Baktérium- és gombás egész genom újraszekvenálás
A baktériumok és a gombás teljes genom átmeneti projektjei kulcsfontosságúak a mikrobiális genomika előmozdításához azáltal, hogy lehetővé teszik a mikrobiális genomok befejezését és összehasonlítását. Ez megkönnyíti a fermentációs tervezést, az ipari folyamatok optimalizálását és a másodlagos anyagcserétek feltárását. Ezenkívül a gombás és a baktériumok átszervezése elengedhetetlen a környezeti alkalmazkodás megértésében, a törzsek optimalizálásában, valamint a genetikai evolúció dinamikájának feltárásában, széles körű következményekkel az orvostudományban, a mezőgazdaságban és a környezettudományban.
Szolgáltatási előnyök
●A bioinformatikus elemzés tartalmazza a variáns hívást:Funkcionális betekintést nyújtva az újbóli szekvenált genomokba.
● Széles körű szakértelem.
●Az értékesítés utáni támogatás:Elkötelezettségünk a projekt befejezésén túlmutat, egy 3 hónapos értékesítés utáni szolgáltatási periódussal. Ez idő alatt a projekt nyomon követését, hibaelhárítási támogatást és Q & A üléseket kínálunk az eredményekkel kapcsolatos kérdések kezelésére.
Szolgáltatási előírások
| Szekvenálási platform | Szekvenálási stratégia | Az ajánlott adatok | Minőség -ellenőrzés |
| Illumina Novaseq | PE150 | 100x mélység | Q30 ≥85% |
Minta követelmények
| Koncentráció (ng/µl) | Teljes összeg (ng) | Térfogat (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Baktériumok: ≥1x107 sejtek
Uncelluláris gombák: ≥5x106-1x107 sejtek
Makrógomba: ≥4G
Szolgáltatási munka folyamat
Minta szállítás
Könyvtári felépítés
Szekvenálás
Adatelemzés
Értékesítés utáni szolgáltatások
Tartalmazza a következő elemzést:
- Az adatminőség -ellenőrzés szekvenálása
- Összehangolás a referencia -genomhoz
- Variáns hívás: SNP és indel
- Variáns kommentár
Variáns hívás: SNP típusok
Variáns hívás: indelhossz eloszlás
Fedezze fel a Bmkgene mikrobiális genom átmeneti szolgáltatásainak elősegítésével elősegített előrelépéseket a publikációk kurátus gyűjteményén keresztül.
Jia, Y. et al. (2023) „A transzkriptom és a teljes genom újraszekvenálása a szűrőbetegség-rezisztencia génekkel a búza törpe kanyargós génekkel”,Nemzetközi Molekuláris Sciences folyóirat, 24 (24). doi: 10.3390/ijms242417356.
Jiang, M. et al. (2023) „Az ampicillin által vezérelt glükóz-anyagcsere manipulálja a toleranciától a baktériumokban való rezisztenciára való áttérést”,A tudományos fejlődés, 9 (10). doi: 10.1126/sciadv.ade8582/suppl_file/sciadv.ade8582_sm.pdf.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina Halalkaliphila sp. Nov., Haloalkaliphil baktérium, amelyet egy szóda -tóból izoláltak a Belső -Mongólia autonóm régiójában, Kína ”, Int. J. Syst. Evol.Mikrobiol, 72, p. 5263. Doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. és Wang, G.-H. (2024) „A Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a genomszekvenciája, a Nasonia vitripennis-ből izolált”,Mikrobiológiai erőforrás -bejelentések- doi: 10.1128/MRA.00802-23.
