Bakterijski i gljivični cijeli genom ponovno sekvenciranje
Projekti ponovnog sekvenciranja bakterijskih i gljivičnih genoma ključni su za unapređenje mikrobne genomike omogućavajući završetak i usporedbu mikrobnih genoma. To olakšava inženjering fermentacije, optimizaciju industrijskih procesa i istraživanje sekundarnih metabolizma. Nadalje, ponovno sekvenciranje gljivice i bakterija ključno je za razumijevanje prilagodbe okoliša, optimizaciju sojeva i otkrivanje dinamike genetske evolucije, s širokim implikacijama na medicinu, poljoprivredu i znanost o okolišu.
Prednosti usluge
●Bioinformatička analiza uključuje pozivanje varijante:Pružanje funkcionalnih uvida u genome koji se ponovno sekfeniraju.
● opsežna stručnost: S tisućama projekata ponovnog sekvenciranja mikroba koji se provode godišnje, donosimo desetljeće iskustva, visoko kvalificiranog tima za analizu, sveobuhvatan sadržaj i izvrsnu podršku nakon prodaje.
●Podrška nakon prodaje:Naša predanost proteže se izvan završetka projekta s 3-mjesečnom razdoblju nakon prodaje. Za to vrijeme nudimo praćenje projekta, pomoć u rješavanju problema i Q&A sjednice za rješavanje bilo kakvih upita vezanih za rezultate.
Specifikacije usluge
| Platforma za sekvenciranje | Strategija sekvenciranja | Podaci preporučeni | Kontrola kvalitete |
| Illumina Novaseq | PE150 | Dubina od 100x | Q30≥85% |
Zahtjevi za uzorkovanje
| Koncentracija (ng/µL) | Ukupni iznos (NG) | Volumen (µl) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakterije: ≥1x107 stanice
Jednoćelijske gljive: ≥5x106-1x107 stanice
Makro gljivice: ≥4g
Servisni rad protoka
Dostava uzorka
Konstrukcija knjižnice
Sekvenciranje
Analiza podataka
Usluge nakon prodaje
Uključuje sljedeću analizu:
- Slijed kontrole kvalitete podataka
- Usklađivanje s referentnim genomskom
- Varijanta poziva: SNP i Indel
- Varijanta napomena
Varijanta poziva: SNP tipovi
Varijanta poziva: raspodjela duljine insela
Istražite napredovanje koje je BMKGENE-ove mikrobne usluge ponovnog sekvenciranja genoma BMKGENE kroz kuriranu zbirku publikacija.
Jia, Y. i sur. (2023.) 'Kombinacija transkripta i čitavog genoma ponovno sekvenciranje na gene otpornosti na zaslon za patuljak pšenice',Međunarodni časopis za molekularne znanosti, 24 (24). doi: 10.3390/ijms242417356.
Jiang, M. i sur. (2023.) 'Metabolizam glukoze pod nadzorom ampicilina manipulira prijelazom iz tolerancije na otpornost u bakterijama',Napredak znanosti, 9 (10). doi: 10.1126/sciadv.ade8582/suppl_file/sciadv.ade8582_sm.pdf.
Yang, M. i sur. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. studeni, haloalkaliphilna bakterija izolirana iz jezera soda u unutarnjoj Mongolijinoj autonomnoj regiji, Kina ', int. J. Syst. Evol.Mikrobiol, 72, str. 5263. Doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. i Wang, G.-H. (2024) 'Slijed genoma Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, izoliran od Nasonia vitripennis',Najave o mikrobiološkim resursima. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
