Գենոմի ամբողջ ասոցիացիայի վերլուծություն
1.Ծառայության առավելությունները
● Ծրագրի առատ դեպքեր. իր հիմնադրումից ի վեր՝ 2009թ., BMKGENE-ն իրականացրել է հարյուրավոր տեսակների նախագծեր բնակչության GWAS հետազոտության մեջ, օգնել է հետազոտողներին հրապարակել ավելի քան 100 հոդվածներ, և կուտակային ազդեցության գործակիցը հասել է 500-ի:
● Պրոֆեսիոնալ վերլուծաբաններ.
● Կարճ վերլուծության ցիկլ:
● Տվյալների ճշգրիտ մշակում:
2. Ծառայության Տեխնիկական պայմաններ
| Տիպ | Բնակչության սանդղակ | Հերթականության ռազմավարություն և խորություն |
| SLAF-GWAS | Նմուշի համարը ≥200 | Գենոմի չափը < 400M, ռեֆ-գենոմով, խորհուրդ է տրվում WGS |
| Գենոմի չափը ≤ 1G, 100K պիտակներ և 10X | ||
| 1G ≤ Գենոմի չափը ≤ 2G, 200K պիտակներ և 10X | ||
| Գենոմի չափը > 2G, 300K պիտակներ և 10X | ||
| WGS-GWAS | Նմուշի համարը ≥200 | 10X յուրաքանչյուր նմուշի համար |
3. Նյութի ընտրություն
Տարբեր սորտեր, ենթատեսակներ, լանդշաֆտներ/գենբանկեր/խառը ընտանիքներ/վայրի ռեսուրսներ
Տարբեր սորտեր, ենթատեսակներ, լանդշաֆտներ
Half-sib ընտանիք / full-sib ընտանիք / վայրի ռեսուրսներ
4. Կենսատեղեկատվության վերլուծություն
● Գենոմի ամբողջ ասոցիացիայի վերլուծություն
● Նշանակալից SNP-ի վերլուծություն և զննում
● Թեկնածու գենի ֆունկցիոնալ անոտացիա
5. Ծառայությունների աշխատանքային հոսք
Փորձի ձևավորում
Նմուշի առաքում
ՌՆԹ արդյունահանում
Գրադարանի կառուցում
Հերթականություն
Տվյալների վերլուծություն
Վաճառքից հետո ծառայություններ
ա.QC ֆենոտիպ
Հաճախականության բաշխման հիստոգրամ
Ֆենոտիպային վիճակագրություն
բ.Ասոցիացիայի վերլուծություն (մոդել՝ GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ հողամաս
Մանհեթենի սյուժե
| Տարի | Ամսագիր | IF | Կոչում |
| 2022 թ | NC | 17.69 | Paeonia ostii ծառի պիոնի գիգա-քրոմոսոմների և գիգա-գենոմի գենոմային հիմքը |
| 2015թ | NP | 7.43 | Կենցաղային ոտնահետքերը խարսխում են սոյայի ագրոնոմիական նշանակություն ունեցող գենոմային շրջանները |
| 2018 թ | MP | 9.32 | Համաշխարհային մասշտաբով ռեփասերի հավաքածուի ամբողջական գենոմի կրկնությունը բացահայտում է դրանց էկոտիպային տարբերության գենետիկական հիմքերը |
| 2022 թ | HR | 7.29 | Գենոմի ամբողջ ասոցիացիայի վերլուծությունը մոլեկուլային պատկերացումներ է տալիս ձմերուկի սերմի չափի բնական փոփոխության վերաբերյալ |
