Hosszú, nem kódoló szekvencia-Illumina
Szolgáltatás előnyei
●Az mRNS és az lncRNS együttes elemzése: az mRNS-transzkriptumok mennyiségi meghatározását az lncRNS és célpontjaik vizsgálatával kombinálva mélyreható áttekintést kaphatunk a sejtes válasz mögött meghúzódó szabályozó mechanizmusról.
●Széleskörű Szakértelem: Csapatunk rengeteg tapasztalattal rendelkezik minden projektben, több mint 23 000 minta feldolgozásával a BMK-ban, amelyek különböző mintatípusokat és lncRNA projekteket ölelnek fel.
●Szigorú minőségellenőrzés: Az alapvető ellenőrzési pontokat minden szakaszban megvalósítjuk, a minta- és könyvtár-előkészítéstől a szekvenálásig és a bioinformatikáig. Ez az aprólékos ellenőrzés biztosítja a folyamatosan jó minőségű eredményeket.
●Értékesítés utáni támogatás: Elkötelezettségünk túlmutat a projekt befejezésén, 3 hónapos értékesítés utáni szolgáltatási időszakkal. Ez idő alatt projektkövetést, hibaelhárítási segítséget és kérdés-feleleteket kínálunk az eredményekkel kapcsolatos kérdések megválaszolásához.
Mintakövetelmények és szállítás
| Könyvtár | Platform | Ajánlott adatok | Adatok minőségellenőrzése |
| rRNS kimerült irányított könyvtár | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Nukleotidok:
| Konc. (ng/μl) | Mennyiség (μg) | Tisztaság | Integritás |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 A gélen korlátozott fehérje- vagy DNS-szennyeződés látható, vagy nincs. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; korlátozott vagy nincs alapvonali emelkedés |
● Növények:
Gyökér, szár vagy szirom: 450 mg
Levél vagy mag: 300 mg
Gyümölcs: 1,2 g
● Állat:
Szív vagy bél: 450 mg
Zsigerek vagy agy: 240 mg
Izom: 600 mg
Csontok, haj vagy bőr: 1,5 g
● Ízeltlábúak:
Rovarok: 9g
Rákfélék: 450 mg
● Teljes vér:2 cső
● Sejtek: 106 sejteket
● Szérum és plazma: 6 ml
Javasolt mintaszállítás
Tartály: 2 ml-es centrifugacső (ón fólia nem ajánlott)
Mintacímkézés: Csoport+másolat pl. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Szállítás:
1. Szárazjég: A mintákat zsákokba kell csomagolni, és szárazjégbe kell temetni.
2. RNS-stabil csövek: Az RNS-minták RNS-stabilizáló csőben (pl. RNAstable®) száríthatók és szobahőmérsékleten szállíthatók.
Szerviz munkafolyamat
Kísérleti tervezés
Mintaszállítás
RNS extrakció
Könyvtárépítés
Sorrendezés
Adatelemzés
Értékesítés utáni szolgáltatások
Bioinformatika
Differential Gene Expression (DEG) elemzés
Az lncRNS expresszió mennyiségi meghatározása – klaszterezés
LncRNS célgének dúsítása
Közös mRNS és lncRNS helyzetelemzés – Circos diagram (a középső kör az mRNS, a belső kör az lncRNS)
Fedezze fel a BMKGene lncRNS kiegyenlítő szolgáltatásai által elősegített előrelépéseket egy válogatott kiadványgyűjtemény segítségével.
Ji, H. et al. (2020) „Hidegstresszel kapcsolatos lncRNS-ek azonosítása, funkcionális előrejelzése és kulcsfontosságú lncRNS-ellenőrzése patkányok májában”, Scientific Reports 2020, 10:1, 10(1), 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) „Az integratív transzkriptomikai elemzés feltárja a CyHV-3-rezisztens közönséges pontytörzs immunmechanizmusát”, Frontiers in Immunology, 12., p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) „Versengő endogén RNS-szabályozási hálózatok multi-omika integráción alapuló prioritása kissejtes tüdőrákban: molekuláris jellemzők és gyógyszerjelöltek”, Frontiers in Oncology, 12. o. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) „A Populus fotoszintézisének hátterében álló génkoexpressziós hálózat genetikai boncolása”, Plant Biotechnology Journal, 18(4), 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) „Global Regulatory Network for Disregulated Gene Expression and Abnormal Metabolic Signaling in Immune Cells in the Microenvironment of Graves's Disease and Hashimoto Thyroiditis”, Frontiers in Immunology, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
