Kev Tshawb Fawb Txog Metagenomics (NGS)

Shotgun metagenomics nrog Illumina yog ib qho cuab yeej nrov rau kev kawm microbiomes los ntawm kev ncaj qha sequencing DNA los ntawm cov qauv nyuaj, ua rau kev kawm txog ob qho tib si taxonomic thiab kev ua haujlwm sib txawv. Lub BMKCloud metagenomic (NGS) pipeline pib nrog kev tswj hwm zoo thiab metagenome sib dhos, los ntawm cov noob caj noob ces raug kwv yees thiab clustered rau hauv cov ntaub ntawv tsis-redundant uas tau annotated rau kev ua haujlwm thiab taxonomy siv ntau lub database. Cov ntaub ntawv no yog siv los tshuaj xyuas hauv-qauv taxonomic ntau haiv neeg (alpha ntau haiv neeg) thiab ntawm-qauv ntau haiv neeg (beta ntau haiv neeg). Kev tshuaj xyuas sib txawv ntawm cov pab pawg pom OTUs thiab biological functions uas txawv ntawm ob pab pawg siv ob qho tib si parametric thiab non-parametric kev xeem, thaum kev sib raug zoo tshuaj xyuas txuas cov kev sib txawv no rau cov yam ntxwv ib puag ncig.