडिंग अनुक्रमण-इलुमिना
लंबे गैर-कोडिंग आरएनए (lncRNAs) एक प्रकार के आरएनए अणु होते हैं जिनकी लंबाई 200 एनटी से अधिक होती है, जो बेहद कम कोडिंग क्षमता की विशेषता होती है।LncRNA, गैर-कोडिंग RNAs में एक प्रमुख सदस्य के रूप में, मुख्य रूप से नाभिक और प्लाज्मा में पाया जाता है।अनुक्रमण प्रौद्योगिकी और जैव सूचना विज्ञान में विकास कई उपन्यास lncRNAs की पहचान करने और उन्हें जैविक कार्यों के साथ जोड़ने में सक्षम बनाता है।संचयी साक्ष्य बताते हैं कि lncRNA व्यापक रूप से एपिजेनेटिक विनियमन, प्रतिलेखन विनियमन और पोस्ट-ट्रांसक्रिप्शन विनियमन में शामिल है।
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लघु आरएनए अनुक्रमण-इलुमिना
छोटा आरएनए गैर-कोडिंग आरएनए अणुओं के एक वर्ग को संदर्भित करता है जो आमतौर पर 200nt से कम लंबाई के होते हैं, जिसमें माइक्रो आरएनए (miRNA), छोटे हस्तक्षेप RNA (siRNA), और piwi- इंटरेक्टिंग RNA (piRNA) शामिल हैं।
MicroRNA (miRNA) अंतर्जात छोटे RNA का एक वर्ग है जिसकी लंबाई लगभग 20-24nt है, जो कोशिकाओं में विभिन्न प्रकार की महत्वपूर्ण नियामक भूमिकाएँ निभाती है।miRNA कई जीवन प्रक्रियाओं में शामिल है जो ऊतक - विशिष्ट और चरण - विशिष्ट अभिव्यक्ति को प्रकट करता है और विभिन्न प्रजातियों में अत्यधिक संरक्षित है।
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सर्केना अनुक्रमण-इलुमिना
संपूर्ण प्रतिलेख अनुक्रमण को सभी प्रकार के आरएनए अणुओं को प्रोफाइल करने के लिए डिज़ाइन किया गया है, जिसमें कोडिंग (एमआरएनए) और गैर-कोडिंग आरएनए (lncRNA, circRNA और miRNA सहित) शामिल हैं, जो एक निश्चित समय पर विशिष्ट कोशिकाओं द्वारा लिखित होते हैं।संपूर्ण प्रतिलेख अनुक्रमण, जिसे "कुल आरएनए अनुक्रमण" के रूप में भी जाना जाता है, का उद्देश्य प्रतिलेख स्तर पर व्यापक नियामक नेटवर्क का खुलासा करना है।एनजीएस प्रौद्योगिकी का लाभ उठाते हुए, सीईआरएनए विश्लेषण और संयुक्त आरएनए विश्लेषण के लिए संपूर्ण ट्रांसक्रिप्टोम उत्पादों के अनुक्रम उपलब्ध हैं, जो कार्यात्मक लक्षण वर्णन की दिशा में पहला कदम प्रदान करता है।सर्केना-miRNA-mRNA आधारित सीईआरएनए के नियामक नेटवर्क का खुलासा।
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संपूर्ण प्रतिलेख अनुक्रमण - इल्लुमिना
संपूर्ण प्रतिलेख अनुक्रमण को सभी प्रकार के आरएनए अणुओं को प्रोफाइल करने के लिए डिज़ाइन किया गया है, जिसमें कोडिंग (एमआरएनए) और गैर-कोडिंग आरएनए (lncRNA, circRNA और miRNA सहित) शामिल हैं, जो एक निश्चित समय पर विशिष्ट कोशिकाओं द्वारा लिखित होते हैं।संपूर्ण प्रतिलेख अनुक्रमण, जिसे "कुल आरएनए अनुक्रमण" के रूप में भी जाना जाता है, का उद्देश्य प्रतिलेख स्तर पर व्यापक नियामक नेटवर्क का खुलासा करना है।एनजीएस प्रौद्योगिकी का लाभ उठाते हुए, सीईआरएनए विश्लेषण और संयुक्त आरएनए विश्लेषण के लिए संपूर्ण ट्रांसक्रिप्टोम उत्पादों के अनुक्रम उपलब्ध हैं, जो कार्यात्मक लक्षण वर्णन की दिशा में पहला कदम प्रदान करता है।सर्केना-miRNA-mRNA आधारित सीईआरएनए के नियामक नेटवर्क का खुलासा।
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प्रोकैरियोटिक आरएनए अनुक्रमण
प्रोकैरियोटिक आरएनए अनुक्रमण अगली पीढ़ी के अनुक्रमण (एनजीएस) का उपयोग करता है, जो एक निश्चित क्षण में आरएनए की उपस्थिति और मात्रा को प्रकट करने के लिए, बदलते सेलुलर प्रतिलेख का विश्लेषण करके प्रकट करता है।हमारी कंपनी का प्रोकैरियोटिक आरएनए अनुक्रमण, विशेष रूप से संदर्भ जीनोम के साथ प्रोकैरियोट्स पर लक्षित है, जो आपको ट्रांसक्रिप्टोम प्रोफाइलिंग, जीन संरचना विश्लेषण आदि प्रदान करता है। इसे व्यापक रूप से बुनियादी विज्ञान अनुसंधान, दवा अनुसंधान और विकास, और बहुत कुछ के लिए लागू किया गया है।
प्लेटफार्म: इल्लुमिना नोवासेक 6000
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मेटाट्रेनस्क्रिप्टोम सीक्वेंसिंग
मेटाट्रेनस्क्रिप्टोम अनुक्रमण प्राकृतिक वातावरण (यानी मिट्टी, पानी, समुद्र, मल और आंत) के भीतर रोगाणुओं (यूकेरियोट्स और प्रोकैरियोट्स दोनों) की जीन अभिव्यक्ति की पहचान करता है। विशेष रूप से, यह सेवाएं आपको जटिल माइक्रोबियल समुदायों की संपूर्ण जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइलिंग, टैक्सोनोमिक विश्लेषण प्राप्त करने की अनुमति देती हैं। प्रजातियों की संख्या, अलग-अलग व्यक्त जीनों का कार्यात्मक संवर्धन विश्लेषण, और बहुत कुछ।
प्लेटफार्म: इल्लुमिना नोवासेक 6000
