Analiz Asosyasyon sou tout Jenòm nan
Koule travay
Avantaj Sèvis yo
●Ekspètiz vaste ak dosye piblikasyonAvèk eksperyans akimile nan GWAS, BMKGene te konplete plizyè santèn pwojè sou espès nan rechèch sou popilasyon GWAS, li te ede chèchè yo pibliye plis pase 100 atik, epi faktè enpak kimilatif la te rive nan 500.
● Analiz byoenformatik konplèWorkflow la gen ladan l analiz asosyasyon SNP-karakteristik, ki delivre yon seri jèn kandida ak anotasyon fonksyonèl korespondan yo.
●Ekip byoenformatik ki trè kalifye ak yon sik analiz koutAvèk anpil eksperyans nan analiz jenomik avanse, ekip BMKGene a bay analiz konplè nan yon tan repons rapid.
●Sipò apre lavant:Angajman nou an ale pi lwen pase fini pwojè a avèk yon peryòd sèvis apre lavant 3 mwa. Pandan tan sa a, nou ofri swivi pwojè a, asistans pou depanaj, ak sesyon kesyon-repons pou reponn nenpòt kesyon ki gen rapò ak rezilta yo.
Espesifikasyon ak egzijans sèvis yo
| Kalite sekans | Echèl popilasyon rekòmande | Estrateji sekans | Bezwen nikleyotid yo |
| Sekansaj Jenòm Konplè | 200 echantiyon | 10 fwa | Konsantrasyon: ≥ 1 ng/ µL Kantite total ≥ 30ng Degradasyon oswa kontaminasyon limite oswa pa genyen |
| Fragman Anplifye nan Lokis Espesifik (SLAF) | Pwofondè etikèt: 10x Kantite etikèt: < 400 Mb: WGS rekòmande < 1Gb: 100K etikèt 1Gb > 2Gb: 300K etikèt Maksimòm 500k etikèt | Konsantrasyon ≥ 5 ng/µL Kantite total ≥ 80 ng Jèl agaroz: pa gen degradasyon oswa kontaminasyon limite
|
Seleksyon Materyèl
Diferan varyete, sou-espès, ras lokal/bank jèn/fanmi melanje/resous sovaj
Diferan varyete, sou-espès, ras tè
Fanmi demi-frè/fanmi frè konplè/resous sovaj
Koule Travay Sèvis la
Konsepsyon eksperyans
Livrezon echantiyon
Ekstraksyon ARN
Konstriksyon bibliyotèk
Sekansaj
Analiz done
Sèvis apre-lavant
Gen ladan analiz sa yo:
- Analiz asosyasyon sou tout jenòm lan: modèl LM, LMM, EMMAX, FASTLMM
- Anotasyon fonksyonèl jèn kandida yo
Analiz asosyasyon SNP-karakteristik - graf Manhattan
Analiz asosyasyon SNP-karakteristik - graf QQ
Eksplore avansman sèvis GWAS BMKGene yo fasilite atravè yon koleksyon piblikasyon byen òganize:
Lv, L. et al. (2023) 'Apèsi sou baz jenetik tolerans amonyak nan paloud razwa Sinonovacula constricta pa etid asosyasyon sou tout jenòm lan',Akwakilti, 569, paj 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Analiz milti-omik sou 398 aksesyon milti ke ren revele rejyon jenomik ki asosye avèk domestikasyon, karakteristik metabolit, ak efè anti-enflamatwa',Plant Molekilè, 15(8), pp 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Katografi Asosyasyon sou Tout Jenòm nan Fenotip Hulless Barely nan Anviwònman Sechrès',Fwontyè nan Syans Plant yo, 13, paj 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'GmST1, ki kode yon sulfotransferaz, konfere rezistans a souch viris mozayik soya G2 ak G3',Plant, Selil ak Anviwònman, 44(8), pp 2777–2792. fè: 10.1111/PCE.14066.
