ØKi gen anpil eksperyans: Plis pase 200,000 echantiyon yo te trete nan BMK ki kouvri divès kalite echantiyon, ki gen ladan kilti selil, tisi, likid kò, elatriye ak plis pase 7,000 pwojè mRNA-Seq fèmen ki kouvri divès zòn rechèch.
ØSistèm kontwòl kalite strik: Pwen kontwòl kalite debaz yo atravè tout etap ki gen ladan preparasyon echantiyon, preparasyon bibliyotèk, sekans ak byoenfòmatik yo anba siveyans sere pou bay bon jan kalite rezilta.
ØPlizyè baz done ki disponib pou etid anrichisman ak anotasyon fonksyon pou akonpli divès objektif rechèch.
ØSèvis apre-sale: Sèvis apre-sale valab pou 3 mwa apre pwojè fini, ki gen ladan swivi pwojè, depanaj, rezilta Q&A, elatriye.
Bibliyotèk | Estrateji sekans | Done rekòmande | Kontwol kalite |
Poly A anrichi | Illumina PE150 | 6 GB | Q30≥85% |
Nukleotid:
Pite | Entegrite | Kantite lajan |
OD260/280≥1.7-2.5 OD260/230≥0.5-2.5Limite oswa pa gen okenn pwoteyin oswa kontaminasyon ADN yo montre sou jèl. | Pou plant: RIN≥6.5;Pou bèt: RIN≥7;28S/18S≥1.0;elevasyon debaz limite oswa pa gen okenn | Konk.≥30 ng/μl;Volom ≥ 10 μl;Total ≥ 1.5 μg |
Tisi: Pwa (sèk):≥1 g
* Pou tisi ki pi piti pase 5 mg, nou rekòmande pou voye echantiyon tisi nan frizè (nan nitwojèn likid).
Sispansyon selilè:Konte selil = 3 × 106- 1×107
* Nou rekòmande pou voye lisat selil ki nan frizè.Nan ka sa a konte pi piti pase 5 × 105, flash jele nan nitwojèn likid rekòmande, ki pi preferab pou ekstraksyon mikwo.
Echantiyon san:Volim≥1 ml
Mikwo-òganis:Mas ≥ 1 g
Veso: 2 ml tib santrifujeur (Fil fèblan pa rekòmande)
Egzanp etikèt: Gwoup + replike egzanp A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
chajman:
Bioenfòmatik
Ekaryotik Flux travay analiz sekans mRNA
Bioenfòmatik
ØKontwòl kalite done kri
ØReferans aliyman genòm
ØAnaliz estrikti transkripsyon
ØKantifikasyon ekspresyon
ØAnaliz ekspresyon diferans
ØFonksyon anote ak anrichisman
1.mRNA Done Saturasyon koub
2.Analiz ekspresyon diferans-konplo volkan
3.Anòt KEGG sou DEG
4.GO klasifikasyon sou DEG