● Az rRNS kimerülése, majd az irányított mRNS könyvtár előkészítése.
● Szekvenálás az Illumina Novaseq -en.
●Vizsgálja meg a komplex mikrobiális közösségek változásait:Ez a transzkripciós szinten történik, és feltárja a potenciális új géneket.
●A mikrobiális közösségi interakciók magyarázata a gazdaszervezet vagy a környezettel.
●Átfogó bioinformatikai elemzés: Ez betekintést nyújt a közösségi taxonómiai és funkcionális kompozíciókba, valamint a differenciális génexpressziós elemzésbe.
●Kiterjedt gén kommentár:A legfrissebb génfunkciós adatbázisok felhasználása a mikrobiális közösségek informatív génexpressziós információinak felhasználására.
●Az értékesítés utáni támogatás:Elkötelezettségünk a projekt befejezésén túlmutat, egy 3 hónapos értékesítés utáni szolgáltatási periódussal. Ez idő alatt a projekt nyomon követését, hibaelhárítási támogatást és Q & A üléseket kínálunk az eredményekkel kapcsolatos kérdések kezelésére.
Szekvenálási platform | Szekvenálási stratégia | Az ajánlott adatok | Adatminőség -ellenőrzés |
Illumina Novaseq | PE150 | 12 GB -os | Q30 ≥85% |
Koncentráció (ng/µl) | Teljes összeg (µg) | Térfogat (µL) | OD260/280 | OD260/230 | Rin |
≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6,5 |
Tartalmazza a következő elemzést:
● Az adatminőség -ellenőrzés szekvenálása
● Átirat szerelvény
● taxonómiai kommentár és bőség
● Funkcionális kommentár és bőség
● expressziós számszerűsítés és differenciális elemzés
Az egyes minták taxonómiai eloszlása:
Béta sokféleség -elemzés: UPGMA
Funkcionális annotáció - Go bőség
Differenciális taxonómia bősége - Lefse
Fedezze fel a BMKGene Meta Transcriptomics Sequencing Services által elősegített előrelépéseket a publikációk kurátus gyűjteményén keresztül.
Lu, Z. et al. (2023) „A Bacteroidales elrendelésével rendelkező laktát-kihúzódó baktériumok savtoleranciája hozzájárul a nagy koncentrált étrendhez alkalmazott kecskék puminal acidózis megelőzéséhez”,Állati táplálkozás, 14, 130–140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) „Az alapvető funkcionális mikrobiota feltárása a hagyományos szilárdtest fermentációban nagy áteresztőképességű amplikonok és metatranscriptomics szekvenálással”,Határok a mikrobiológiában, 8 (július). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/teljes.
Wang, W. et al. (2022) „A fitopatogén alternaria gomba metatranscriptomics felméréséből felfedezett új mycovírusok”,Vírusok, 14 (11), p. 2552. Doi: 10.3390/v14112552/s1.
Wei, J. et al. (2022) „A párhuzamos metatranszkriptomanalízis feltárja a növény szekunder metabolitjainak bogarak és bél szimbólumok általi lebomlását”,Molekuláris Ökológia, 31 (15), 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.