BMKCloud Log in
条形 banner-03

Ապրանքներ

10x Genomics Visium Spatial Transcriptome

Տարածական տրանսկրիպտոմիկան նորագույն տեխնոլոգիա է, որը թույլ է տալիս հետազոտողներին ուսումնասիրել գեների արտահայտման ձևերը հյուսվածքներում՝ պահպանելով դրանց տարածական համատեքստը:Այս տիրույթում հզոր հարթակներից մեկը 10x Genomics Visium-ն է՝ զուգորդված Illumina հաջորդականությամբ:10X Visium-ի սկզբունքը ընկած է մասնագիտացված չիպի վրա՝ հատուկ գրավման տարածքով, որտեղ տեղադրվում են հյուսվածքների հատվածները:Այս գրավման տարածքը պարունակում է շտրիխ կոդավորված բծեր, որոնցից յուրաքանչյուրը համապատասխանում է հյուսվածքի ներսում եզակի տարածական դիրքին:Հյուսվածքից գրավված ՌՆԹ մոլեկուլները այնուհետև պիտակավորվում են եզակի մոլեկուլային նույնացուցիչներով (UMIs) հակադարձ տառադարձման գործընթացում:Այս շտրիխ կոդավորված բծերը և UMI-ները հնարավորություն են տալիս ճշգրիտ տարածական քարտեզագրում և գեների արտահայտման քանակականացում մեկ բջջի լուծաչափով:Տարածական շտրիխ կոդավորված նմուշների և UMI-ների համադրությունն ապահովում է ստեղծվող տվյալների ճշգրտությունն ու առանձնահատկությունը:Օգտագործելով այս Spatial Transcriptomics տեխնոլոգիան՝ հետազոտողները կարող են ավելի խորը պատկերացում կազմել բջիջների տարածական կազմակերպման և հյուսվածքների ներսում տեղի ունեցող բարդ մոլեկուլային փոխազդեցությունների մասին՝ առաջարկելով անգնահատելի պատկերացումներ բազմաթիվ ոլորտներում կենսաբանական գործընթացների հիմքում ընկած մեխանիզմների մասին՝ ներառյալ ուռուցքաբանությունը, նյարդաբանությունը, զարգացման կենսաբանությունը, իմունոլոգիան: , և բուսաբանական ուսումնասիրություններ։

Պլատֆորմ՝ 10X Genomics Visium և Illumina NovaSeq


  • FOB Գին:ԱՄՆ $ 0,5 - 9,999 / հատ
  • Min.Order Քանակ:100 հատ/կտոր
  • Մատակարարման հնարավորություն:10000 հատ/կտոր ամսական
  • Ծառայության մանրամասները

    Կենսաինֆորմատիկա

    Դեմո արդյունքներ

    Առաջարկվող հրապարակումներ

    Հատկություններ

    ● Բանաձևը՝ 100 մկՄ

    ● Կետի տրամագիծը՝ 55 մկՄ

    ● Բծերի քանակը՝ 4992

    ● Նկարահանման տարածքը՝ 6,5 x 6,5 մմ

    ● Յուրաքանչյուր շտրիխ կոդավորված կետ բեռնված է 4 հատվածից կազմված այբբենարաններով.

    - պոլի(dT) պոչ՝ mRNA պրիմինգի և cDNA սինթեզի համար

    - Եզակի մոլեկուլային նույնացուցիչ (UMI) ուժեղացման կողմնակալությունը շտկելու համար

    - Տարածական շտրիխ կոդ

    - Մասնակի ընթերցված 1 հաջորդականացման այբբենարանի պարտադիր հաջորդականությունը

    ● հատվածների H&E ներկում

    Առավելությունները

    Մեկ կանգառի ծառայությունինտեգրում է փորձի և հմտությունների վրա հիմնված բոլոր քայլերը, ներառյալ կրիո-հատումը, ներկումը, հյուսվածքների օպտիմալացումը, տարածական շտրիխ կոդավորումը, գրադարանի պատրաստումը, հաջորդականությունը և կենսաինֆորմատիկան:

    ● Բարձր որակավորում ունեցող տեխնիկական թիմավելի քան 250 հյուսվածքների տեսակների և 100+ տեսակների փորձով, ներառյալ մարդ, մուկ, կաթնասուն, ձուկ և բույսեր:

    Իրական ժամանակի թարմացում ամբողջ նախագծի վերաբերյալ: Փորձարարական առաջընթացի լիակատար վերահսկողությամբ:

    Համապարփակ ստանդարտ կենսաինֆորմատիկա.փաթեթը ներառում է 29 անալիզ և 100+ բարձրորակ թվեր:

    Անհատականացված տվյալների վերլուծություն և վիզուալիզացիա: հասանելի է տարբեր հետազոտական ​​հարցումների համար:

    Ընտրովի համատեղ վերլուծություն Single-cell mRNA հաջորդականությամբ

    Տեխնիկական պայմաններ

    Նմուշի պահանջներ

    Գրադարան

    Հերթականության ռազմավարություն

    Առաջարկվող տվյալներ

    Որակի հսկողություն

    OCT-ներկառուցված կրիոյի նմուշներ, FFPE նմուշներ

    (Օպտիմալ տրամագիծը՝ մոտավորապես 6x6x6 մմ3)

