-
Քրոմատինի իմունային տեղումների հաջորդականություն (ChIP-seq)
ChIP-Seq-ն ապահովում է ԴՆԹ-ի թիրախների գենոմի ողջ պրոֆիլավորումը հիստոնների մոդիֆիկացիայի, տրանսկրիպցիոն գործոնների և ԴՆԹ-ի հետ կապված այլ սպիտակուցների համար:Այն համատեղում է քրոմատինի իմունային տեղումների (ChIP) ընտրողականությունը՝ վերականգնելու հատուկ սպիտակուց-ԴՆԹ համալիրներ, հաջորդ սերնդի հաջորդականության (NGS) հզորությամբ՝ վերականգնված ԴՆԹ-ի բարձր թողունակությամբ հաջորդականացման համար:Բացի այդ, քանի որ սպիտակուց-ԴՆԹ համալիրները վերականգնվում են կենդանի բջիջներից, կապող վայրերը կարող են համեմատվել տարբեր տեսակի բջիջներում և հյուսվածքներում կամ տարբեր պայմաններում:Դիմումները տատանվում են տրանսկրիպցիոն կարգավորումից մինչև հիվանդության մեխանիզմների զարգացման ուղիները և դրանից դուրս:
Հարթակ՝ Illumina NovaSeq 6000
-
Ամբողջ գենոմի բիսուլֆիտի հաջորդականությունը
Ցիտոզինում (5-mC) հինգերորդ դիրքում ԴՆԹ-ի մեթիլացումը հիմնարար ազդեցություն ունի գեների արտահայտման և բջջային ակտիվության վրա:Մեթիլացման աննորմալ ձևերը կապված են մի շարք պայմանների և հիվանդությունների հետ, ինչպիսիք են քաղցկեղը:WGBS-ը դարձել է ոսկե ստանդարտ գենոմի լայնածավալ մեթիլացման ուսումնասիրության համար մեկ բազային լուծաչափով:
Հարթակ՝ Illumina NovaSeq6000
-
Տրանսպոզազային հասանելի քրոմատինի վերլուծություն՝ բարձր թողունակությամբ հաջորդականությամբ (ATAC-seq)
ATAC-seq-ը գենոմի լայնածավալ քրոմատինի հասանելիության վերլուծության բարձր թողունակության հաջորդականության մեթոդ է, որը կարևոր է գեների արտահայտման գլոբալ էպիգենետիկ հսկողության համար:Հերթականացման ադապտերները տեղադրվում են բաց քրոմատինային շրջաններում հիպերակտիվ Tn5 տրանսպոզազայի միջոցով:PCR ուժեղացումից հետո կառուցվում է հաջորդականության գրադարան:Բոլոր բաց քրոմատինային շրջանները կարելի է ձեռք բերել որոշակի տարածա-ժամանակային պայմանով, որը չի սահմանափակվում միայն տառադարձման գործոնի կամ որոշակի հիստոնային մոդիֆիկացված շրջանով կապող վայրերով:
-
Կրճատված ներկայացուցչական բիսուլֆիտի հաջորդականություն (RRBS)
ԴՆԹ մեթիլացման հետազոտությունը միշտ եղել է հիվանդության հետազոտության թեժ թեմա և սերտորեն կապված է գեների արտահայտման և ֆենոտիպային գծերի հետ:RRBS-ը ճշգրիտ, արդյունավետ և խնայող մեթոդ է ԴՆԹ-ի մեթիլացման հետազոտության համար:Պրոմոտորի և CpG կղզու շրջանների հարստացումը ֆերմենտային կտրվածքով (Msp I)՝ զուգորդված բիսուլֆիտի հաջորդականությամբ, ապահովում է բարձր լուծաչափով ԴՆԹ մեթիլացման հայտնաբերում:
Հարթակ՝ Illumina NovaSeq 6000
