● Iscrpljivanje rRNA, a slijedila je priprema biblioteke s usmjerenom mRNA.
● Sekvenciranje na Illumina Novaseq.
●Proučite promjene složenih mikrobnih zajednica:To se događa na transkripcijskoj razini i istražuju potencijalne nove gene.
●Objašnjenje interakcije mikrobne zajednice s domaćinom ili okolinom.
●Sveobuhvatna bioinformatička analiza: To pruža uvid u taksonomske i funkcionalne sastave zajednice, kao i analizu diferencijalne ekspresije gena.
●Opsežna napomena gena:Korištenje ažurnih baza podataka o funkciji gena za informacije o ekspresiji gena u mikrobnim zajednicama.
●Podrška nakon prodaje:Naša predanost proteže se izvan završetka projekta s 3-mjesečnom razdoblju nakon prodaje. Za to vrijeme nudimo praćenje projekta, pomoć u rješavanju problema i Q&A sjednice za rješavanje bilo kakvih upita vezanih za rezultate.
Platforma za sekvenciranje | Strategija sekvenciranja | Podaci preporučeni | Kontrola kvalitete podataka |
Illumina Novaseq | PE150 | 12 gb | Q30≥85% |
Koncentracija (ng/µL) | Ukupna količina (µg) | Volumen (µl) | OD260/280 | OD260/230 | Rinina |
≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6,5 |
Uključuje sljedeću analizu:
● Kontrola kvalitete sekvenciranja podataka
● sklop transkripta
● Taksonomska napomena i obilje
● Funkcionalna napomena i obilje
● Kvantifikacija ekspresije i diferencijalna analiza
Taksonomska raspodjela svakog uzorka:
Analiza beta raznolikosti: UPGMA
Funkcionalna napomena - Idite obilno
Obilje diferencijalne taksonomije - lefse
Istražite napredovanje koje je omogućilo BMKGENE -ove usluge sekvenciranja meta -transkriptomike putem kurirane zbirke publikacija.
Lu, Z. i sur. (2023.) 'Tolerancija na kiselinu bakterija koje iskorištavaju laktat reda bakteroidali doprinose prevenciji ruminske acidoze kod koza prilagođene visokokoncentracijskoj prehrani',Prehrana životinja, 14, str. 130–140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
Pjesma, Z. i sur. (2017) 'Otkrivanje jezgre funkcionalne mikrobiote u tradicionalnoj fermentaciji čvrstog stanja visokim propusnim amplikonima i sekvenciranjem metatranscricrictcricts',Granice u mikrobiologiji, 8 (srpanj). doi: 10.3389/fMicb.2017.01294/puni.
Wang, W. i sur. (2022.) 'Novi mikovirusi otkriveni iz istraživanja metatranscricricrict -a o fitopatogenoj gljivici Alternaria',Virusi, 14 (11), str. 2552. doi: 10.3390/v14112552/s1.
Wei, J. i sur. (2022) 'Paralelna analiza metatranskripcije otkriva degradaciju biljnih sekundarnih metabolita bubama i njihovim simbiontima crijeva',Molekularni Ekologija, 31 (15), str. 3999–4016. doi: 10.1111/mec.16557.