Ti Sekans ARN-Illumina
Karakteristik
● Preparasyon bibliyotèk seleksyon gwosè.
● Analiz byoenformatik ki santre sou prediksyon ak sib miRNA.
Avantaj Sèvis yo
●Ekspètiz vasteNou trete plis pase 300 echantiyon, ki kouvri divès kalite echantiyon. Nou pote richès ekspètiz nou nan chak pwojè.
●Kontwòl Kalite RijidNou aplike pwen kontwòl debaz nan tout etap yo, depi preparasyon echantiyon rive nan preparasyon bibliyotèk, sekans ak byoenformatik. Siveyans metikule nou an asire livrezon rezilta ki toujou gen bon kalite.
●Analiz byoenformatik konplè:Li pèmèt idantifikasyon miRNA yo tou de ki deja konnen ak nouvo, idantifikasyon sib miRNA yo, ak anotasyon fonksyonèl ki koresponn ak anrichisman ak plizyè baz done (KEGG, GO).
●Sipò apre lavantNou konprann enpòtans prezans, se poutèt sa angajman nou an ale pi lwen pase fini pwojè a avèk yon peryòd sèvis apre lavant 3 mwa. Pandan tan sa a, nou ofri swivi pwojè, asistans pou depanaj, ak sesyon kesyon-repons pou reponn nenpòt kesyon ki gen rapò ak rezilta yo.
Egzijans echantiyon ak livrezon
| Bibliyotèk | Platfòm | Done rekòmande | QC Done |
| Gwosè chwazi | Illumina SE50 | 10M-20M lekti | Q30≥85% |
Egzijans pou echantiyon yo:
Nukleotid:
| Konsantrasyon (ng/μl) | Kantite (μg) | Pite | Entegrite |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Kontaminasyon pwoteyin oswa ADN limite oswa pa montre okenn kontaminasyon sou jèl la. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; elevasyon debaz limite oswa pa genyen |
● Plant yo:
Rasin, Tij oswa Petal: 450 mg
Fèy oswa Grenn: 300 mg
Fwi: 1.2 g
● Animal:
Kè oswa Entesten: 450 mg
Vizè oswa sèvo: 240 mg
Misk: 600 mg
Zo, cheve oswa po: 1.5g
● Artropòd:
Ensèk: 9g
Krustase: 450 mg
● San konplè2 tib
● Selil: 106 selil yo
● Serom ak Plasma:6 mL
Livrezon Echantiyon Rekòmande
Veso: Tib santrifij 2 ml (Papye aliminyòm pa rekòmande)
Etikèt echantiyon: Gwoupe+replike pa egzanp A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Chajman:
1. Glas sèk: Echantiyon yo bezwen mete nan sache epi antere nan glas sèk.
2. Tib ARNstable: Echantiyon ARN yo ka seche nan tib estabilizasyon ARN (pa egzanp RNAstable®) epi voye yo nan tanperati chanm.
Koule Travay Sèvis la
Konsepsyon eksperyans
Livrezon echantiyon
Ekstraksyon ARN
Konstriksyon bibliyotèk
Sekansaj
Analiz done
Sèvis apre-lavant
Bioenformatik
● Kontwòl kalite done brit yo
● Klasifikasyon ti ARN
● ekspresyon miRNA ak analiz ekspresyon diferansyèl
● Anotasyon jèn sib miRNA ak jèn sib miRNA ki eksprime diferans
● Anotasyon jèn sib ak anrichisman fonksyon jèn miRNA ki eksprime diferans
Idantifikasyon miRNA: estrikti ak pwofondè
Ekspresyon diferansyèl miRNA - gwoupman yerarchik
Anotasyon fonksyonèl sib miRNA ki eksprime diferansyèlman
Eksplore avansman rechèch sèvis sekansaj sRNA BMKGene yo fasilite atravè yon koleksyon piblikasyon byen òganize.
Chen, H. et al. (2023) 'Enfeksyon viral yo anpeche byosentèz saponin ak fotosentèz nan Panax notoginseng',Fizyoloji Plant ak Byochimik, 203, paj 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'Pwoteyin FREE1 ki gen domèn FYVE nan plant lan asosye avèk konpozan mikwoprocesè pou repouse byojenèz miRNA',Rapò EMBO yo, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p la kontwole devlopman lav pupal la lè li vize plizyè jèn domèn ki sanble ak faktè kwasans epidèm 8 (megf8) nan myèl Apis mellifera a',Jounal Entènasyonal Syans Molekilè, 24(6), paj 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Analiz entegre MiRNA ak jèn ki asosye ak kalite vyann revele ke Gga-MiR-140-5p afekte depo grès entramuskilè nan poul',Fizyoloji Selilè ak Byochimik, 46(6), pp 2421–2433. fè: 10.1159/000489649.
