संपूर्ण जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रमण (डब्ल्यूजीबीएस)
यह तकनीक, जो डीएनए के बिसल्फाइट उपचार पर आधारित है, जिससे अनमेथिलेटेड साइटोसिन को यूरेसिल (सी से यू) में परिवर्तित किया जाता है, जबकि मेथिलेटेड साइटोसिन अपरिवर्तित रहते हैं, डीएनए मेथिलेशन, विशेष रूप से साइटोसिन में पांचवें स्थान (5-एमसी) के गहन अध्ययन के लिए स्वर्ण-मानक पद्धति के रूप में स्थापित है, जो जीन अभिव्यक्ति और सेलुलर गतिविधि का एक महत्वपूर्ण नियामक है।
यह तकनीक एकल-आधार रिज़ॉल्यूशन प्रदान करती है, जिससे शोधकर्ताओं को मिथाइलोम का व्यापक रूप से अध्ययन करने और नमूनों में असामान्य मिथाइलेशन पैटर्न का पता लगाने में मदद मिलती है। डब्ल्यूजीबीएस का उपयोग करके, वैज्ञानिक जीनोम-व्यापी मिथाइलेशन परिदृश्यों में अभूतपूर्व अंतर्दृष्टि प्राप्त कर सकते हैं, जिससे विभिन्न जैविक प्रक्रियाओं और रोगों के अंतर्निहित एपिजेनेटिक तंत्रों की सूक्ष्म समझ प्राप्त होती है।
सेवा सुविधाएँ
● इलुमिना नोवासेक पर सीक्वेंसिंग।
● इसके लिए एक संदर्भ जीनोम की आवश्यकता होती है।
● बाइसल्फाइट रूपांतरण दक्षता की निगरानी के लिए लैम्डा डीएनए मिलाया जाता है।
सेवा के लाभ
●डीएनए मेथाइलेशन अनुसंधान के लिए स्वर्ण मानकयह परिपक्व तकनीक उच्च सटीकता और अच्छी पुनरुत्पादकता प्रदान करती है।
●व्यापक कवरेज और सिंगल-बेस रिज़ॉल्यूशन:मेथिलेशन स्थलों का पता लगाना जीनोम-व्यापी स्तर पर किया जाता है।
●संपूर्ण प्लेटफ़ॉर्म:हम सैंपल प्रोसेसिंग, लाइब्रेरी निर्माण, सीक्वेंसिंग से लेकर बायोइन्फॉर्मेटिक्स विश्लेषण तक की वन-स्टॉप सेवा प्रदान करते हैं।
●व्यापक विशेषज्ञताहमने विभिन्न प्रजातियों पर कई परियोजनाएं सफलतापूर्वक पूरी की हैं। बीएमकेजीन के पास एक दशक से अधिक का अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टीम, व्यापक सामग्री और उत्कृष्ट बिक्रीोत्तर सहायता उपलब्ध है।
●ट्रांसक्रिप्टोमिक्स विश्लेषण के साथ जुड़ने की संभावना: डब्ल्यूजीबीएस का आरएनए-सीक्वेंसिंग जैसे अन्य ओमिक्स डेटा के साथ एकीकृत विश्लेषण करने की अनुमति देना।
नमूना विनिर्देश
| पुस्तकालय | अनुक्रमण रणनीति | अनुशंसित डेटा आउटपुट | गुणवत्ता नियंत्रण |
| बिसल्फाइट उपचारित | इलुमिना PE150 | 30 गुना गहराई | Q30 ≥ 85% बाइसल्फाइट रूपांतरण > 99% |
नमूना आवश्यकताएँ
| सांद्रता (एनजी/µएल) | कुल राशि (एनजी) | अतिरिक्त जरूरतें | |
| जीनोमिक डीएनए | ≥ 1.25 | ≥ 100 | सीमित क्षरण या संदूषण |
सेवा कार्य प्रवाह
नमूना वितरण
डीएनए निष्कर्षण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
डेटा वितरण
इस सेवा में निम्नलिखित विश्लेषण शामिल हैं:
● रॉ सीक्वेंसिंग गुणवत्ता नियंत्रण;
● संदर्भ जीनोम से मैपिंग;
● 5mC मिथाइलेटेड बेस का पता लगाना;
● मेथाइलेशन वितरण और एनोटेशन का विश्लेषण;
● विभेदक रूप से मिथाइलेटेड क्षेत्रों (डीएमआर) का विश्लेषण;
● डीएमआर से जुड़े जीनों का कार्यात्मक एनोटेशन।
5mC मेथाइलेशन का पता लगाना: मेथाइलेटेड साइट्स के प्रकार
मेथिलेशन मानचित्र। 5mC मेथिलेशन का जीनोम-व्यापी वितरण
अत्यधिक मिथाइलेटेड क्षेत्रों का एनोटेशन
भिन्न-भिन्न मिथाइलेटेड क्षेत्र: संबंधित जीन
भिन्न-भिन्न मिथाइलेटेड क्षेत्र: संबंधित जीनों का एनोटेशन (जीन ओन्टोलॉजी)
बीएमकेजीन की संपूर्ण जीनोम बिस्सल्फाइट अनुक्रमण सेवाओं द्वारा सुगम बनाए गए अनुसंधान संबंधी प्रगति का पता लगाने के लिए प्रकाशनों के एक सुनियोजित संग्रह का उपयोग करें।
फैन, वाई. एट अल. (2020) 'भेड़ की कंकाल मांसपेशी के विकास के दौरान डीएनए मेथाइलेशन प्रोफाइल का संपूर्ण जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रमण का उपयोग करके विश्लेषण'बीएमसी जीनोमिक्स, 21(1), पृ. 1-15. डीओआई: 10.1186/एस12864-020-6751-5।
झाओ, एक्स. एट अल. (2022) 'विनाइल क्लोराइड के संपर्क में आने वाले श्रमिकों में नवीन डीऑक्सीराइबोन्यूक्लिक एसिड मेथाइलेशन गड़बड़ी'विष विज्ञान और औद्योगिक स्वास्थ्य, 38(7), पृ. 377-388. डीओआई: 10.1177/07482337221098600
ज़ुओ, जे. एट अल. (2020) 'पके टमाटर के फल में जीनोम मेथाइलेशन, नॉन-कोडिंग आरएनए, एमआरएनए और मेटाबोलाइट्स के स्तर के बीच संबंध'द प्लांट जर्नल, 103(3), पीपी 980-994। डीओआई: 10.1111/टीपीजे.14778।
