BMKCloud Log in
条形banner-03

Proizvodi

Illumina i BGI

Illumina tehnologija sekvenciranja, temeljena na Sekvenciranju putem sinteze (SBS), globalno je prihvaćena NGS inovacija, odgovorna za generiranje preko 90% svjetskih podataka sekvenciranja.Načelo SBS-a uključuje snimanje fluorescentno obilježenih reverzibilnih terminatora kako se svaki dNTP dodaje, a potom cijepa kako bi se omogućila ugradnja sljedeće baze.Sa sva četiri reverzibilna dNTP vezana za terminator prisutna u svakom ciklusu sekvenciranja, prirodna kompeticija smanjuje pristranost inkorporacije.Ova svestrana tehnologija podržava i biblioteke s jednim čitanjem i biblioteke s uparenim krajem, opskrbljujući niz genomskih aplikacija.Mogućnosti Illumina sekvenciranja visoke propusnosti i preciznost postavljaju ga kao kamen temeljac u istraživanju genomike, osnažujući znanstvenike da razotkriju zamršenost genoma s neusporedivim detaljima i učinkovitošću.

DNBSEQ, koju je razvio BGI, još je jedna inovativna NGS tehnologija koja je uspjela dodatno smanjiti troškove sekvenciranja i povećati propusnost.Priprema DNBSEQ biblioteka uključuje fragmentaciju DNK, pripremu ssDNK i amplifikaciju u krugu kako bi se dobile DNK nanokuglice (DNB).Oni se zatim učitavaju na čvrstu površinu i potom sekvenciraju kombinatornom sintezom sonde-sidra (cPAS).

Naša unaprijed napravljena usluga sekvenciranja biblioteka olakšava korisnicima pripremu njihovih biblioteka sekvenciranja iz različitih izvora (mRNA, cijeli genom, amplikon, između ostalog).Naknadno se te biblioteke mogu poslati u naše centre za sekvenciranje radi kontrole kvalitete i sekvenciranja na platformama Illumina ili BGI.


Pojedinosti usluge

Demo rezultat

Značajke

Platforme:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten i BGI-DNB-T7

Načini sekvenciranja:PE50, PE100, PE150, PE250

Kontrola kvalitete knjižnica prije sekvenciranja

Sekvenciranje isporuke podataka i kontrole kvalitete:isporuka QC izvješća i neobrađenih podataka u fastq formatu nakon demultipleksiranja i filtriranja Q30 čitanja.

 

Prednosti usluge

Svestranost usluga sekvenciranja:kupac može odabrati redoslijed po stazi, protočnoj ćeliji ili količini podataka.

Svestranost platformi:DNB biblioteke mogu se prenijeti na Illumina platforme

Veliko iskustvo na Illumina platformi za sekvenciranje:s tisućama zatvorenih projekata s raznim vrstama. 

Dostava QC izvješća o sekvenciranju:s metrikom kvalitete, točnosti podataka i cjelokupnom izvedbom projekta sekvenciranja.

Proces zrelog sekvenciranja:s kratkim vremenom obrade.

Rigorozna kontrola kvalitete: provodimo stroge QC zahtjeve kako bismo jamčili isporuku dosljedno visokokvalitetnih rezultata.

Zahtjevi za uzorke*

Djelomično slijed traka

Količina podataka (X)

Koncentracija (qPCR/nM)

Volumen

X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 20 μl

50 Gb ≤ X < 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 20 μl

X ≥ 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 20 μl

Jedna traka (Illumina)

Platforma

Koncentracija (qPCR/nM)

Volumen

HiSeq X Ten

≥ 2 nM

≥ 20 μl

NovaSeq 6000 SP

≥ 1 nM

≥ 25 μl

NovaSeq 6000 S4

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

NovaSeq X

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

BGI-DNBSEQ-T7

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

 Uz koncentraciju i ukupnu količinu, također je potreban odgovarajući uzorak vrha.

 

Obratite nam se ako vaši uzorci ne ispunjavaju zahtjeve za početni materijal.

Tijek rada usluge

priprema uzorka

Kontrola kvalitete knjižnice

Sekvenciranje

Sekvenciranje

Analiza podataka

Kontrola kvalitete podataka

Uzorak QC

Isporuka projekta


  • Prethodna:
  • Sljedeći:

  • Knjižnica QC izvješće

    Izvješće o kvaliteti knjižnice daje se prije sekvenciranja, procjene količine knjižnice i fragmentacije.

     

    Izvješće o sekvenciranju QC-a

     

    Tablica 1. Statistika podataka sekvenciranja.

    ID uzorka

    BMKID

    Raw čita

    Neobrađeni podaci (bp)

    Čista čitanja (%)

    Q20 (%)

    Q30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6.861.036.000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14,717,867

    4,415,360,100

    96,00

    98.95

    93.89

    37.08

    Slika 1. Distribucija kvalitete duž očitavanja u svakom uzorku

    A9

    Slika 2. Distribucija osnovnog sadržaja

    A10

    Slika 3. Distribucija pročitanih sadržaja u podacima sekvenciranja

    A11

     

    dobiti citat

    Ovdje napišite svoju poruku i pošaljite nam je

    Pošaljite nam svoju poruku: