page_head_bg

Տրանսկրիպտոմիկա

  • Full-length mRNA sequencing-Nanopore

    Ամբողջ երկարությամբ mRNA հաջորդականություն-Nanopore

    ՌՆԹ-ի հաջորդականությունը անգնահատելի գործիք է եղել տրանսկրիպտոմի համապարփակ վերլուծության համար:Անկասկած, ավանդական կարճ ընթերցման հաջորդականությունը այստեղ բազմաթիվ կարևոր զարգացումների է հասել:Այնուամենայնիվ, այն հաճախ հանդիպում է սահմանափակումների ամբողջ երկարությամբ իզոֆորմների նույնականացման, քանակականացման, PCR կողմնակալության մեջ:

    Nanopore sequencing-ը տարբերվում է հաջորդականության այլ հարթակներից, քանի որ նուկլեոտիդները ընթերցվում են ուղղակիորեն առանց ԴՆԹ-ի սինթեզի և առաջացնում են երկար ընթերցումներ տասնյակ կիլոբազաներով:Սա հնարավորություն է տալիս ուղիղ ընթերցմամբ հատել ամբողջական տառադարձումները և հաղթահարել իզոֆորմ մակարդակի ուսումնասիրությունների մարտահրավերները:

    Հարթակ:Nanopore PromethION

    Գրադարան:cDNA-PCR

  • De novo Full-length Transcriptome sequencing -PacBio

    De novo Ամբողջական տրանսկրիպտոմի հաջորդականացում - PacBio

    De novoամբողջ երկարությամբ տրանսկրիպտոմային հաջորդականություն, որը նաև հայտնի է որպեսDe novoIso-Seq-ն օգտագործում է PacBio sequencer-ի առավելությունները ընթերցման երկարության մեջ, որը հնարավորություն է տալիս սեկվայնավորել ամբողջ երկարությամբ cDNA մոլեկուլները առանց ընդմիջումների:Սա լիովին խուսափում է տառադարձման հավաքման քայլերում առաջացած սխալներից և կառուցում է unigene հավաքածուներ իզոֆորմի մակարդակի լուծաչափով:Այս unigene հավաքածուն ապահովում է հզոր գենետիկական տեղեկատվություն՝ որպես «տեղեկատու գենոմ» տրանսկրիպտոմային մակարդակում:Բացի այդ, համակցվելով հաջորդ սերնդի հաջորդականության տվյալների հետ՝ այս ծառայությունը հնարավորություն է տալիս ճշգրիտ քանակականացնել իզոֆորմի մակարդակի արտահայտությունը:

    Պլատֆորմ՝ PacBio Sequel II
    Գրադարան՝ SMRT զանգի գրադարան
  • Eukaryotic mRNA sequencing-Illumina

    Էուկարիոտիկ mRNA հաջորդականություն-Illumina

    mRNA հաջորդականությունը հնարավորություն է տալիս պրոֆիլավորել բոլոր mRNA-ները, որոնք արտագրվել են բջիջներից հատուկ պայմաններում:Այն հզոր տեխնոլոգիա է գենային արտահայտման պրոֆիլը, գենային կառուցվածքը և որոշակի կենսաբանական գործընթացների մոլեկուլային մեխանիզմները բացահայտելու համար:Մինչ օրս mRNA հաջորդականությունը լայնորեն կիրառվում է հիմնարար հետազոտությունների, կլինիկական ախտորոշման, դեղերի մշակման և այլնի մեջ:

    Հարթակ՝ Illumina NovaSeq 6000

  • Non-Reference based mRNA sequencing-Illumina

    Ոչ հղման վրա հիմնված mRNA հաջորդականություն-Illumina

    mRNA հաջորդականությունը ընդունում է հաջորդ սերնդի հաջորդականության տեխնիկան (NGS)՝ էուկարիոտից ստացված հաղորդիչ ՌՆԹ (mRNA) գրավելու համար որոշակի ժամանակահատվածում, երբ որոշ հատուկ գործառույթներ են ակտիվանում:Ամենաերկար զուգորդված տառադարձությունը կոչվում էր «Յունիգեն» և օգտագործվում էր որպես հետագա վերլուծության համար հղումային հաջորդականություն, որն արդյունավետ միջոց է՝ ուսումնասիրելու տեսակների մոլեկուլային մեխանիզմը և կարգավորող ցանցն առանց հղման:

    Տրանսկրիպտոմի տվյալների հավաքումից և unigene ֆունկցիոնալ անոտացիայից հետո

    (1) SNP վերլուծությունը, SSR վերլուծությունը, CDS կանխատեսումը և գենի կառուցվածքը նախապես կկատարվեն:

    (2) Յուրաքանչյուր նմուշում կկատարվի unigene-ի արտահայտման քանակականացում:

    (3) Նմուշների (կամ խմբերի) միջև դիֆերենցիալ արտահայտված միագինները կհայտնաբերվեն միգենային արտահայտման հիման վրա

    (4) Կկատարվի դիֆերենցիալ արտահայտված միգեների կլաստերավորում, ֆունկցիոնալ անոտացիա և հարստացման վերլուծություն

  • Long non-coding sequencing-Illumina

    Երկար չկոդավորվող հաջորդականություն-Illumina

    Երկար չկոդավորող ՌՆԹ-ները (lncRNAs) 200 նտ-ից ավելի երկարությամբ ՌՆԹ մոլեկուլների տեսակ են, որոնք բնութագրվում են կոդավորման չափազանց ցածր պոտենցիալով։LncRNA-ն, որպես ոչ կոդավորող ՌՆԹ-ի հիմնական անդամ, հիմնականում հանդիպում է միջուկում և պլազմայում։Հերթականավորման տեխնոլոգիայի և կենսաինֆորմատիկայի զարգացումը հնարավորություն է տալիս նույնականացնել բազմաթիվ նոր lncRNA-ներ և դրանք կապել կենսաբանական գործառույթների հետ:Կուտակված ապացույցները ցույց են տալիս, որ lncRNA-ն լայնորեն ներգրավված է էպիգենետիկ կարգավորման, տրանսկրիպցիոն կարգավորման և հետտրանսկրիպցիոն կարգավորման մեջ:

  • Small RNA sequencing-Illumina

    Փոքր ՌՆԹ-ի հաջորդականություն-Illumina

    Փոքր ՌՆԹ-ն վերաբերում է ոչ կոդավորող ՌՆԹ մոլեկուլների դասին, որոնք սովորաբար ունեն 200nt-ից պակաս երկարություն, ներառյալ միկրո ՌՆԹ (miRNA), փոքր միջամտության ՌՆԹ (siRNA) և piwi-փոխազդող ՌՆԹ (piRNA):

    MicroRNA-ն (miRNA) մոտ 20-24nt երկարությամբ էնդոգեն փոքր ՌՆԹ-ի դաս է, որը բջիջներում կատարում է մի շարք կարևոր կարգավորիչ դերեր:ՄիՌՆԹ-ն ներգրավված է բազմաթիվ կենսագործունեության մեջ, որոնք բացահայտում են հյուսվածքները՝ հատուկ և փուլային, հատուկ արտահայտություն և խիստ պահպանված տարբեր տեսակների մեջ:

  • circRNA sequencing-Illumina

    circRNA sequencing-Illumina

    Ամբողջ տրանսկրիպտոմի հաջորդականությունը նախագծված է ՌՆԹ-ի բոլոր տեսակի մոլեկուլների պրոֆիլավորման համար, ներառյալ կոդավորող (mRNA) և ոչ կոդավորող ՌՆԹ-ները (ներառյալ lncRNA, circRNA և miRNA), որոնք որոշակի ժամանակ տառադարձվում են հատուկ բջիջների կողմից:Ամբողջ տրանսկրիպտոմային հաջորդականությունը, որը նաև հայտնի է որպես «ընդհանուր ՌՆԹ-ի հաջորդականություն», ուղղված է տրանսկրիպտոմի մակարդակում համապարփակ կարգավորիչ ցանցերի բացահայտմանը:Օգտվելով NGS տեխնոլոգիայից՝ ամբողջ տրանսկրիպտոմի արտադրանքի հաջորդականությունները հասանելի են ceRNA վերլուծության և համատեղ ՌՆԹ վերլուծության համար, որն ապահովում է առաջին քայլը դեպի ֆունկցիոնալ բնութագրում:CircRNA-miRNA-mRNA հիմնված ceRNA-ի կարգավորիչ ցանցի բացահայտում:

  • Whole transcriptome sequencing – Illumina

    Ամբողջ տրանսկրիպտոմի հաջորդականությունը – Illumina

    Ամբողջ տրանսկրիպտոմի հաջորդականությունը նախագծված է ՌՆԹ-ի բոլոր տեսակի մոլեկուլների պրոֆիլավորման համար, ներառյալ կոդավորող (mRNA) և ոչ կոդավորող ՌՆԹ-ները (ներառյալ lncRNA, circRNA և miRNA), որոնք որոշակի ժամանակ տառադարձվում են հատուկ բջիջների կողմից:Ամբողջ տրանսկրիպտոմային հաջորդականությունը, որը նաև հայտնի է որպես «ընդհանուր ՌՆԹ-ի հաջորդականություն», ուղղված է տրանսկրիպտոմի մակարդակում համապարփակ կարգավորիչ ցանցերի բացահայտմանը:Օգտվելով NGS տեխնոլոգիայից՝ ամբողջ տրանսկրիպտոմի արտադրանքի հաջորդականությունները հասանելի են ceRNA վերլուծության և համատեղ ՌՆԹ վերլուծության համար, որն ապահովում է առաջին քայլը դեպի ֆունկցիոնալ բնութագրում:CircRNA-miRNA-mRNA հիմնված ceRNA-ի կարգավորիչ ցանցի բացահայտում:

  • Prokaryotic RNA sequencing

    Պրոկարիոտիկ ՌՆԹ-ի հաջորդականություն

    Պրոկարիոտիկ ՌՆԹ-ի հաջորդականությունը օգտագործում է հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը (NGS)՝ տվյալ պահին ՌՆԹ-ի առկայությունը և քանակը բացահայտելու համար՝ վերլուծելով փոփոխվող բջջային տրանսկրիպտոմը:Մեր ընկերության պրոկարիոտային ՌՆԹ-ի հաջորդականությունը, մասնավորապես, ուղղված է պրոկարիոտներին՝ հղումային գենոմներով՝ տրամադրելով ձեզ տրանսկրիպտոմի պրոֆիլավորում, գենային կառուցվածքի վերլուծություն և այլն: Այն լայնորեն կիրառվել է հիմնական գիտական ​​հետազոտությունների, դեղերի հետազոտության և մշակման և այլնի համար:

    Հարթակ՝ Illumina NovaSeq 6000

  • Metatranscriptome Sequencing

    Metatranscriptome Sequencing

    Metatranscriptome sequencing-ը նույնականացնում է միկրոբների (և էուկարիոտների, և պրոկարիոտների) գենային արտահայտությունը բնական միջավայրերում (այսինքն՝ հող, ջուր, ծով, կղանք և աղիքներ): Մասնավորապես, այս ծառայությունները թույլ են տալիս ստանալ բարդ մանրէաբանական համայնքների գենային արտահայտման պրոֆիլավորում, տաքսոնոմիական վերլուծություն: տեսակների, տարբեր արտահայտված գեների ֆունկցիոնալ հարստացման վերլուծություն և այլն։

    Հարթակ՝ Illumina NovaSeq 6000

Ուղարկեք ձեր հաղորդագրությունը մեզ.