-
Sekans iminopresipitasyon chromatin (ChIP-seq)
ChIP-Seq bay pwofil nan tout genòm nan objektif ADN pou modifikasyon histon, faktè transkripsyon, ak lòt pwoteyin ki asosye ak ADN.Li konbine selektivite chromatin imuno-presipitasyon (ChIP) pou refè konplèks pwoteyin-ADN espesifik, ak pouvwa pwochen jenerasyon sekans (NGS) pou sekans wo-debi nan ADN refè a.Anplis de sa, paske konplèks pwoteyin-ADN yo refè nan selil k ap viv, sit obligatwa yo ka konpare nan diferan kalite selil ak tisi, oswa nan diferan kondisyon.Aplikasyon yo varye soti nan règleman transkripsyon an nan chemen devlopman nan mekanis maladi ak pi lwen.
Platfòm: Illumina NovaSeq 6000
-
Sekans bisulfit genomic antye
Methylation ADN nan senkyèm pozisyon nan sitozin (5-mC) gen yon enfliyans fondamantal sou ekspresyon jèn ak aktivite selilè.Modèl methylation nòmal yo te asosye ak plizyè kondisyon ak maladi, tankou kansè.WGBS te vin estanda an lò pou etidye methylation nan tout genòm nan yon sèl rezolisyon baz.
Platfòm: Illumina NovaSeq6000
-
Esè pou Transposase-aksesib Chromatin ak Sekans Debi segondè (ATAC-seq)
ATAC-seq se yon metòd sekans wo-debi pou analiz aksè nan genomic-lajè chromatin, ki enpòtan pou kontwòl epigenetik mondyal ekspresyon jèn.Adaptè sekans yo mete nan rejyon kwomatin ouvè pa transposaz Tn5 ipèaktif.Apre anplifikasyon PCR, yo konstwi yon bibliyotèk sekans.Tout rejyon yo louvri chromatin ka jwenn anba yon kondisyon espas-tan espesifik, pa sèlman limite a sit sa yo obligatwa nan yon faktè transcription, oswa yon sèten rejyon modifye histon.
-
Sekans Bisulfite Rediksyon Rediksyon (RRBS)
Rechèch methylation ADN te toujou yon sijè ki cho nan rechèch maladi, epi li se pre relasyon ak ekspresyon jèn ak karakteristik feno-tipik.RRBS se yon metòd egzat, efikas ak ekonomik pou rechèch metilation ADN.Anrichisman pwomotè ak rejyon zile CpG pa klivaj anzimatik (Msp I), konbine avèk sekans Bisulfite, bay deteksyon segondè rezolisyon ADN methylation.
Platfòm: Illumina NovaSeq 6000
