Փոքր ՌՆԹ-ի հաջորդականություն-Illumina
Հատկություններ
● ՌՆԹ-ի չափի ընտրությունը գրադարանի պատրաստումից առաջ
● Կենսաինֆորմատիկական վերլուծությունը կենտրոնացած է miRNA կանխատեսման և դրանց թիրախների շուրջ
Ծառայության առավելությունները
●Համապարփակ կենսաինֆորմատիկական վերլուծություն.հնարավորություն տալով նույնականացնել ինչպես հայտնի, այնպես էլ նոր miRNA-ները, նույնականացնել miRNA-ների թիրախները և համապատասխան ֆունկցիոնալ անոտացիա և հարստացնել բազմաթիվ տվյալների բազաներով (KEGG, GO)
●Որակի խիստ հսկողությունՄենք իրականացնում ենք հիմնական վերահսկման կետերը բոլոր փուլերում՝ նմուշների և գրադարանների պատրաստումից մինչև հաջորդականություն և կենսաինֆորմատիկա:Այս մանրակրկիտ մոնիտորինգը ապահովում է հետևողականորեն բարձրորակ արդյունքների ապահովում:
●Վաճառքից հետո աջակցությունՄեր պարտավորությունը տարածվում է ծրագրի ավարտից դուրս՝ վաճառքից հետո սպասարկման 3 ամիս ժամկետով:Այս ընթացքում մենք առաջարկում ենք ծրագրի հետևում, անսարքությունների վերացման օգնություն և հարցուպատասխանի նիստեր՝ արդյունքների հետ կապված ցանկացած հարցում լուծելու համար:
●Ընդարձակ փորձաքննությունՈւնենալով հաջողությամբ փակելու բազմաթիվ sRNA նախագծեր, որոնք ընդգրկում են ավելի քան 100 տեսակներ տարբեր հետազոտական տիրույթներում, մեր թիմը հարուստ փորձ է բերում յուրաքանչյուր նախագծին:
Նմուշի պահանջներ և առաքում
| Գրադարան | Հարթակ | Առաջարկվող տվյալներ | Տվյալների QC |
| Ընտրված է չափը | Illumina SE50 | 10M-20M ընթերցումներ | Q30≥85% |
Նմուշի պահանջներ.
Նուկլեոտիդներ:
| խտ. (նգ/մլ) | Գումարը (մկգ) | Մաքրություն | Անարատություն |
| ≥ 80 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Գելի վրա ցուցադրված է սպիտակուցի կամ ԴՆԹ-ի սահմանափակ կամ ոչ աղտոտվածություն: | RIN≥6.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; սահմանափակ կամ առանց բազային բարձրության |
● Բույսեր.
Արմատ, ցողուն կամ ծաղկաթերթ՝ 450 մգ
Տերեւ կամ սերմ՝ 300 մգ
Պտուղ՝ 1,2 գ
● Կենդանի.
Սիրտ կամ աղիք՝ 450 մգ
Ներքին օրգաններ կամ ուղեղ՝ 240 մգ
Մկանները՝ 600 մգ
Ոսկորներ, մազեր կամ մաշկ՝ 1,5 գ
● հոդվածոտանիներ.
Թրթուրներ՝ 9գ
Խեցգետիններ՝ 450 մգ
● Ամբողջ արյուն2 խողովակ
● Բջիջներ: 106 բջիջները
● Շիճուկ և պլազմա.6 մլ
Առաջարկվող նմուշի առաքում
Բեռնարկղ:
2 մլ ցենտրիֆուգային խողովակ (անագե փայլաթիթեղը խորհուրդ չի տրվում)
Նմուշի պիտակավորում. Խումբ+կրկնօրինակ, օրինակ՝ A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
Բարձում:
1. Չոր սառույց. նմուշները պետք է փաթեթավորվեն տոպրակների մեջ և թաղվեն չոր սառույցի մեջ:
2.ՌՆԹ կայուն խողովակներ. ՌՆԹ-ի նմուշները կարելի է չորացնել ՌՆԹ կայունացնող խողովակում (օրինակ՝ RNAstable®) և ուղարկել սենյակային ջերմաստիճանում:
Ծառայությունների աշխատանքային հոսք
Փորձի ձևավորում
Նմուշի առաքում
ՌՆԹ արդյունահանում
Գրադարանի կառուցում
Հերթականություն
Տվյալների վերլուծություն
Վաճառքից հետո ծառայություններ
Կենսաինֆորմատիկա
ՄիՌՆԹ-ի նույնականացում՝ կառուցվածք և խորություն
ՄիՌՆԹ-ի դիֆերենցիալ արտահայտություն՝ հիերարխիկ կլաստերավորում
Դիֆերենցիալ արտահայտված miRNA-ների թիրախի ֆունկցիոնալ անոտացիա
Բացահայտեք հետազոտական առաջընթացները, որոնք նպաստում են BMKGene-ի sRNA-ի հաջորդականության ծառայությունների կողմից հրատարակությունների համադրված հավաքածուի միջոցով:
Chen, H. et al.(2023) «Վիրուսային վարակները արգելակում են սապոնինի կենսասինթեզը և ֆոտոսինթեզը Panax notoginseng-ում», Բույսերի ֆիզիոլոգիա և կենսաքիմիա, 203, էջ.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) «Բույսի FYVE տիրույթը պարունակող FREE1 սպիտակուցը ասոցացվում է միկրոպրոցեսորային բաղադրիչների հետ՝ ճնշելու miRNA բիոգենեզը», հաղորդում է EMBO-ն, 24(1):doi՝ 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF:
Yu, J. et al.(2023) «ՄիկրոՌՆԹ Ame-Bantam-3p-ը վերահսկում է թրթուրների ձագերի զարգացումը` թիրախավորելով բազմաթիվ էպիդերմալ աճի գործոնի նման տիրույթներ 8 գենը (megf8) մեղու մեղուում, Apis mellifera», Մոլեկուլային գիտությունների միջազգային հանդես, 24(6), p. .5726. doi՝ 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al.(2018) «Մսի որակի հետ կապված MiRNA-ի և գեների ինտեգրված վերլուծությունը բացահայտում է, որ Gga-MiR-140-5p-ն ազդում է հավերի միջմկանային ճարպի կուտակման վրա», Բջջային ֆիզիոլոգիա և կենսաքիմիա, 46(6), էջ 2421–2433:doi՝ 10.1159/000489649:
