-
PacBio- Ամբողջական տրանսկրիպտոմ (ոչ հղում)
Amplicon (16S/18S/ITS) հարթակը մշակված է մանրէների բազմազանության նախագծի վերլուծության տարիների փորձով, որը պարունակում է ստանդարտացված հիմնական վերլուծություն և անհատականացված վերլուծություն. և վերլուծության արդյունքները ներկայացվում են ծրագրի հաշվետվությունների տեսքով.Անհատականացված վերլուծության բովանդակությունը բազմազան է:Նմուշները կարող են ընտրվել, և պարամետրերը կարող են ճկուն կերպով սահմանվել՝ համաձայն հիմնական վերլուծության զեկույցի և հետազոտության նպատակի՝ անհատականացված պահանջներն իրականացնելու համար:Windows օպերացիոն համակարգ՝ պարզ և արագ։
-
PacBio- Ամբողջական տրանսկրիպտոմ (ոչ հղում)
Որպես մուտքագրում ընդունելով Pacific Biosciences (PacBio) իզոֆորմային հաջորդականության տվյալները՝ այս հավելվածը կարող է նույնականացնել ամբողջական տառադարձման հաջորդականությունները (առանց հավաքման):Հղման գենոմի վրա ամբողջ երկարությամբ հաջորդականությունները քարտեզագրելով՝ տառադարձումները կարող են օպտիմիզացվել հայտնի գեների, տառադարձումների, կոդավորման շրջանների և այլնի միջոցով:NGS տրանսկրիպտոմի հաջորդականության տվյալների հետ համատեղ վերլուծությունը հնարավորություն է տալիս ավելի համապարփակ անոտացիա և արտահայտման ավելի ճշգրիտ քանակականացում տառադարձման մակարդակում, ինչը մեծապես օգուտ է տալիս ներքևի դիֆերենցիալ արտահայտմանը և ֆունկցիոնալ վերլուծությանը:
-
Գործիքներ
BMKCloud-ը առաջատար բիոինֆորմատիկ հարթակ է, որը տրամադրում է միանվագ լուծում գենոմային ծրագրերի համար, որին լայնորեն վստահում են հետազոտողները տարբեր ասպարեզներում, ներառյալ բժշկական, գյուղատնտեսական, բնապահպանական և այլն: , հաշվողական ռեսուրսներ, հանրային տվյալների բազա, բիոինֆորմատիկ առցանց դասընթացներ և այլն: BMKCloud-ն ունի տարբեր հաճախ օգտագործվող բիոինֆորմատիկ գործիքներ, որոնք ներառում են գեների անոտացիա, էվոլյուցիոն գենետիկ գործիքներ, ncRNA, տվյալների որակի վերահսկում, հավաքում, հավասարեցում, տվյալների արդյունահանում, մուտացիաներ, վիճակագրություն, պատկերների գեներատոր, հաջորդականություն: վերլուծություն և այլն:
-
փոքր ՌՆԹ
Փոքր ՌՆԹ-ները 18-30 նտ միջին երկարությամբ կարճ ոչ կոդավորող ՌՆԹ-ի տեսակ են, ներառյալ miRNA, siRNA և piRNA:Այս փոքր ՌՆԹ-ները զանգվածաբար ներգրավված են կենսաբանական տարբեր գործընթացներում, ինչպիսիք են mRNA-ի քայքայումը, թարգմանության արգելակումը, հետերոքրոմատինի ձևավորումը և այլն: հաջորդականության վերլուծության հարթակը բաղկացած է ստանդարտ վերլուծությունից և առաջադեմ տվյալների արդյունահանումից:RNA-seq տվյալների հիման վրա ստանդարտ վերլուծությունը կարող է հասնել miRNA-ի նույնականացման և կանխատեսման, miRNA-ի թիրախային գենի կանխատեսման, անոտացիայի և արտահայտման վերլուծության:Ընդլայնված վերլուծությունը հնարավորություն է տալիս հարմարեցված miRNA որոնում և արդյունահանում, Venn դիագրամի ստեղծում, miRNA և թիրախային գենային ցանցի ստեղծում:
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS-ը գենոմի վերահերթականավորման վերլուծության հարթակ է, որը մշակվել է Biomarker Technologies-ի հարուստ փորձի հիման վրա:Այս հեշտ օգտագործման հարթակը թույլ է տալիս արագ ներկայացնել ինտեգրված վերլուծության աշխատանքային հոսք՝ պարզապես մի քանի հիմնական պարամետր դնելով, որը համապատասխանում է ԴՆԹ-ի հաջորդականացման տվյալներին, որոնք ստեղծվել են ինչպես Illumina հարթակից, այնպես էլ BGI հաջորդականության հարթակից:Այս հարթակը տեղակայված է բարձր արդյունավետությամբ հաշվողական սերվերի վրա, որը թույլ է տալիս շատ սահմանափակ ժամանակում տվյալների բարձր արդյունավետ վերլուծություն:Անհատականացված տվյալների արդյունահանումը հասանելի է ստանդարտ վերլուծության հիման վրա, ներառյալ մուտացված գենի հարցումը, PCR այբբենարանի ձևավորումը և այլն:
-
mRNA (Հղում)
Տրանսկրիպտոմը կապն է գենոմային գենետիկական տեղեկատվության և կենսաբանական ֆունկցիայի պրոտեոմի միջև:Տրանսկրիպցիոն մակարդակի կարգավորումը օրգանիզմների կարգավորման ամենակարևոր և ամենալայն ուսումնասիրված եղանակն է։Տրանսկրիպտոմի հաջորդականությունը կարող է հաջորդականացնել տրանսկրիպտոմը ժամանակի ցանկացած պահի կամ ցանկացած պայմաններում՝ մեկ նուկլեոտիդին ճշգրիտ լուծմամբ: Այն կարող է դինամիկ կերպով արտացոլել գեների տրանսկրիպցիայի մակարդակը, միաժամանակ բացահայտել և քանակականացնել հազվագյուտ և նորմալ տառադարձումները և տրամադրել կառուցվածքային տեղեկատվություն: նմուշառման հատուկ արտագրություններ.
Ներկայումս տրանսկրիպտոմների հաջորդականացման տեխնոլոգիան լայնորեն օգտագործվում է ագրոնոմիայի, բժշկության և այլ հետազոտական ոլորտներում, ներառյալ կենդանիների և բույսերի զարգացման կարգավորումը, շրջակա միջավայրի հարմարեցումը, իմունային փոխազդեցությունը, գեների տեղայնացումը, տեսակների գենետիկական էվոլյուցիան և ուռուցքների ու գենետիկական հիվանդությունների հայտնաբերումը:
-
Մետագենոմիկա (NGS)
Այս վերլուծության հարթակը նախատեսված է որսորդական հրացանի մետագենոմիկ տվյալների վերլուծության համար՝ տարիների փորձի հիման վրա:Այն բաղկացած է ինտեգրված աշխատանքային հոսքից, որը պարունակում է մետագենոմիկայի տարբեր վերլուծություններ, ներառյալ տվյալների մշակումը, տեսակների մակարդակի ուսումնասիրությունները, գեների ֆունկցիայի մակարդակի ուսումնասիրությունները, մետագենոմների բինինգը և այլն։ , պարամետրերի կարգավորում, անհատականացված թվերի գեներացում և այլն:
-
LncRNA
Երկար չկոդավորող ՌՆԹ-ները (lncRNA) 200 նտ-ից ավելի երկարությամբ տառադարձումների մի տեսակ են, որոնք չեն կարողանում կոդավորել սպիտակուցները։Կուտակված ապացույցները ցույց են տալիս, որ lncRNA-ների մեծ մասը շատ հավանական է ֆունկցիոնալ լինել:Բարձր թողունակության հաջորդականության տեխնոլոգիաները և բիոինֆորմատիկ վերլուծության գործիքները մեզ հնարավորություն են տալիս բացահայտելու lncRNA հաջորդականությունները և տեղորոշման տեղեկատվությունը ավելի արդյունավետ և առաջնորդում մեզ բացահայտելու կարևոր կարգավորիչ գործառույթներով lncRNAs:BMKCloud-ը հպարտ է մեր հաճախորդներին տրամադրել lncRNA հաջորդականության վերլուծության հարթակ՝ արագ, հուսալի և ճկուն lncRNA վերլուծության հասնելու համար:
-
GWAS
Գենոմի լայն ասոցիացիայի ուսումնասիրությունը (GWAS) նպատակ ունի բացահայտելու գենետիկ տարբերակները (գենոտիպ), որոնք կապված են հատուկ հատկությունների (ֆենոտիպի) հետ:GWA-ի ուսումնասիրությունները ուսումնասիրում են գենետիկական մարկերները, որոնք հատում են մեծ թվով անհատների ամբողջ գենոմը և կանխատեսում են գենոտիպ-ֆենոտիպ ասոցիացիաները՝ բնակչության մակարդակով վիճակագրական վերլուծության միջոցով:Ամբողջ գենոմի հաջորդականությունը կարող է պոտենցիալ բացահայտել բոլոր գենետիկ տարբերակները:Ֆենոտիպային տվյալների հետ զուգակցվելով՝ GWAS-ը կարող է մշակվել՝ բացահայտելու ֆենոտիպին առնչվող SNP-ները, QTL-ները և թեկնածու գեները, որոնք մեծապես պաշտպանում են ժամանակակից կենդանիների/բույսերի բուծումը:SLAF-ը ինքնուրույն մշակված պարզեցված գենոմի հաջորդականության ռազմավարություն է, որը բացահայտում է գենոմի ամբողջ բաշխված մարկերները՝ SNP:Այս SNP-ները, որպես մոլեկուլային գենետիկական մարկերներ, կարող են մշակվել նպատակային հատկանիշներով ասոցիացիայի ուսումնասիրությունների համար:Դա ծախսարդյունավետ ռազմավարություն է գենետիկական տատանումների հետ կապված բարդ հատկանիշները բացահայտելու համար:
-
Nanopore Ամբողջական տրանսկրիպտոմիկա
Օրգանիզմների բարդ և փոփոխական այլընտրանքային իզոֆորմները կարևոր գենետիկ մեխանիզմներ են գեների արտահայտման և սպիտակուցների բազմազանությունը կարգավորելու համար:Տրանսկրիպտի կառուցվածքների ճշգրիտ նույնականացումը հիմք է հանդիսանում գեների արտահայտման կարգավորման օրինաչափությունների խորը ուսումնասիրության համար:Nanopore հաջորդականության հարթակը հաջողությամբ հասցրել է տրանսկրիպտոմիական ուսումնասիրությունը իզոֆորմի մակարդակի:Այս վերլուծության հարթակը նախագծված է վերլուծելու RNA-Seq տվյալները, որոնք ստեղծվել են Nanopore հարթակի վրա՝ հղման գենոմի հիման վրա, որը հասնում է որակական և քանակական վերլուծությունների ինչպես գենային մակարդակի, այնպես էլ տառադարձումների մակարդակով:
