ԴՆԹ / RNA Sequencing - Nanopore Sequencer
Ծառայությունների մանրամասների առանձնահատկությունները
| Պլատֆորմ | Գրադարանի չափը | Տեսական տվյալների բերքատվությունը (մեկ խցում) | Մեկ-բազային ճշգրտություն | Ծրագրեր |
| Նանոբոր | 8KB, 10KB, 20KB, Ultralong, CDNA-PCR | 70-90 Գբ / բջիջ | 85-92% | SV Calling, De Novo, Full-Thene Sequencing, ISO-SEQ, Gene ծանոթագրություն, ԴՆԹ մեթիլացիայի հայտնաբերում |
Ծառայության առավելություններ
● PacBio Sequencing Platform- ի ավելի քան 5 տարվա փորձ, հազարավոր փակ նախագծերով `տարբեր տեսակների հետ:
● BMKGene- ը Օքսֆորդի նանոպորի պաշտոնական գործընկերն է, RNA / DNA սերտիֆիկացման երկակի հարթակ:
● Կան հերթագայլերի հիմնական մոդելներ, ամբողջական սարքավորումներով եւ բավարար հաջորդականությամբ:
NanoPore պլատֆորմի հիման վրա միջազգային հանրաճանաչ ամսագրերում լույս են տեսել ավելի քան 10 կենդանական եւ բուսական հետազոտություններ:
Նմուշի պահանջներ
| Նմուշի տեսակը | Գումար | Համակենտրոնացում (Qubit ®) | Ծավալ | Մաքրություն | Ուրիշներ |
| Գենոմ ԴՆԹ | Կախված տվյալների պահանջից | ≥20ng / μL | ≥15μl | OD260 / 280 = 1.7-2.2; OD260 / 230≥1.5; Մաքրել գագաթը 260 նմ, ոչ աղտոտում | Համակենտրոնացումը պետք է չափվի Qubit- ի եւ QUBIT- ի կողմից / Nanopore ≤ 2 |
| Ընդհանուր RNA | ≥1.2% | ≥100μg / μL | ≥15μl | OD260 / 280 = 1.7-2.5; OD260 / 230 = 0.5-2.5; ոչ աղտոտում | Rin արժեքը ≥7.5 |
Ծառայության աշխատանքային հոսք
Նմուշի պատրաստում
Գրադարանների կառուցում
Հաջորդականացում
Տվյալների վերլուծություն
Ծրագրի առաքում
ԴՆԹ-ի նմուշի տվյալների որակի գնահատում
Աղյուսակ 1: Մաքուր տվյալների վիճակագրությունը:
| Բթամիտ | rawseqnum | rawsumbase | Cleanseqnum | Cleansumbase | Cleann50Len | Cleann90Len | Մաքրող միջոց | Cleanmaxlen | Մաքուրմա |
| DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
RNA նմուշի տվյալների որակի գնահատում
Աղյուսակ 1: Մաքուր տվյալների վիճակագրությունը:
| Անվանել | Հաճախորդ | Ընթերցանություն | Բազեն | N50 | Միջին երկարություն | Maxl երկարություն | Ընդօրինակող |
| Rna_bmk001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
Գծապատկեր 1. Կարդացեք երկարության բաշխումը
Գծապատկեր 2. Մաքուր տվյալների որակի գնահատման բաշխում
Գծապատկեր 3. Մաքուր տվյալների երկարության եւ որակի գնահատման բաշխում
