-
Մետագենոմիկ հաջորդականություն (NGS)
Մետագենոմը վերաբերում է օրգանիզմների խառը համայնքի ընդհանուր գենետիկական նյութի հավաքածուին, ինչպիսիք են շրջակա միջավայրի մետագենոմը, մարդու մետագենոմը և այլն: Այն պարունակում է ինչպես մշակվող, այնպես էլ անմշակ միկրոօրգանիզմների գենոմներ:Մետագենոմիկ հաջորդականությունը մոլեկուլային գործիք է, որն օգտագործվում է շրջակա միջավայրի նմուշներից արդյունահանված խառը գենոմային նյութերի վերլուծության համար, որը մանրամասն տեղեկատվություն է տրամադրում տեսակների բազմազանության և առատության, պոպուլյացիայի կառուցվածքի, ֆիլոգենետիկ հարաբերությունների, ֆունկցիոնալ գեների և շրջակա միջավայրի գործոնների հետ փոխկապակցված ցանցի վերաբերյալ:
Հարթակ:Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Մետագենոմիկան մոլեկուլային գործիք է, որն օգտագործվում է շրջակա միջավայրի նմուշներից արդյունահանված խառը գենոմային նյութերի վերլուծության համար, որը մանրամասն տեղեկատվություն է տալիս տեսակների բազմազանության և առատության, պոպուլյացիայի կառուցվածքի, ֆիլոգենետիկ հարաբերությունների, ֆունկցիոնալ գեների և շրջակա միջավայրի գործոնների հետ փոխկապակցման ցանցի և այլնի վերաբերյալ: դեպի մետագենոմիական հետազոտություններ։Ընթերցման երկարության մեջ նրա հիանալի կատարողականությունը մեծապես բարելավեց հոսքի մետագենոմիկ վերլուծությունը, հատկապես մետագենոմի հավաքումը:Օգտվելով կարդալու երկարության առավելություններից՝ Nanopore-ի վրա հիմնված մետագենոմիական ուսումնասիրությունը կարող է հասնել ավելի շարունակական հավաքման՝ համեմատած հրացանի մետագենոմիկայի հետ:Հրապարակվել է, որ Nanopore-ի վրա հիմնված մետագենոմիկան հաջողությամբ առաջացրել է ամբողջական և փակ բակտերիալ գենոմներ միկրոբիոմներից (Moss, EL, et. al.,Nature Biotech, 2020)
Հարթակ:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S և 18S rRNA-ի ենթամիավորը, որը պարունակում է և՛ խիստ պահպանված, և՛ հիպերփոփոխական շրջաններ, կատարյալ մոլեկուլային մատնահետք է պրոկարիոտ և էուկարիոտ օրգանիզմների նույնականացման համար:Օգտվելով հաջորդականությունից՝ այս ամպլիկոնները կարող են թիրախավորվել՝ հիմնվելով պահպանված մասերի վրա, և հիպերփոփոխական շրջանները կարող են լիովին բնութագրվել մանրէների նույնականացման համար՝ նպաստելով մանրէների բազմազանության վերլուծությանը, տաքսոնոմիան, ֆիլոգենիան և այլն: Մեկ մոլեկուլ իրական ժամանակում (SMRT): ) PacBio պլատֆորմի հաջորդականությունը թույլ է տալիս ստանալ բարձր ճշգրիտ երկար ընթերցումներ, որոնք կարող են ծածկել ամբողջ երկարությամբ ամպլիկոնները (մոտ 1,5 Կբ):Գենետիկական դաշտի ընդլայնված տեսակետը մեծապես բարելավեց բակտերիաների կամ սնկերի համայնքում տեսակների անոտացիայի լուծումը:
Հարթակ:PacBio-ի շարունակություն II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS ամպլիկոնների հաջորդականությունը նպատակ ունի բացահայտելու ֆիլոգենիան, տաքսոնոմիան և տեսակների առատությունը մանրէաբանական համայնքում՝ ուսումնասիրելով տնային տնտեսության գենետիկական մարկերների PCR արտադրանքները, որոնք պարունակում են ինչպես խիստ խոսակցական, այնպես էլ հիպերփոփոխական մասեր:Այս կատարյալ մոլեկուլային մատնահետքերի ներդրումը Woeses et al, (1977) կողմից ուժեղացնում է միկրոբիոմի առանց մեկուսացման պրոֆիլավորումը:16S (բակտերիաներ), 18S (սնկեր) և ներքին տրանսկրիպացված spacer (ITS, սնկեր) հաջորդականությունը թույլ է տալիս նույնականացնել ինչպես առատ, այնպես էլ հազվագյուտ և չբացահայտված տեսակները:Այս տեխնոլոգիան դարձել է լայնորեն կիրառվող և հիմնական գործիք տարբեր միջավայրերում, ինչպիսիք են մարդու բերանը, աղիքները, կղանքը և այլն, դիֆերենցիալ մանրէաբանական կազմը հայտնաբերելու համար:
Հարթակ:Illumina NovaSeq6000
-
Բակտերիալ և սնկային ամբողջ գենոմի վերահերթականացում
Ամբողջ գենոմի բակտերիաների և սնկային վերափոխումները կարևոր գործիք են հայտնի բակտերիաների և սնկերի գենոմները լրացնելու, ինչպես նաև բազմաթիվ գենոմները համեմատելու կամ նոր օրգանիզմների գենոմները քարտեզագրելու համար:Մեծ նշանակություն ունի մանրէների և սնկերի ամբողջական գենոմների հաջորդականությունը՝ ճշգրիտ հղումային գենոմներ ստեղծելու, մանրէների նույնականացման և գենոմի այլ համեմատական ուսումնասիրություններ կատարելու համար:
Հարթակ՝ Illumina NovaSeq 6000
-
Սնկային գենոմ
Biomarker Technologies-ը տրամադրում է գենոմի հետազոտություն, նուրբ գենոմ և սնկերի ամբողջական գենոմ՝ կախված հետազոտության կոնկրետ նպատակից:Գենոմի հաջորդականությունը, հավաքումը և ֆունկցիոնալ անոտացիան կարելի է ձեռք բերել՝ համատեղելով հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը + Երրորդ սերնդի հաջորդականությունը՝ գենոմի բարձր մակարդակի հավաքման հասնելու համար:Hi-C տեխնոլոգիան կարող է օգտագործվել նաև քրոմոսոմային մակարդակում գենոմի հավաքումը հեշտացնելու համար:
Հարթակ:PacBio-ի շարունակություն II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Բակտերիաների ամբողջական գենոմը
Biomarker Technologies-ը տրամադրում է հաջորդականության ծառայություն զրոյական բացվածքով բակտերիաների ամբողջական գենոմի կառուցման համար:Բակտերիաների ամբողջական գենոմի կառուցման հիմնական աշխատանքային հոսքը ներառում է երրորդ սերնդի հաջորդականացում, հավաքում, ֆունկցիոնալ անոտացիա և առաջադեմ բիոինֆորմատիկական վերլուծություն, որը կատարում է հատուկ հետազոտական նպատակներ:Բակտերիաների գենոմի ավելի համապարփակ պրոֆիլավորումը հնարավորություն է տալիս բացահայտելու նրանց կենսաբանական գործընթացների հիմքում ընկած հիմնարար մեխանիզմները, ինչը կարող է նաև արժեքավոր հղումներ տալ բարձր էուկարիոտիկ տեսակների գենոմային հետազոտությունների համար:
Հարթակ:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio-ի շարունակություն II
