-
Sekansaj Amplikon 16S/18S/ITS konplè PacBio
Platfòm Amplicon (16S/18S/ITS) la devlope avèk plizyè ane eksperyans nan analiz pwojè divèsite mikwòb, ki gen ladan analiz debaz estanda ak analiz pèsonalize: analiz debaz la kouvri kontni analiz prensipal rechèch mikwòb aktyèl la, kontni analiz la rich e konplè, epi rezilta analiz yo prezante sou fòm rapò pwojè; Kontni analiz pèsonalize a divèsifye. Yo ka chwazi echantiyon yo epi yo ka fikse paramèt yo yon fason fleksib selon rapò analiz debaz la ak objektif rechèch la, pou reyalize egzijans pèsonalize yo. Sistèm operasyon Windows, senp e rapid.
-
Transkriptòm konplè PacBio (ki pa referans)
Lè l sèvi avèk done sekansaj izofòm Pacific Biosciences (PacBio) kòm done antre, aplikasyon sa a kapab idantifye sekans transkripsyon konplè (san asanblaj). Lè yo trase sekans konplè yo kont jenòm referans lan, yo ka optimize transkripsyon yo pa jèn, transkripsyon, rejyon kodaj, elatriye li te ye. Nan ka sa a, yo ka reyalize yon idantifikasyon ki pi egzak nan estrikti mRNA yo, tankou épissage altènatif, elatriye. Analiz konjwen ak done sekansaj transkriptòm NGS pèmèt yon anotasyon ki pi konplè ak yon kantifikasyon ki pi egzak nan ekspresyon nan nivo transkripsyon, ki benefisye anpil ekspresyon diferansyèl an aval ak analiz fonksyonèl.
-
Twous zouti
BMKCloud se yon platfòm byoenformatik dirijan ki bay yon solisyon konplè pou pwogram jenomik, ki lajman fè chèchè nan divès domèn tankou medikal, agrikòl, anviwònman, elatriye konfyans. BMKCloud angaje pou bay sèvis entegre, fyab ak efikas tankou platfòm ak zouti analiz byoenformatik, resous enfòmatik, baz done piblik, kou byoenformatik sou entènèt, elatriye. BMKCloud gen plizyè zouti byoenformatik ki itilize souvan tankou anotasyon jèn, zouti jenetik evolisyonè, ncRNA, kontwòl kalite done, asanblaj, aliyman, ekstraksyon done, mitasyon, estatistik, dèlko figi, analiz sekans, elatriye.
-
Ti ARN
Ti ARN yo se yon kalite ARN kout ki pa kode ki gen yon longè mwayèn 18-30 nt, ki gen ladan miARN, siARN ak piARN. Yo rapòte anpil ke ti ARN sa yo enplike nan divès pwosesis byolojik tankou degradasyon mRNA, inibisyon tradiksyon, fòmasyon etewokromatin, elatriye. Analiz sekans ti ARN te lajman aplike nan etid sou devlopman bèt/plant, maladi, viris, elatriye. Platfòm analiz sekans ti ARN lan konsiste de analiz estanda ak eksplorasyon done avanse. Sou baz done ARN-seq, analiz estanda ka reyalize idantifikasyon ak prediksyon miARN, prediksyon jèn sib miARN, anotasyon ak analiz ekspresyon. Analiz avanse pèmèt rechèch ak ekstraksyon miARN pèsonalize, jenerasyon dyagram Venn, konstriksyon rezo miARN ak jèn sib.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS se yon platfòm analiz re-sekansaj tout jenòm lan, ki devlope sou baz yon rich eksperyans nan Teknoloji Byomarkè. Platfòm fasil pou itilize sa a pèmèt soumèt rapidman yon workflow analiz entegre tou senpleman lè w defini kèk paramèt debaz, ki adapte pou done sekansaj ADN ki pwodui nan platfòm Illumina ak platfòm sekansaj BGI. Platfòm sa a deplwaye sou yon sèvè informatique pèfòmans segondè, ki pèmèt analiz done trè efikas nan yon tan trè limite. Eksplorasyon done pèsonalize disponib sou baz analiz estanda, ki gen ladan rechèch jèn ki sibi mitasyon, konsepsyon amorseur PCR, elatriye.
-
ARNm (Referans)
Transkriptòm se lyen ki genyen ant enfòmasyon jenetik jenomik ak pwoteyòm fonksyon byolojik la. Règleman nivo transkripsyon an se mòd règleman ki pi enpòtan e ki pi lajman etidye nan òganis yo. Sekans transkriptòm nan ka sekansye transkriptòm nan nenpòt ki lè oswa nan nenpòt ki kondisyon, avèk yon rezolisyon ki egzak a yon sèl nikleotid. Li ka reflete nivo transkripsyon jèn nan yon fason dinamik, idantifye ak quantifye an menm tan transkripsyon ki ra ak nòmal yo, epi bay enfòmasyon estriktirèl sou transkripsyon espesifik echantiyon yo.
Kounye a, teknoloji sekansaj transkriptòm yo te lajman itilize nan agwonomi, medikaman ak lòt domèn rechèch, tankou règleman devlopman bèt ak plant, adaptasyon anviwònman, entèraksyon iminitè, lokalizasyon jèn, evolisyon jenetik espès ak deteksyon timè ak maladi jenetik.
-
Metajenomik (NGS)
Platfòm analiz sa a fèt pou analiz done metajenomik rapid (shotgun) grasa plizyè ane eksperyans. Li gen ladan yon workflow entegre ki gen ladan plizyè analiz metajenomik ki nesesè souvan, tankou tretman done, etid nivo espès, etid nivo fonksyon jèn, gwoupman metajenom, elatriye. Anplis de sa, zouti eksplorasyon done pèsonalize disponib sou workflow analiz estanda a, tankou rechèch jèn ak espès, defini paramèt, jenerasyon figi pèsonalize, elatriye.
-
LncRNA
ARN long ki pa kodan (lncRNA) yo se yon kalite transkripsyon ki gen yon longè ki pi long pase 200 nt, ki pa kapab kode pwoteyin. Prèv akimile yo sijere ke pifò nan lncRNA yo gen anpil chans pou yo fonksyone. Teknoloji sekansaj wo débit ak zouti analiz byoenformatik pèmèt nou revele sekans lncRNA ak enfòmasyon pozisyonman pi efikasman epi mennen nou dekouvri lncRNA ki gen fonksyon regilasyon enpòtan. BMKCloud fyè pou l bay kliyan nou yo yon platfòm analiz sekansaj lncRNA pou reyalize analiz lncRNA rapid, fyab ak fleksib.
-
GWAS
Etid asosyasyon sou tout jenòm lan (GWAS) gen pou objaktif pou idantifye varyant jenetik (jenotip) ki asosye avèk karakteristik espesifik (fenotip). Etid GWA yo envestige makè jenetik atravè tout jenòm yon gwo kantite moun epi predi asosyasyon jenotip-fenotip pa analiz estatistik nan nivo popilasyon an. Resekansyasyon jenòm konplè a ka potansyèlman dekouvri tout varyant jenetik yo. Lè yo makonnen ak done fenotipik, GWAS yo ka trete pou idantifye SNP, QTL ak jèn kandida ki gen rapò ak fenotip la, sa ki sipòte fòtman elvaj bèt/plant modèn. SLAF se yon estrateji sekansyasyon jenòm senplifye ki devlope pa yon moun, ki dekouvri makè distribye sou tout jenòm lan, SNP. SNP sa yo, kòm makè jenetik molekilè, ka trete pou etid asosyasyon avèk karakteristik sib. Li se yon estrateji ki pa koute chè pou idantifye varyasyon jenetik ki asosye avèk karakteristik konplèks.
-
Transkriptomik konplè Nanopore
Izofòm altènatif konplèks ak varyab nan òganis yo se mekanis jenetik enpòtan pou reglemante ekspresyon jèn ak divèsite pwoteyin. Idantifikasyon egzak estrikti transkripsyon yo se baz pou etid apwofondi sou modèl regilasyon ekspresyon jèn yo. Platfòm sekansaj Nanopore a te pote avèk siksè etid transkripsyon nan nivo izofòm. Platfòm analiz sa a fèt pou analize done RNA-Seq ki pwodui sou platfòm Nanopore a sou baz jenòm referans lan, ki reyalize analiz kalitatif ak kantitatif nan tou de nivo jèn ak nivo transkripsyon.
-
sik-ARN
ARN sikilè (sirkRNA) se yon kalite ARN ki pa kode, yo fèk dekouvri li jwe yon wòl vital nan rezo regilasyon ki enplike nan devlopman, rezistans anviwònman, elatriye. Li diferan de molekil ARN lineyè yo, pa egzanp mRNA, lncRNA, bout 3′ ak 5′ sirkRNA yo ini ansanm pou fòme yon estrikti sikilè, ki pwoteje yo kont dijesyon ègzonikleyaz epi yo pi estab pase pifò ARN lineyè yo. Yo te dekouvri ke sirkRNA yo gen divès fonksyon nan reglemante ekspresyon jèn yo. sirkRNA ka fonksyone kòm ceRNA, ki lye ak miRNA nan yon fason konpetitif, ke yo rekonèt kòm eponj miRNA. Platfòm analiz sekans sirkRNA a pèmèt analiz estrikti ak ekspresyon sirkRNA, prediksyon sib ak analiz konjwen ak lòt kalite molekil ARN.
-
BSA
Platfòm analiz segregasyon an gwo (Bulked Segregation Analysis) konsiste de yon analiz estanda yon sèl etap ak analiz avanse ak paramèt pèsonalize. BSA se yon teknik yo itilize pou idantifye rapidman makè jenetik ki asosye ak fenotip la. Prensipal pwosesis BSA a gen ladan: 1. chwazi de gwoup moun ki gen fenotip trè opoze; 2. mete ADN, ARN oswa SLAF-seq (Devlope pa Biomarker) tout moun yo ansanm pou fòme de gwo ADN; 3. idantifye sekans diferansyèl parapò ak jenòm referans lan oswa ant yo, 4. predi rejyon lye kandida yo pa algoritm ED ak SNP-index; 5. Analiz fonksyonèl ak anrichisman sou jèn nan rejyon kandida yo, elatriye. Gen tou metòd eksplorasyon done ki pi avanse, tankou tès depistaj makè jenetik ak konsepsyon amorseur.
-
Anplikon (16S/18S/ITS)
Platfòm Amplicon (16S/18S/ITS) la devlope avèk plizyè ane eksperyans nan analiz pwojè divèsite mikwòb, ki gen ladan analiz debaz estanda ak analiz pèsonalize: analiz debaz la kouvri kontni analiz prensipal rechèch mikwòb aktyèl la, kontni analiz la rich e konplè, epi rezilta analiz yo prezante sou fòm rapò pwojè; Kontni analiz pèsonalize a divèsifye. Yo ka chwazi echantiyon yo epi yo ka fikse paramèt yo yon fason fleksib selon rapò analiz debaz la ak objektif rechèch la, pou reyalize egzijans pèsonalize yo. Sistèm operasyon Windows, senp e rapid.
