Termékek

Gombás genom

A Biomarker Technologies a konkrét kutatási céltól függően biztosítja a gombák genomfelmérését, finom genomját és pene-teljes genomját.A genom szekvenálása, összeállítása és funkcionális annotációja a következő generációs szekvenálás + harmadik generációs szekvenálás kombinálásával érhető el a magas szintű genom összeállítás érdekében.A Hi-C technológia a genom kromoszóma szintű összeállításának megkönnyítésére is használható.

Felület:PacBio folytatása II

Nanopore PromethION P48

Illumina NovaSeq platform

Lépjen kapcsolatba velünk

Szolgáltatás részletei

Demo eredmények

Szolgáltatás előnyei

● Többféle szekvenálási stratégia áll rendelkezésre a különböző kutatási célokhoz

● Nagy tapasztalattal rendelkezik a gombák genomjának összeállításában, több mint 10 000 pén-komplett genommal.

● Professzionális értékesítés utáni technikai támogatási csapat, amely konkrétabb kutatási igényeket teljesít.

Szolgáltatási specifikációk

Szolgáltatás	Szekvenálási stratégia	Garantált minőség	Becsült átfutási idő
Gombás finom térkép	Illumina 50X+Nanopore 100X	Contig N50≥2 Mb	35 munkanap
Gombás finom térkép	PacBio HiFi 30X	Contig N50≥2 Mb	35 munkanap
Gombás pene-teljes térkép	Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X	A kromoszómák rögzítési aránya >90%	45 munkanap

Bioinformatikai elemzések

● Nyers adatok minőségének ellenőrzése

● Genom összeállítás

● Genomkomponens elemzés

● Génfüggvény annotáció

● Összehasonlító genomikai elemzés

Mintakövetelmények és szállítás

Mintakövetelmények:

MertDNS-kivonatok:

Minta típusa	Összeg	Koncentráció	Tisztaság
DNS-kivonatok	＞ 1,2 μg	＞ 20 ng/μl	OD260/280 = 1,6-2,5

Szövetmintákhoz:

Minta típusa

Javasolt mintakezelés

Mintatárolás és szállítás

Egysejtű gomba

Figyelje meg az élesztőt mikroszkóp alatt, és gyűjtse össze exponenciális fázisukban

Tegye át a tenyészetet (amely kb. 3-4,5e9 sejtet tartalmaz) egy 1,5 vagy 2 ml-es eppendorfba.(Maradj a jégen)

Centrifugálja a csövet 1 percig 14000 g-vel, hogy összegyűjtse a baktériumokat, és óvatosan távolítsa el a felülúszót

Zárja le a csövet, és fagyassza le a baktériumokat folyékony nitrogénben legalább 1-3 órán keresztül.Tárolja a csövet -80 ℃-os hűtőszekrényben.

Fagyassza le a mintákat folyékony nitrogénben 3-4 órára, és tárolja folyékony nitrogénben vagy -80 fokos hosszú távú foglalásig.Szárazjéggel történő mintaszállítás szükséges.

Makró gomba

Az aktív növekedési fázisban lévő szövetek használata javasolt.

Öblítse le a szövetet endotoxin-mentes vízzel, majd 70%-os etonal.

Mentse a mintát krio-csövekbe.