    3 բլոկ մեկ նմուշի համար

    10X Visium cDNA գրադարան

    Illumina PE150

    50K PE ընթերցում մեկ տեղում

    (60 Գբ)

    RIN> 7

    Նմուշի պատրաստման ուղեցույցի և սպասարկման աշխատանքի ընթացքի վերաբերյալ լրացուցիչ մանրամասների համար խնդրում ենք ազատ զգալ զրուցել a

    Ծառայությունների աշխատանքային հոսք

    Նմուշի պատրաստման փուլում կատարվում է նախնական զանգվածային ՌՆԹ-ի արդյունահանման փորձարկում՝ ապահովելու բարձրորակ ՌՆԹ-ի ստացումը:Հյուսվածքների օպտիմալացման փուլում հատվածները ներկվում և պատկերացվում են, իսկ մՌՆԹ-ի հյուսվածքից ազատվելու համար թափանցելիության պայմանները օպտիմիզացված են:Այնուհետև օպտիմիզացված արձանագրությունը կիրառվում է գրադարանի կառուցման ժամանակ, որին հաջորդում է հաջորդականությունը և տվյալների վերլուծությունը:

    Ծառայությունների ամբողջական աշխատանքային հոսքը ներառում է իրական ժամանակի թարմացումներ և հաճախորդի հաստատումներ՝ արձագանքող հետադարձ կապը պահպանելու համար՝ ապահովելով նախագծի անխափան կատարումը:

    图片4

  • Նախորդը:
  • Հաջորդը:

  • 10x (9)

     

    Ներառում է հետևյալ վերլուծությունը.

     Տվյալների որակի վերահսկում.

    o Տվյալների թողարկում և որակի գնահատականի բաշխում

    o Գենի հայտնաբերում յուրաքանչյուր կետում

    o Հյուսվածքների ծածկույթ

     Ներքին նմուշի վերլուծություն.

    o Գենային հարստություն

    o Կետերի կլաստերավորում, ներառյալ կրճատված չափերի վերլուծություն

    o Դիֆերենցիալ արտահայտման վերլուծություն կլաստերների միջև. մարկերային գեների նույնականացում

    o Մարկերային գեների ֆունկցիոնալ անոտացիա և հարստացում

     Միջխմբային վերլուծություն

    o Բծերի վերամիավորում երկու նմուշներից (օրինակ՝ հիվանդ և հսկողություն) և նորից կլաստերից

    o Մարկերային գեների նույնականացում յուրաքանչյուր կլաստերի համար

    o Մարկերային գեների ֆունկցիոնալ անոտացիա և հարստացում

    o Խմբերի միջև նույն կլաստերի դիֆերենցիալ արտահայտությունը

    Ներքին նմուշի վերլուծություն

    Կետերի կլաստերավորում

    10x (10)

     

    Մարկերային գեների նույնականացում և տարածական բաշխում

     

    10x (12)

    10x (11)

     

    Միջխմբային վերլուծություն

    Տվյալների համակցություն երկու խմբերից և նորից կլաստեր

    10x (13)

     

     

    Նոր կլաստերների մարկերային գեներ

    图片5

    Բացահայտեք BMKGene-ի տարածական տրանսկրիպտոմիկայի ծառայության առաջխաղացումները 10X Visium-ի կողմից այս ցուցադրված հրապարակումներում.

    Chen, D. et al.(2023) «mthl1, կաթնասունների կպչուն GPCR-ների Drosophila-ի պոտենցիալ հոմոլոգ, ներգրավված է ճանճերի մեջ ներարկված օնկոգեն բջիջների հակաուռուցքային ռեակցիաներում», Ամերիկայի Միացյալ Նահանգների Գիտությունների ազգային ակադեմիայի Proceedings, 120(30), էջ.e2303462120.doi: /10.1073/pnas.2303462120

    Chen, Y. et al.(2023) «STEEL-ը թույլ է տալիս բարձր լուծաչափով սահմանազատել տարածական ժամանակային տրանսկրիպտոմային տվյալները», «Briefings in Bioinformatics», 24(2), էջ 1–10:doi՝ 10.1093/BIB/BBAD068:

    Liu, C. et al.(2022) «Օրգանոգենեզի տարածական ատլաս խոլորձի ծաղիկների զարգացման մեջ», Nucleic Acids Research, 50 (17), էջ 9724–9737:doi՝ 10.1093/NAR/GKAC773:

    Wang, J. et al.(2023) «Integrating Spatial Transcriptomics and Single-nucleus RNA Sequencing Reveals the Potential Therapeutic Strategies for Uterine Leiomyoma», International Journal of Biological Sciences, 19(8), էջ 2515–2530:doi՝ 10.7150/IJBS.83510:

    ստանալ մեջբերում

    Գրեք ձեր հաղորդագրությունը այստեղ և ուղարկեք այն մեզ

    Ուղարկեք ձեր հաղորդագրությունը մեզ.