संपूर्ण जीनोम बाइसल्फाइट अनुक्रमण (WGBS)
यह तकनीक, डीएनए के बाइसल्फाइट उपचार पर आधारित है, जो मिथाइलेटेड साइटोसिन को अपरिवर्तित रखते हुए अनमेथिलेटेड साइटोसिन को यूरेसिल (सी से यू) में परिवर्तित करती है। यह तकनीक, डीएनए मिथाइलेशन के गहन अन्वेषण के लिए स्वर्ण-मानक पद्धति के रूप में खड़ी है, विशेष रूप से साइटोसिन (5-एमसी) में पांचवें स्थान के लिए, जो जीन अभिव्यक्ति और सेलुलर गतिविधि का एक महत्वपूर्ण नियामक है।
यह तकनीक एकल-आधार विभेदन प्रदान करती है, जिससे शोधकर्ता मेथिलोम की व्यापक जाँच कर सकते हैं और नमूनों में असामान्य मेथिलीकरण पैटर्न का पता लगा सकते हैं। WGBS का उपयोग करके, वैज्ञानिक जीनोम-व्यापी मेथिलीकरण परिदृश्यों में अद्वितीय अंतर्दृष्टि प्राप्त कर सकते हैं, जिससे विविध जैविक प्रक्रियाओं और रोगों के मूल में स्थित एपिजेनेटिक तंत्रों की सूक्ष्म समझ प्राप्त होती है।
सेवा सुविधाएँ
● इल्लुमिना नोवासेक पर अनुक्रमण।
● संदर्भ जीनोम की आवश्यकता है।
● बाइसल्फाइट रूपांतरण दक्षता की निगरानी के लिए लैम्ब्डा डीएनए मिलाया जाता है।
सेवा लाभ
●डीएनए मिथाइलेशन अनुसंधान के लिए स्वर्ण मानक: इस परिपक्व प्रौद्योगिकी में उच्च सटीकता और अच्छी पुनरुत्पादकता है।
●विस्तृत कवरेज और एकल-आधार रिज़ॉल्यूशन:मिथाइलेशन स्थलों का पता जीनोम-व्यापी स्तर पर लगाया जाता है।
●संपूर्ण प्लेटफ़ॉर्म:हम नमूना प्रसंस्करण, लाइब्रेरी निर्माण, अनुक्रमण से लेकर जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण तक वन-स्टॉप सेवा प्रदान करते हैं।
●व्यापक विशेषज्ञताहमारे पास विविध प्रजातियों पर पूरी की गई परियोजनाओं का एक विस्तृत दायरा है। BMKGENE अपने साथ एक दशक से भी ज़्यादा का अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टीम, व्यापक सामग्री और उत्कृष्ट बिक्री-पश्चात सहायता लेकर आता है।
●ट्रांसक्रिप्टोमिक्स विश्लेषण के साथ जुड़ने की संभावना: RNA-seq जैसे अन्य ओमिक्स डेटा के साथ WGBS के एकीकृत विश्लेषण की अनुमति देना।
नमूना विनिर्देश
| पुस्तकालय | अनुक्रमण रणनीति | अनुशंसित डेटा आउटपुट | गुणवत्ता नियंत्रण |
| बाइसल्फाइट उपचारित | इल्लुमिना PE150 | 30x गहराई | Q30 ≥ 85% बाइसल्फाइट रूपांतरण > 99% |
नमूना आवश्यकताएँ
| सांद्रता (एनजी/µL) | कुल मात्रा (µg) | अतिरिक्त जरूरतें | |
| जीनोमिक डीएनए | ≥ 5 | ≥ 400 एनजी | सीमित क्षरण या संदूषण |
सेवा कार्य प्रवाह
नमूना वितरण
डीएनए निष्कर्षण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
डेटा वितरण
इस सेवा में निम्नलिखित विश्लेषण शामिल हैं:
● कच्चे अनुक्रमण गुणवत्ता नियंत्रण;
● संदर्भ जीनोम का मानचित्रण;
● 5mC मिथाइलेटेड बेस का पता लगाना;
● मिथाइलेशन वितरण और एनोटेशन का विश्लेषण;
● विभेदक मिथाइलेटेड क्षेत्रों (डीएमआर) का विश्लेषण;
● डीएमआर से जुड़े जीनों का कार्यात्मक एनोटेशन।
5mC मिथाइलेशन का पता लगाना: मिथाइलेटेड साइटों के प्रकार
मिथाइलेशन मानचित्र. 5mC मिथाइलेशन जीनोम-व्यापी वितरण
अत्यधिक मिथाइलेटेड क्षेत्रों का एनोटेशन
विभेदित मिथाइलेटेड क्षेत्र: संबद्ध जीन
विभेदित मिथाइलेटेड क्षेत्र: संबद्ध जीनों का एनोटेशन (जीन ऑन्टोलॉजी)
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फैन, वाई. एट अल. (2020) 'संपूर्ण जीनोम बाइसल्फाइट अनुक्रमण का उपयोग करके भेड़ के कंकाल की मांसपेशियों के विकास के दौरान डीएनए मिथाइलेशन प्रोफाइल का विश्लेषण',बीएमसी जीनोमिक्स, 21(1), पृ. 1-15. डीओआई: 10.1186/एस12864-020-6751-5।
झाओ, एक्स. एट अल. (2022) 'विनाइल क्लोराइड के संपर्क में आने वाले श्रमिकों में नवीन डीऑक्सीराइबोन्यूक्लिक एसिड मिथाइलेशन गड़बड़ी',विष विज्ञान और औद्योगिक स्वास्थ्य, 38(7), पृ. 377-388. डीओआई: 10.1177/07482337221098600
ज़ुओ, जे. एट अल. (2020) 'पकते टमाटर के फल में जीनोम मिथाइलेशन, नॉन-कोडिंग आरएनए, एमआरएनए और मेटाबोलाइट्स के स्तर के बीच संबंध',प्लांट जर्नल, 103(3), पीपी 980-994। डीओआई: 10.1111/टीपीजे.14778।
