-
Բույսերի/Կենդանիների De novo Genome Sequencing
De novoհաջորդականությունը վերաբերում է տեսակի ամբողջ գենոմի կառուցմանը հաջորդականության տեխնոլոգիաների կիրառմամբ, օրինակ՝ PacBio, Nanopore, NGS և այլն՝ հղումային գենոմի բացակայության դեպքում:Երրորդ սերնդի հաջորդականացման տեխնոլոգիաների ընթերցման երկարության զգալի բարելավումը նոր հնարավորություններ է ստեղծել բարդ գենոմների հավաքման հարցում, ինչպիսիք են բարձր հետերոզիգոտություն ունեցողները, կրկնվող շրջանների բարձր հարաբերակցությունը, պոլիպլոիդները և այլն: Տասնյակ կիլոբազաների մակարդակում ընթերցման երկարության դեպքում այս հաջորդականության ընթերցումները հնարավորություն են տալիս կրկնվող տարրերի, աննորմալ GC պարունակությամբ շրջանների և այլ խիստ բարդ շրջանների լուծում:
Պլատֆորմ՝ PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq6000
-
Hi-C հիմնված գենոմի հավաքում
Hi-C-ն մեթոդ է, որը նախատեսված է քրոմոսոմների կոնֆիգուրացիան ֆիքսելու համար՝ համատեղելով զոնդավորման վրա հիմնված փոխազդեցությունները և բարձր թողունակության հաջորդականությունը:Ենթադրվում է, որ այս փոխազդեցությունների ինտենսիվությունը բացասաբար է կապված քրոմոսոմների վրա ֆիզիկական հեռավորության հետ:Հետևաբար, Hi-C տվյալները կարող են ուղղորդել գենոմում հավաքված հաջորդականությունների կլաստերավորումը, դասավորությունը և կողմնորոշումը և դրանք ամրացնելով որոշակի թվով քրոմոսոմների վրա:Այս տեխնոլոգիան հզորացնում է քրոմոսոմային մակարդակի գենոմի հավաքը՝ պոպուլյացիայի վրա հիմնված գենետիկ քարտեզի բացակայության դեպքում:Յուրաքանչյուր գենոմի կարիք ունի Hi-C:
Հարթակ: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Էվոլյուցիոն գենետիկա
Էվոլյուցիոն գենետիկան փաթեթավորված հաջորդականության ծառայություն է, որը նախատեսված է տվյալ նյութերի էվոլյուցիոն տեղեկատվության համապարփակ մեկնաբանություն տրամադրելու համար՝ հիմնված գենետիկ տատանումների վրա, ներառյալ SNP-ները, InDels-ը, SV-ները և CNV-ները:Այն ապահովում է բոլոր հիմնարար վերլուծությունները, որոնք անհրաժեշտ են պոպուլյացիաների էվոլյուցիոն փոփոխությունները և գենետիկական առանձնահատկությունները նկարագրելու համար, ինչպիսիք են պոպուլյացիայի կառուցվածքը, գենետիկական բազմազանությունը, ֆիլոգենային հարաբերությունները և այլն:
-
Համեմատական գենոմիկա
Համեմատական գենոմիկա բառացիորեն նշանակում է համեմատել տարբեր տեսակների գենոմի ամբողջական հաջորդականությունները և կառուցվածքները:Այս կարգապահությունը նպատակ ունի բացահայտելու տեսակների էվոլյուցիան, գեների գործառույթը, գեների կարգավորման մեխանիզմը գենոմի մակարդակում՝ բացահայտելով տարբեր տեսակների մեջ պահպանված կամ տարբերակված հաջորդականության կառուցվածքները և տարրերը:Տիպիկ համեմատական գենոմիկայի ուսումնասիրությունը ներառում է գենային ընտանիքի վերլուծություններ, էվոլյուցիոն զարգացում, ամբողջ գենոմի կրկնօրինակում, ընտրողական ճնշում և այլն:
-
Զանգվածային տարանջատված վերլուծություն
Զանգվածային տարանջատման վերլուծությունը (BSA) տեխնիկա է, որն օգտագործվում է ֆենոտիպին առնչվող գենետիկ մարկերների արագ հայտնաբերման համար:BSA-ի հիմնական աշխատանքային հոսքը ներառում է ծայրահեղ հակադիր ֆենոտիպներով անհատների երկու խմբերի ընտրություն, բոլոր անհատների ԴՆԹ-ի միավորումը՝ ԴՆԹ-ի երկու մեծ մասը ձևավորելու համար, երկու լողավազանների միջև դիֆերենցիալ հաջորդականությունների նույնականացում:Այս տեխնիկան լայնորեն կիրառվել է բույսերի/կենդանական գենոմների թիրախային գեների հետ կապված գենետիկական մարկերների հայտնաբերման համար:
