Sekansaj Transkriptòm Konplè – Illumina
Karakteristik
● Jenerasyon doub bibliyotèk pou sekansye transkriptòm konplè a: bibliyotèk rediksyon rRNA ak preparasyon ti bibliyotèk RNA.
● Analiz byoenformatik konplè sou mRNA, lncRNA, circRNA ak miRNA nan rapò byoenformatik separe, plis yon analiz konjwen ak tout ekspresyon ARN konbine, ki gen ladan analiz rezo ceRNA.
Avantaj Sèvis yo
●Ekspètiz vasteNou trete plis pase 2100 pwojè transkriptòm konplè, ki kouvri divès kalite echantiyon. Nou pote richès ekspètiz nou nan chak pwojè.
●Kontwòl Kalite RijidNou aplike pwen kontwòl debaz nan tout etap yo, depi preparasyon echantiyon rive nan preparasyon bibliyotèk, sekans ak byoenformatik. Siveyans metikule nou an asire livrezon rezilta ki toujou gen bon kalite.
●Anotasyon konplèNou itilize plizyè baz done pou nou mete anotasyon fonksyonèl Jèn ki Eksprime Diferansyèlman (DEG) yo epi fè analiz anrichisman ki koresponn yo. Apwòch konplè sa a bay enfòmasyon sou pwosesis selilè ak molekilè ki dèyè repons transkriptòm nan, pou asire ou jwenn tout enfòmasyon posib sou done eksperyans ou an.
●Analiz apwofondi sou rezo regilasyon yoAnaliz rezo ceRNA a pèmèt grasa sekansaj konjwen mRNA, lncRNA, circRNA, ak miRNA ansanm ak yon workflow byoenformatik konplè.
●Sipò apre lavantNou konprann enpòtans prezans, se poutèt sa angajman nou an ale pi lwen pase fini pwojè a avèk yon peryòd sèvis apre lavant 3 mwa. Pandan tan sa a, nou ofri swivi pwojè, asistans pou depanaj, ak sesyon kesyon-repons pou reponn nenpòt kesyon ki gen rapò ak rezilta yo.
Egzijans echantiyon ak livrezon
| Bibliyotèk | Estrateji sekans | Done rekòmande | Kontwòl Kalite |
| ARNr apovri | Illumina PE150 | 16 Gb | Q30≥85% |
| Gwosè chwazi | Illumina SE50 | 10-20 milyon lekti |
Egzijans pou echantiyon yo:
Nukleotid:
| Konsantrasyon (ng/μl) | Kantite (μg) | Pite | Entegrite |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Kontaminasyon pwoteyin oswa ADN limite oswa pa montre okenn kontaminasyon sou jèl la. | RIN≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; elevasyon debaz limite oswa pa genyen |
Livrezon Echantiyon Rekòmande
Veso: Tib santrifij 2 ml (Papye aliminyòm pa rekòmande)
Etikèt echantiyon: Gwoupe+replike pa egzanp A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Chajman:
1. Glas sèk: Echantiyon yo bezwen mete nan sache epi antere nan glas sèk.
2. Tib ARNstable: Echantiyon ARN yo ka seche nan tib estabilizasyon ARN (pa egzanp RNAstable®) epi voye yo nan tanperati chanm.
Koule Travay Sèvis la
Konsepsyon eksperyans
Livrezon echantiyon
Ekstraksyon ARN
Konstriksyon bibliyotèk
Sekansaj
Analiz done
Sèvis apre-lavant
Bioenformatik
Anplis tout analiz sou chak diferan, 4 kalite ARN yo konbine nan analiz konjwen nou an:
- Analiz ko-ekspresyon ant tout diferan kalite done ARN yo
- Apèsi sou ekspresyon ARN
- Apèsi sou ekspresyon diferansyèl
- Rezo CeRNA
- Jèn kle entegre nan chemen an
- Analiz konsèvasyon
- Relasyon sib yo
Apèsi sou ekspresyon ARN
Jèn ki eksprime diferan
analiz ceRNA
miRNA ki eksprime diferansyèlman ak RNA ki gen rapò
Eksplore avansman rechèch sèvis sekansaj transkriptòm konplè BMKGene yo fasilite atravè yon koleksyon piblikasyon byen òganize.
Dai, Y. et al. (2022) 'Pwofil ekspresyon konplè mRNA, lncRNA ak miRNA nan maladi Kashin-Beck idantifye pa sekans RNA',Omik Molekilè, 18(2), pp 154–166. fè: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan et al. (2022) 'Analiz transkriptòm konplè sou rezistans frèt Apis cerana nan mòn Changbai pandan peryòd ivè a.'Jèn, 830, paj 146503–146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al. (2022) 'Priyorizasyon ki baze sou entegrasyon milti-omik pou rezo regilasyon ARN andojèn konpetitif nan kansè nan poumon ti selil: Karakteristik molekilè ak kandida dwòg',Fwontyè nan Onkoloji, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al. (2022) 'Analiz entegre pwofil ekspresyon lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA revele nouvo apèsi sou mekanis potansyèl an repons a nematod rasin-nœud nan pistach',BMC Genomics, 23(1), pp. 1–12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGI/7.
Yan, Z. et al. (2022) 'Sekans ARN transkriptòm konplè mete aksan sou mekanis molekilè ki asosye ak antretyen kalite apre rekòlt nan bwokoli pa iradyasyon LED wouj',Biyoloji ak Teknoloji Apre Rekòt, 188, paj 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
