-
Analiz Asosyasyon Genome-lajè
Genome-wide Association etid (GWAS) vize pou idantifye varyant jenetik (genotip) ki asosye ak karakteristik espesifik (fenotip).Etid GWAS envestige makè jenetik travèse genòm antye nan gwo kantite moun ak predi asosyasyon genotip-fenotip pa analiz estatistik nan nivo popilasyon an.Li te lajman aplike nan rechèch sou maladi imen ak min fonksyonèl jèn sou karakteristik konplèks nan bèt oswa plant yo.
-
Plant/Animal Whole Genome Sekans
Tout genomic re-sekans, ke yo rele tou WGS, pèmèt revele nan tou de mitasyon komen ak ra sou genòm nan antye ki gen ladan Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Suppression Ensèsyon (InDel), Varyasyon Estrikti (SV), ak Varyasyon Nimewo Kopi (CNV). ).SV yo fòme yon pi gwo pòsyon nan baz varyasyon an pase SNP yo epi yo gen yon pi gwo enpak sou genòm nan, ki gen yon efè enpòtan sou òganis vivan yo.Resekans lekti long pèmèt pou idantifikasyon pi egzak nan fragman gwo ak varyasyon konplike paske lekti long fè li pi fasil travèse kwomozòm sou rejyon konplike tankou repete tandem, rejyon GC/AT ki rich, ak rejyon hyper-varyab.
Platfòm: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Jenetik evolisyonè
Jenetik evolisyonè se yon sèvis sekans chaje ki fèt pou bay yon entèpretasyon konplè sou enfòmasyon evolisyonè materyèl yo bay ki baze sou varyasyon jenetik, ki gen ladan SNPs, InDels, SVs ak CNVs.Li bay tout analiz fondamantal ki nesesè pou dekri chanjman evolisyonè yo ak karakteristik jenetik popilasyon yo, tankou estrikti popilasyon, divèsite jenetik, relasyon filojeni, elatriye. Li genyen tou etid sou koule jèn, ki pèmèt estimasyon gwosè popilasyon efikas, tan divergence.
-
Jenomik konparatif
Jenomik konparatif literalman vle di konpare sekans genomic konplè ak estrikti diferan espès yo.Disiplin sa a gen pou objaktif pou revele evolisyon espès yo, fonksyon jèn yo, mekanis regilasyon jèn yo nan nivo jenom nan idantifye estrikti sekans yo ak eleman ki konsève oswa diferansye atravè diferan espès yo.Etid genomik konparatif tipik gen ladan analiz nan fanmi jèn, devlopman evolisyonè, duplication antye genomic, presyon selektif, elatriye.
-
Asanble Genome ki baze sou Hi-C
Hi-C se yon metòd ki fèt pou kaptire konfigirasyon kwomozòm nan konbine entèraksyon ki baze sou pwoksimite ak sekans gwo debi.Yo kwè entansite nan entèraksyon sa yo dwe negatif korelasyon ak distans fizik sou kwomozòm.Se poutèt sa, done Hi-C ta ka gide gwoupman, lòd ak oryantasyon nan sekans reyini nan yon jenom bouyon ak ancrage sa yo sou yon sèten kantite kwomozòm.Teknoloji sa a pèmèt yon asanble genòm nan nivo kwomozòm nan absans kat jenetik ki baze sou popilasyon an.Chak genomic bezwen yon Hi-C.
Platfòm: platfòm Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Plant/Animal De Novo Genome Sequencing
De Novosekans refere a konstriksyon tout genòm yon espès lè l sèvi avèk teknoloji sekans, pa egzanp PacBio, Nanopore, NGS, elatriye, nan absans yon genòm referans.Amelyorasyon remakab nan longè lekti nan teknoloji sekans twazyèm jenerasyon te pote nouvo opòtinite nan rasanble genòm konplèks, tankou sa yo ki gen gwo heterozygosity, gwo rapò nan rejyon repetitif, polyploids, elatriye. rezoud eleman repetitif, rejyon ki gen kontni GC nòmal ak lòt rejyon trè konplèks.
Platfòm: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Platfòm Illumina NovaSeq
-
Sekans tout moun Exome
Tout sekans exome (WES) konsidere kòm yon estrateji sekans pri-efikas pou idantifye mitasyon ki lakòz maladi.Malgre ke exons sèlman pran apeprè 1.7% nan genòm tout antye, li reprezante pwofil la nan fonksyon pwoteyin total dirèkteman.Nan genomic imen, li te rapòte ke plis pase 85% nan mitasyon ki gen rapò ak maladi rive nan rejyon kodaj pwoteyin.
BMKGENE ofri sèvis konplè ak fleksib tout moun sekans eksòm ak diferan estrateji kaptire ekson ki disponib pou satisfè divès objektif rechèch.
Platfòm: Platfòm Illumina NovaSeq
-
Sekans fragman anplifye nan lokal espesifik (SLAF-Seq)
Genotip segondè-debi, espesyalman sou popilasyon gwo echèl, se yon etap fondamantal nan syans asosyasyon jenetik, ki bay baz jenetik pou dekouvèt jèn fonksyonèl, analiz evolisyonè, elatriye. Olye pou yo re-sekans gwo twou san fon an antye genomic, redui sekans jenom reprezantasyon (RRGS). ) se prezante pou minimize pri sekans pou chak echantiyon, pandan y ap kenbe efikasite rezonab sou dekouvèt makè jenetik.Sa a se souvan reyalize pa èkstraksyon fragman restriksyon nan seri gwosè bay yo, ki rele bibliyotèk reprezantasyon redwi (RRL).Espesifik-locus anplifye fragman sekans (SLAF-Seq) se yon estrateji pwòp tèt ou devlope pou jenotip SNP avèk oswa san yon genòm referans.
Platfòm: Platfòm Illumina NovaSeq
