BMKCloud Log in
条形banner-03

Termékek

DNS/RNS szekvenálás – Nanopórus szekvenáló

Az ONT szekvenálás egy molekula, valós idejű elektromos jelek szekvenálási technológia, amely nanopórusokon alapul, az egyes platformok szekvenálási elve ugyanaz.A kettős szálú DNS/RNS a biofilmbe ágyazott nanopórusos fehérjéhez kötődik, és a motorfehérje vezetése alatt letekeredik, a biofilm mindkét oldaláról fellépő feszültségkülönbség hatására a DNS/RNS szálak egy bizonyos ponton áthaladnak a nanopóruscsatorna fehérjén. mérték.A DNS/RNS szálon lévő különböző bázisok kémiai tulajdonságainak különbségei miatt, ha egyetlen bázis vagy DNS molekula áthalad a nanopóruscsatornán, az különböző elektromos jelek változását idézi elő.Ezen jelek detektálásával és megfeleltetésével a megfelelő bázistípusok kiszámíthatók, és a sorozat valós idejű detektálása befejezhető.


Szolgáltatás részletei

Demo Eredmény

Szolgáltatás részletei Jellemzők

Felület

Könyvtár mérete

Elméleti adathozam (cellánként)

Egybázisú pontosság

Alkalmazások

Nanopore

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNS-PCR

70-90 Gb/cella

85-92%

SV hívás, De novo, teljes hosszúságú szekvenálás, Iso-Seq, gén annotáció, DNS metiláció kimutatása

Szolgáltatás előnyei

● Több mint 5 éves tapasztalat a PacBio szekvenáló platformon, több ezer lezárt projekttel különböző fajokkal.
● A BMKGENE az Oxford Nanopore hivatalos partnere, kettős platformú RNS/DNS tanúsítvánnyal.
● Léteznek olyan általános szekvenszer-modellek, amelyek teljes felszereléssel és elegendő szekvenálási teljesítménnyel rendelkeznek.
● A Nanopore platformra támaszkodva több mint 10 állati és növényi Denovo-kutatás jelent meg nemzetközileg elismert folyóiratokban.

Mintakövetelmények


Minta típusa

Összeg

Koncentráció (Qubit ®)

Hangerő

Tisztaság

Mások

Genomi DNS

Adatigénytől függően

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Tiszta csúcs 260 nm-en, nincs szennyeződés

A koncentrációt Qubit és Qubit/Nanopore ≤ 2 értékkel kell mérni

Teljes RNS

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5;nincs szennyeződés

RIN érték ≥7,5

 

Szolgáltatási munkafolyamat

minta előkészítése

Minta előkészítés

Könyvtár előkészítése

Könyvtárépítés

Sorrendezés

Sorrendezés

Adatelemzés

Adatelemzés

Minta minőségellenőrzés

Projekt szállítás


  • Előző:
  • Következő:

  • A DNS-minta adatminőség-értékelése

    1. táblázat: A tiszta adatok statisztikái.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    tisztaN50Len

    tisztaN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1,218,239

    26.37

    1,121,736

    25.90

    28,014

    15,764

    23 090

    143,181

    9

    Az RNS-minta adatminőség-értékelése

    1. táblázat: A tiszta adatok statisztikái.

    Fájl név

    Ügyfélazonosító

    ReadNum

    Alapszám

    N50

    MeanLength

    MaxLength

    MeanQscore

    RNA_BMK001

    C2

    8,947,708

    4,047,230,083

    398

    452

    129,227

    Q12

    1. ábra: Olvassa el a hosszeloszlást

    A3

    2. ábra A tiszta adatok minőségi pontszám eloszlása

    A4

    3. ábra Tiszta adatok hossz- és minőségi pontszám-eloszlása

    A5

    kérjen árajánlatot

    Írja ide üzenetét és küldje el nekünk

    Küldje el nekünk üzenetét: