Bisulfitno sekvenciranje cijelog genoma
Prednosti usluge
● Kompletna platforma: pružanje izvrsne usluge na jednom mjestu od obrade uzoraka, izgradnje knjižnice, sekvenciranja do bioinformatičke analize.
● Visoka točnost: zrela tehnologija obrade pretvorbe metilacije može točno analizirati status metilacije jedne C baze.
● Široka pokrivenost: detekcija metilacijskih mjesta na razini cijelog genoma.
● Dobra ponovljivost: stabilna obrada, pogodna za komparativnu analizu među više uzoraka.
Uzorak specifikacija
|
Platforma
|
Čitaj duljinu
|
Strategija sekvenciranja
|
| Illumina | PE 150 | 30X, tri biološke replike, s visokokvalitetnim referentnim genomom |
Zahtjevi za uzorke
|
Vrsta uzorka
|
Količina (μg)
|
Konc.(ng/μl)
|
Volumen (μl)
|
Čistoća
|
| gDNA | ≥ 2 | ≥ 20
| ≥ 20
| Ograničena razgradnja i kontaminacija
|
Tijek rada usluge
Dostava uzoraka
ekstrakcija DNK
Izgradnja knjižnice
Sekvenciranje
Analiza podataka
Dostava podataka
Bioinformatika
1.Distribucija metilacije DNA u cijelom genomu
2. Napomena o visoko metiliranoj CGI regiji
