Illumina és BGI
Jellemzők
●Platformok:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten és BGI-DNB-T7
●Sorrendi módok:PE50, PE100, PE150, PE250
●A könyvtárak minőségellenőrzése szekvenálás előtt
●Sorozati adatszolgáltatás és minőségellenőrzés:QC jelentés és nyers adatok kézbesítése fastq formátumban demultiplexelés és szűrés után Q30 olvas.
Szolgáltatás előnyei
●A szekvenálási szolgáltatások sokoldalúsága:az ügyfél választhat, hogy sáv, áramlási cella vagy adatmennyiség szerinti sorrendet kíván-e rendezni.
●A platformok sokoldalúsága:A DNB-könyvtárak átvihetők Illumina platformokra
●Széleskörű tapasztalat az Illumina szekvenáló platformon:több ezer lezárt projekttel különféle fajokkal.
●A szekvenálási minőségellenőrzési jelentés kézbesítése:a minőségi mérőszámokkal, az adatok pontosságával és a szekvenálási projekt általános teljesítményével.
●Érett szekvenálási folyamat:rövid átfutási idővel.
●Szigorú minőségellenőrzés: szigorú minőségellenőrzési követelményeket vezetünk be, hogy garantáljuk a folyamatosan jó minőségű eredményeket.
Mintakövetelmények*
Részleges sávsorrend
| Adatmennyiség (X) | Koncentráció (qPCR/nM) | Hangerő |
| X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| 50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
| X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Egysávos (Illumina)
| Felület | Koncentráció (qPCR/nM) | Hangerő |
| HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
A koncentráció és az összmennyiség mellett megfelelő csúcsmintázat is szükséges.
Kérjük, forduljon hozzánk, ha mintái nem felelnek meg a kiindulási anyagokra vonatkozó követelményeknek.
Szolgáltatási munkafolyamat
Könyvtári minőségellenőrzés
Szekvenálás
Adatminőség-ellenőrzés
Projekt szállítás
Könyvtári minőségellenőrzési jelentés
A szekvenálás, a könyvtár mennyiségének és a töredezettség felmérése előtt jelentést készítünk a könyvtár minőségéről.
Sorozati minőségellenőrzési jelentés
1. táblázat: A szekvenálási adatok statisztikái.
| Mintaazonosító | BMKID | Nyers olvasmányok | Nyers adatok (bp) | tiszta olvasmányok (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
1. ábra Minőségi eloszlás a leolvasások mentén az egyes mintákban
2. ábra: Alaptartalom-eloszlás
3. ábra Az olvasott tartalmak megoszlása a szekvenálási adatokban
