mRNS-szekvenálás (NGS) – De novo

Az mRNS-szekvenálás lehetővé teszi az összes mRNS-transzkriptum profilalkotását a sejtekben specifikus körülmények között, és széles körben használt technológia számos kutatási területen. A BMKCloud De novo mRNA-seq folyamatot poli-A-val dúsított szekvenálási könyvtárak elemzésére tervezték, amikor nem áll rendelkezésre referencia genom. A folyamat a minőségellenőrzéssel kezdődik, majd...de novotranszkriptum-összeállítás és unigén-készlet kiválasztása. Az unigén-szerkezet-elemzés a kódoló szekvenciát (CDS) és az egyszerű szekvencia-ismétlődéseket (SSR) jósolja meg. Ezt követően a differenciális expressziós analízis a tesztelt körülmények között differenciálisan expresszált géneket (DEG) talál, majd a DEG-ek funkcionális annotációja és dúsítása következik a biológiai információk kinyerése érdekében.