Proizvodi

Genom gljiva

Biomarker Technologies omogućuje pregled genoma, fini genom i potpuni genom gljivica ovisno o specifičnom cilju istraživanja.Sekvenciranje genoma, sastavljanje i funkcionalna anotacija mogu se postići kombinacijom sekvenciranja sljedeće generacije + sekvenciranja treće generacije kako bi se postigla sekvencija genoma na visokoj razini.Hi-C tehnologija također se može koristiti za olakšavanje sastavljanja genoma na razini kromosoma.

Platforma:PacBio nastavak II

Nanopore PromethION P48

Platforma Illumina NovaSeq

Kontaktirajte nas

Pojedinosti usluge

Demo rezultati

Prednosti usluge

● Dostupne su višestruke strategije sekvenciranja za različite istraživačke ciljeve

● Veliko iskustvo u sastavljanju genoma gljiva s više od 10 000 sastavljenih genoma s kompletnim penom.

● Profesionalni tim za tehničku podršku nakon prodaje koji ispunjava specifične potrebe istraživanja.

Specifikacije usluge

Servis	Strategija sekvenciranja	Kvaliteta zajamčena	Procijenjeno vrijeme obrade
Fina karta gljiva	Illumina 50X+Nanopore 100X	Contig N50≥2 Mb	35 radnih dana
Fina karta gljiva	PacBio HiFi 30X	Contig N50≥2 Mb	35 radnih dana
Kompletna karta gljivične pene	Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X	Omjer usidrenosti kromosoma >90%	45 radnih dana

Bioinformatičke analize

● Kontrola kvalitete neobrađenih podataka

● Sklapanje genoma

● Analiza komponenti genoma

● Napomena o funkciji gena

● Usporedna genomska analiza

Zahtjevi za uzorke i isporuka

Zahtjevi za uzorke:

ZaDNK ekstrakti:

Vrsta uzorka	Iznos	Koncentracija	Čistoća
DNK ekstrakti	> 1,2 μg	> 20 ng/μl	OD260/280= 1,6-2,5

Za uzorke tkiva:

Vrsta uzorka

Preporučena obrada uzorka

Skladištenje i otprema uzoraka

Jednostanična gljiva

Promatrajte kvasac pod mikroskopom i sakupite ga u eksponencijalnoj fazi

Prenesite kulturu (koja sadrži približno 3-4,5e9 stanica) u eppendorf od 1,5 ili 2 ml.(Zadrži na ledu)

Centrifugirajte epruvetu 1 minutu na 14000 g da prikupite bakterije i pažljivo uklonite supernatant

Zatvorite epruvetu i zamrznite bakterije u tekućem dušiku najmanje 1-3 h.Čuvajte tubu u hladnjaku na -80 ℃.

Zamrznite uzorke u tekućem dušiku 3-4 sata i pohranite u tekućem dušiku ili -80 stupnjeva za dugotrajnu rezervaciju.Potrebna je otprema uzorka sa suhim ledom.

Makro gljiva

Preporuča se tkivo u fazi aktivnog rasta.

Isperite tkivo vodom bez endotoksina, zatim 70% etonalom.

Spremite uzorak u krioepruvete.