-
BSA
Bulked Segregant Analysis հարթակը բաղկացած է մեկ քայլ ստանդարտ վերլուծությունից և առաջադեմ վերլուծությունից՝ հարմարեցված պարամետրերով:BSA-ն տեխնիկա է, որն օգտագործվում է ֆենոտիպին առնչվող գենետիկ մարկերների արագ հայտնաբերման համար:BSA-ի հիմնական աշխատանքային հոսքը ներառում է.2. բոլոր անհատների ԴՆԹ-ի, ՌՆԹ-ի կամ SLAF-seq-ի (մշակված է Biomarker-ի կողմից) միավորում՝ ԴՆԹ-ի երկու հիմնական զանգված ձևավորելու համար;3. դիֆերենցիալ հաջորդականությունների նույնականացում հղումային գենոմի նկատմամբ կամ դրանց միջև, 4. Թեկնածուների կապակցված շրջանների կանխատեսում ED և SNP-ինդեքսի ալգորիթմով.5. Թեկնածու տարածաշրջաններում գեների ֆունկցիոնալ վերլուծություն և հարստացում և այլն: Հասանելի են նաև տվյալների ավելի առաջադեմ հանքարդյունաբերություն, ներառյալ գենետիկական մարկերների ցուցադրումը և այբբենարանի ձևավորումը:
-
Ամպլիկոն (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) հարթակը մշակված է մանրէների բազմազանության նախագծի վերլուծության տարիների փորձով, որը պարունակում է ստանդարտացված հիմնական վերլուծություն և անհատականացված վերլուծություն. և վերլուծության արդյունքները ներկայացվում են ծրագրի հաշվետվությունների տեսքով.Անհատականացված վերլուծության բովանդակությունը բազմազան է:Նմուշները կարող են ընտրվել, և պարամետրերը կարող են ճկուն սահմանվել՝ համաձայն հիմնական վերլուծության զեկույցի և հետազոտության նպատակի՝ անհատականացված պահանջներն իրականացնելու համար:Windows օպերացիոն համակարգ՝ պարզ և արագ:
-
Էվոլյուցիոն գենետիկա
Էվոլյուցիոն գենետիկան փաթեթավորված հաջորդականության ծառայություն է, որը նախատեսված է տվյալ նյութերի էվոլյուցիոն տեղեկատվության համապարփակ մեկնաբանություն տրամադրելու համար՝ հիմնված գենետիկ տատանումների վրա, ներառյալ SNP-ները, InDels-ը, SV-ները և CNV-ները:Այն տրամադրում է բոլոր հիմնարար վերլուծությունները, որոնք անհրաժեշտ են պոպուլյացիաների էվոլյուցիոն փոփոխությունները և գենետիկական առանձնահատկությունները նկարագրելու համար, ինչպիսիք են պոպուլյացիայի կառուցվածքը, գենետիկական բազմազանությունը, ֆիլոգենային հարաբերությունները և այլն:
-
Համեմատական գենոմիկա
Համեմատական գենոմիկա բառացիորեն նշանակում է համեմատել տարբեր տեսակների գենոմի ամբողջական հաջորդականությունները և կառուցվածքները:Այս կարգապահությունը նպատակ ունի բացահայտելու տեսակների էվոլյուցիան, գեների գործառույթը, գեների կարգավորման մեխանիզմը գենոմի մակարդակում՝ բացահայտելով տարբեր տեսակների մեջ պահպանված կամ տարբերակված հաջորդականության կառուցվածքները և տարրերը:Տիպիկ համեմատական գենոմիկայի ուսումնասիրությունը ներառում է գենային ընտանիքի վերլուծություններ, էվոլյուցիոն զարգացում, ամբողջ գենոմի կրկնօրինակում, ընտրողական ճնշում և այլն:
-
Էվոլյուցիոն գենետիկա
Բնակչության և էվոլյուցիոն գենետիկ վերլուծության հարթակը ստեղծվել է BMK R&D թիմում տարիներ շարունակ կուտակված հսկայական փորձի հիման վրա:Այն օգտագործողի համար հարմար գործիք է հատկապես այն հետազոտողների համար, ովքեր մասնագիտացած չեն կենսաինֆորմատիկայի ոլորտում:Այս հարթակը հնարավորություն է տալիս էվոլյուցիոն գենետիկայի հետ կապված հիմնական վերլուծություն, ներառյալ ֆիլոգենետիկ ծառի կառուցումը, կապի անհավասարակշռության վերլուծությունը, գենետիկական բազմազանության գնահատումը, ընտրովի մաքրման վերլուծությունը, ազգակցական վերլուծությունը, PCA, բնակչության կառուցվածքի վերլուծությունը և այլն:
-
Hi-C հիմնված գենոմի հավաքում
Hi-C-ն մեթոդ է, որը նախատեսված է քրոմոսոմների կոնֆիգուրացիան ֆիքսելու համար՝ համատեղելով զոնդավորման վրա հիմնված փոխազդեցությունները և բարձր թողունակության հաջորդականությունը:Ենթադրվում է, որ այս փոխազդեցությունների ինտենսիվությունը բացասաբար է կապված քրոմոսոմների վրա ֆիզիկական հեռավորության հետ:Հետևաբար, Hi-C տվյալները կարող են ուղղորդել հավաքված հաջորդականությունների կլաստերավորումը, դասավորությունը և կողմնորոշումը գենոմի նախագծում և դրանք ամրացնելով որոշակի թվով քրոմոսոմների վրա:Այս տեխնոլոգիան հզորացնում է քրոմոսոմային մակարդակի գենոմի հավաքը՝ պոպուլյացիայի վրա հիմնված գենետիկ քարտեզի բացակայության դեպքում:Յուրաքանչյուր գենոմի կարիք ունի Hi-C:
Պլատֆորմ՝ Illumina NovaSeq հարթակ / DNBSEQ
-
Plant/Animal De Novo Genome Sequencing
Դե Նովոհաջորդականությունը վերաբերում է տեսակի ամբողջ գենոմի կառուցմանը հաջորդականության տեխնոլոգիաների կիրառմամբ, օրինակ՝ PacBio, Nanopore, NGS և այլն՝ հղումային գենոմի բացակայության դեպքում:Երրորդ սերնդի հաջորդականացման տեխնոլոգիաների ընթերցման երկարության զգալի բարելավումը նոր հնարավորություններ է ստեղծել բարդ գենոմների հավաքման հարցում, ինչպիսիք են բարձր հետերոզիգոտություն ունեցողները, կրկնվող շրջանների բարձր հարաբերակցությունը, պոլիպլոիդները և այլն: Տասնյակ կիլոբազաների մակարդակում ընթերցման երկարության դեպքում այս հաջորդականության ընթերցումները հնարավորություն են տալիս: կրկնվող տարրերի, աննորմալ GC պարունակությամբ շրջանների և այլ խիստ բարդ շրջանների լուծում:
Պլատֆորմ՝ PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq հարթակ
-
Մարդկային ամբողջ էքսոմի հաջորդականություն
Ամբողջ էքսոմի հաջորդականությունը (WES) համարվում է որպես ծախսարդյունավետ հաջորդականության ռազմավարություն՝ հիվանդություն առաջացնող մուտացիաները հայտնաբերելու համար:Թեև էկզոնները զբաղեցնում են ամբողջ գենոմի մոտավորապես 1,7%-ը, այն ուղղակիորեն ներկայացնում է ընդհանուր սպիտակուցի ֆունկցիաների պրոֆիլը:Մարդու գենոմում հաղորդվել է, որ հիվանդության հետ կապված մուտացիաների ավելի քան 85%-ը տեղի է ունենում սպիտակուցի կոդավորման շրջանում:
BMKGENE-ն առաջարկում է համապարփակ և ճկուն մարդկային ամբողջ էկզոմի հաջորդականության ծառայություններ՝ տարբեր էկզոնների գրավման ռազմավարություններով, որոնք հասանելի են տարբեր հետազոտական նպատակներին հասնելու համար:
Պլատֆորմ՝ Illumina NovaSeq հարթակ
-
Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
Բարձր թողունակության գենոտիպավորումը, հատկապես լայնածավալ պոպուլյացիայի համար, հիմնարար քայլ է գենետիկական ասոցիացիայի ուսումնասիրություններում, որը գենետիկ հիմք է տալիս ֆունկցիոնալ գեների հայտնաբերման, էվոլյուցիոն վերլուծության և այլնի համար: Ամբողջ գենոմի խորքային վերասեքվենավորման փոխարեն, գենոմի ներկայացման կրճատված հաջորդականությունը (RRGS): ) ներդրվել է յուրաքանչյուր նմուշի հաջորդականության արժեքը նվազագույնի հասցնելու համար՝ միաժամանակ պահպանելով ողջամիտ արդյունավետությունը գենետիկական մարկերների հայտնաբերման հարցում:Սա սովորաբար ձեռք է բերվում սահմանափակող հատվածի արդյունահանմամբ՝ տվյալ չափի միջակայքում, որը կոչվում է կրճատված ներկայացման գրադարան (RRL):Specific-locus amplified fragment sequencing (SLAF-Seq) ինքնուրույն մշակված ռազմավարություն է SNP-ի գենոտիպավորման համար՝ հղումային գենոմով կամ առանց դրա:
Պլատֆորմ՝ Illumina NovaSeq հարթակ -
Illumina և BGI
Illumina sequencing տեխնոլոգիան, որը հիմնված է Sequencing by Synthesis (SBS) վրա, համաշխարհային մասշտաբով ընդունված NGS նորարարություն է, որը պատասխանատու է աշխարհի հաջորդականության տվյալների ավելի քան 90%-ի առաջացման համար:SBS-ի սկզբունքը ներառում է ֆլյուորեսցենտով պիտակավորված հետադարձելի տերմինատորների նկարահանում, երբ յուրաքանչյուր dNTP ավելացվում է, և այնուհետև կտրվում՝ թույլ տալու հաջորդ բազան ներառել:Յուրաքանչյուր հաջորդականության ցիկլում առկա բոլոր չորս հետադարձելի տերմինատորի հետ կապված dNTP-ները, բնական մրցակցությունը նվազագույնի է հասցնում ընդգրկման կողմնակալությունը:Այս բազմակողմանի տեխնոլոգիան աջակցում է և՛ մեկ ընթերցման, և՛ զուգակցված գրադարաններին, որոնք ապահովում են մի շարք գենոմային կիրառություններ:Illumina հաջորդականության բարձր թողունակության հնարավորություններն ու ճշգրտությունը այն դնում են որպես գենոմիկայի հետազոտության անկյունաքար՝ գիտնականներին հնարավորություն տալով բացահայտելու գենոմների խճճվածությունը անզուգական մանրամասներով և արդյունավետությամբ:
BGI-ի կողմից մշակված DNBSEQ-ը ևս մեկ նորարարական NGS տեխնոլոգիա է, որը կարողացել է ավելի նվազեցնել հաջորդականության ծախսերը և մեծացնել թողունակությունը:DNBSEQ գրադարանների պատրաստումը ներառում է ԴՆԹ-ի մասնատում, ssDNA-ի պատրաստում և պտտվող շրջանի ամպլիֆիկացում ԴՆԹ-ի նանոգնդիկները (DNB) ստանալու համար:Դրանք այնուհետև բեռնվում են ամուր մակերևույթի վրա և այնուհետև հաջորդականացվում են զոնդ-խարիսխի համակցված սինթեզով (cPAS):
Գրադարանների հաջորդականության մեր նախապես պատրաստված ծառայությունը հեշտացնում է հաճախորդներին իրենց հաջորդականության գրադարանները պատրաստելիս տարբեր աղբյուրներից (mRNA, ամբողջական գենոմ, ամպլիկոն և այլն):Հետագայում, այս գրադարանները կարող են առաքվել մեր հաջորդականության կենտրոններ՝ որակի վերահսկման և հաջորդականության համար Illumina կամ BGI հարթակներում:
