Metatranscriptome Sequencing
Ծառայության առանձնահատկությունները
● rRNA-ի սպառում, որին հաջորդում է ուղղորդված mRNA գրադարանի պատրաստում:
● Հերթականություն Illumina NovaSeq-ում:
Ծառայության առավելությունները
●Ուսումնասիրեք բարդ մանրէաբանական համայնքների փոփոխությունները.Դա տեղի է ունենում տրանսկրիպցիոն մակարդակում և ուսումնասիրում է հնարավոր նոր գեները:
●Բացատրելով մանրէաբանական համայնքի փոխազդեցությունները հյուրընկալողի կամ շրջակա միջավայրի հետ:
●Համապարփակ բիոինֆորմատիկական վերլուծությունՍա տրամադրում է պատկերացումներ համայնքի տաքսոնոմիական և ֆունկցիոնալ կազմերի, ինչպես նաև գեների դիֆերենցիալ արտահայտման վերլուծության վերաբերյալ:
●Ընդարձակ գենային նշում.Օգտագործելով արդի գենային ֆունկցիաների տվյալների բազաներ՝ մանրէաբանական համայնքների գենային արտահայտման տեղեկատվական տեղեկատվության համար:
●Վաճառքից հետո աջակցություն.Մեր պարտավորությունը տարածվում է ծրագրի ավարտից դուրս՝ վաճառքից հետո սպասարկման 3 ամիս ժամկետով: Այս ընթացքում մենք առաջարկում ենք ծրագրի հետևում, անսարքությունների վերացման օգնություն և հարցուպատասխանի նիստեր՝ արդյունքների հետ կապված ցանկացած հարցում լուծելու համար:
Ծառայության բնութագրերը
| Հերթականության հարթակ | Հաջորդականության ռազմավարություն | Առաջարկվող տվյալներ | Տվյալների որակի վերահսկում |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12 Գբ | Q30≥85% |
Նմուշի պահանջներ
| Համակենտրոնացում (նգ/մլ) | Ընդհանուր քանակություն (մկգ) | Ծավալը (µL) | OD260/280 | OD260/230 | ՌԻՆ |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1,0-2,5 | ≥6.5 |
Ծառայությունների աշխատանքային հոսք
Նմուշի առաքում
Գրադարանի կառուցում
Հերթականություն
Տվյալների վերլուծություն
Վաճառքից հետո ծառայություններ
Ներառում է հետևյալ վերլուծությունը.
● Տվյալների հաջորդականության որակի վերահսկում
● Սղագրության ժողով
● Տաքսոնոմիական ծանոթագրություն և առատություն
● Ֆունկցիոնալ անոտացիա և առատություն
● Արտահայտման քանակականացում և դիֆերենցիալ վերլուծություն
Յուրաքանչյուր նմուշի տաքսոնոմիական բաշխում.
Բետա բազմազանության վերլուծություն. UPGMA
Ֆունկցիոնալ անոտացիա – GO առատություն
Դիֆերենցիալ տաքսոնոմիայի առատություն – LEFSE
Բացահայտեք BMKGene-ի մետա տրանսկրիպտոմիկայի հաջորդականության ծառայությունների առաջխաղացումները՝ հրատարակությունների համադրված հավաքածուի միջոցով:
Lu, Z. et al. (2023) «Bacteroidales կարգի լակտատ օգտագործող բակտերիաների թթվային հանդուրժողականությունը նպաստում է որովայնի ցիդոզի կանխարգելմանը այծերի մոտ, որոնք հարմարեցված են բարձր խտացված սննդակարգին»,Կենդանիների սնուցում, 14, էջ 130–140։ doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) «Հիմնական ֆունկցիոնալ միկրոբիոտայի բացահայտում ավանդական պինդ վիճակում խմորման մեջ բարձր թողունակության ամպլիկոնների և մետատրանսկրիպտոմիկայի հաջորդականության միջոցով»,Սահմանները մանրէաբանության մեջ, 8 (ՀՈՒԼԻՍԻ). doi՝ 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Wang, W. et al. (2022) «Նոր միկովիրուսներ, որոնք հայտնաբերվել են ֆիտոպաթոգեն ալտերնարիա սնկերի մետատրանսկրիպտոմիական հետազոտությունից»,Վիրուսներ, 14(11), էջ. 2552. doi՝ 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) «Զուգահեռ մետատրանսկրիպտոմի վերլուծությունը բացահայտում է բզեզների և նրանց աղիքների սիմբիոնների կողմից բույսերի երկրորդային մետաբոլիտների դեգրադացիան»,Մոլեկուլային Էկոլոգիա, 31 (15), էջ 3999–4016։ doi՝ 10.1111/MEC.16557:
