BMKCloud Log in
条形banner-03

Pwodwi yo

Sekans ADN/RNA - Nanopore Sequencer

ONT sekans se yon sèl molekil an tan reyèl teknoloji sekans siyal elektrik ki baze sou nanopor, prensip sekans chak platfòm se menm bagay la.Double-cheche DNA/RNA pral mare nan pwoteyin nanoporous entegre nan biofilm a ak dewoulman anba plon an nan pwoteyin motè, anba aksyon an nan diferans vòltaj soti nan tou de bò nan biofilm a, fil ADN/RNA pase nan pwoteyin nan chanèl nanopore nan yon sèten. to.Akòz diferans ki genyen nan pwopriyete chimik diferan baz yo sou strand ADN / RNA a, lè yon sèl baz oswa molekil ADN pase nan kanal nanopore a, li pral lakòz chanjman nan diferan siyal elektrik.Pa detekte ak korespondan ak siyal sa yo, kalite baz korespondan yo ka kalkile, epi deteksyon an tan reyèl nan sekans la ka ranpli.


Detay Sèvis

Demo Rezilta

Sèvis Detay Karakteristik

Platfòm

Gwosè Bibliyotèk

Done teyorik pwodiksyon (pa selil)

Yon sèl-baz Presizyon

Aplikasyon

Nanopore

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR

70-90Gb/Selil

85-92%

Rele SV, De novo, Sekans tout longè, Iso-Seq, Anotasyon Gene, Deteksyon metilation ADN

Avantaj sèvis yo

● Plis pase 5 ane eksperyans sou platfòm sekans PacBio ak plizyè milye pwojè fèmen ak divès espès.
● BMKGENE se yon patnè ofisyèl nan Oxford Nanopore, ak sètifikasyon doub platfòm RNA/DNA.
● Gen modèl endikap nan sekansè ak ekipman konplè ak ase debi sekans.
● Ki baze sou platfòm Nanopore, plis pase 10 rechèch sou bèt ak plant Denovo yo te pibliye nan jounal ki renome entènasyonalman.

Egzanp kondisyon yo


Kalite echantiyon

Kantite lajan

Konsantrasyon (Qubit ®)

Volim

Pite

Lòt moun

ADN jenomik

Depann sou Done Egzijans

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

Klè pik nan 260 nm, pa gen okenn kontaminasyon

Konsantrasyon bezwen mezire pa Qubit ak Qubit/Nanopore ≤ 2

RNA total

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.5;

OD260/230 = 0.5-2.5;pa gen kontaminasyon

Valè RIN ≥7.5

 

Sèvis Workflow

preparasyon echantiyon

Preparasyon echantiyon

Preparasyon bibliyotèk

Konstriksyon bibliyotèk

Sekans

Sekans

Analiz done

Analiz done

Egzanp QC

Livrezon pwojè


  • Previous:
  • Pwochen:

  • Evalyasyon Kalite Done echantiyon ADN

    Tablo 1. Estatistik sou done pwòp.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    cleanN50Len

    cleanN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1,218,239

    26.37

    1,121,736

    25.90

    28,014

    15,764

    23,090

    143,181

    9

    Evalyasyon Kalite Done echantiyon RNA

    Tablo 1. Estatistik sou done pwòp.

    Non dosye

    ID Kliyan

    ReadNum

    BaseNum

    N50

    MeanLength

    MaxLength

    MeanQscore

    RNA_BMK001

    C2

    8,947,708

    4,047,230,083

    398

    452

    129,227

    Q12

    Figi 1. Li distribisyon longè

    A3

    Figi 2. Distribisyon nòt kalite done pwòp

    A4

    Figi 3. Longè ak bon jan kalite distribisyon nòt done pwòp

    A5

    jwenn yon quote

    Ekri mesaj ou la a epi voye l ba nou

    Voye mesaj ou a ban nou: