BMKCloud Log in
条形 banner-03

Ապրանքներ

Ամբողջ տրանսկրիպտոմի հաջորդականություն – Illumina

Ամբողջ տրանսկրիպտոմային հաջորդականությունը առաջարկում է համապարփակ մոտեցում ՌՆԹ-ի տարբեր մոլեկուլների պրոֆիլավորման համար՝ ընդգրկելով և՛ կոդավորող (mRNA) և՛ ոչ կոդավորող ՌՆԹ-ներ (lncRNA, circRNA և miRNA):Այս տեխնիկան ֆիքսում է կոնկրետ բջիջների ամբողջական տրանսկրիպտոմը տվյալ պահին, ինչը թույլ է տալիս ամբողջական պատկերացում կազմել բջջային գործընթացների մասին:Նաև հայտնի է որպես «ընդհանուր ՌՆԹ-ի հաջորդականություն», այն նպատակ ունի բացահայտել բարդ կարգավորիչ ցանցերը տրանսկրիպտոմի մակարդակում՝ թույլ տալով խորը վերլուծություն, ինչպիսիք են մրցակցող էնդոգեն ՌՆԹ-ն (ceRNA) և համատեղ ՌՆԹ վերլուծությունը:Սա նախանշում է ֆունկցիոնալ բնութագրման սկզբնական քայլը, մասնավորապես, կարգավորիչ ցանցերի բացահայտման գործում, որոնք ներառում են circRNA-miRNA-mRNA վրա հիմնված ceRNA փոխազդեցությունները:


Ծառայության մանրամասները

Կենսաինֆորմատիկա

Դեմո արդյունքներ

Առաջարկվող հրապարակումներ

Հատկություններ

● Կրկնակի գրադարան՝ ամբողջական տրանսկրիպտոմը հաջորդականացնելու համար. rRNA-ի սպառում, որին հաջորդում է PE150 գրադարանի պատրաստումը և չափի ընտրությունը, որին հաջորդում է SE50 գրադարանի պատրաստումը

● mRNA-ի, lncRNA-ի, circRNA-ի և miRNA-ի ամբողջական կենսաինֆորմատիկական վերլուծություն առանձին կենսաինֆորմատիկայի զեկույցներում

● ՌՆԹ-ի ամբողջ արտահայտման համատեղ վերլուծություն համակցված զեկույցում, ներառյալ ceRNA ցանցերի վերլուծությունը:

Ծառայության առավելությունները

Կարգավորող ցանցերի խորը վերլուծությունceRNA ցանցի վերլուծությունը միացված է mRNA-ի, lncRNA-ի, circRNA-ի և miRNA-ի համատեղ հաջորդականացման և սպառիչ կենսաինֆորմատիկական աշխատանքի միջոցով:

Համապարփակ ծանոթագրությունՄենք օգտագործում ենք բազմաթիվ տվյալների շտեմարաններ՝ դիֆերենցիալ արտահայտված գեները (DEGs) ֆունկցիոնալ կերպով ծանոթագրելու և համապատասխան հարստացման վերլուծություն կատարելու համար՝ տրամադրելով պատկերացումներ տրանսկրիպտոմի պատասխանի հիմքում ընկած բջջային և մոլեկուլային գործընթացների վերաբերյալ:

Ընդարձակ փորձաքննությունՏարբեր հետազոտական ​​տիրույթում ավելի քան 2000 ամբողջական տրանսկրիպտոմային նախագծեր հաջողությամբ փակելու փորձառությամբ՝ մեր թիմը հարուստ փորձ է բերում յուրաքանչյուր նախագծին:

Որակի խիստ հսկողությունՄենք իրականացնում ենք հիմնական վերահսկման կետերը բոլոր փուլերում՝ նմուշների և գրադարանների պատրաստումից մինչև հաջորդականություն և կենսաինֆորմատիկա:Այս մանրակրկիտ մոնիտորինգը ապահովում է հետևողականորեն բարձրորակ արդյունքների ապահովում:

● Համապարփակ ծանոթագրությունՄենք օգտագործում ենք բազմաթիվ տվյալների շտեմարաններ՝ դիֆերենցիալ արտահայտված գեները (DEGs) ֆունկցիոնալ կերպով ծանոթագրելու և համապատասխան հարստացման վերլուծություն կատարելու համար՝ տրամադրելով պատկերացումներ տրանսկրիպտոմի պատասխանի հիմքում ընկած բջջային և մոլեկուլային գործընթացների վերաբերյալ:

Վաճառքից հետո աջակցությունՄեր պարտավորությունը տարածվում է ծրագրի ավարտից դուրս՝ վաճառքից հետո սպասարկման 3 ամիս ժամկետով:Այս ընթացքում մենք առաջարկում ենք ծրագրի հետևում, անսարքությունների վերացման օգնություն և հարցուպատասխանի նիստեր՝ արդյունքների հետ կապված ցանկացած հարցում լուծելու համար։

Նմուշի պահանջներ և առաքում

Գրադարան

Հերթականության ռազմավարություն

Առաջարկվող տվյալներ

Որակի հսկողություն

rRNA-ն սպառված է

Illumina PE150

16 Գբ

Q30≥85%

Ընտրված է չափը

Illumina SE50

10-20M ընթերցում

 

Նմուշի պահանջներ.

Նուկլեոտիդներ:

խտ. (նգ/մլ)

Գումարը (մկգ)

Մաքրություն

Անարատություն

≥ 100

≥ 1

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Գելի վրա ցուցադրված է սպիտակուցի կամ ԴՆԹ-ի սահմանափակ կամ ոչ աղտոտվածություն:

Բույսեր՝ RIN≥6.5

Կենդանի՝ RIN≥7.0

5.0≥28S/18S≥1.0;

սահմանափակ կամ առանց բազային բարձրության

Առաջարկվող նմուշի առաքում

Բեռնարկղ:
2 մլ ցենտրիֆուգային խողովակ (անագե փայլաթիթեղը խորհուրդ չի տրվում)
Նմուշի պիտակավորում. Խումբ+կրկնօրինակ, օրինակ՝ A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...

Բարձում:
1. Չոր սառույց. նմուշները պետք է փաթեթավորվեն տոպրակների մեջ և թաղվեն չոր սառույցի մեջ:
2.ՌՆԹ կայուն խողովակներ. ՌՆԹ-ի նմուշները կարելի է չորացնել ՌՆԹ կայունացնող խողովակում (օրինակ՝ RNAstable®) և ուղարկել սենյակային ջերմաստիճանում:

Ծառայությունների աշխատանքային հոսք

Նմուշ QC

Փորձի ձևավորում

նմուշի առաքում

Նմուշի առաքում

Փորձնական փորձ

ՌՆԹ արդյունահանում

Գրադարանի պատրաստում

Գրադարանի կառուցում

Հերթականություն

Հերթականություն

Տվյալների վերլուծություն

Տվյալների վերլուծություն

Հետո վաճառքի ծառայություններ

Վաճառքից հետո ծառայություններ


  • Նախորդը:
  • Հաջորդը:

  • Կենսաինֆորմատիկա

    wps_doc_16

    ՌՆԹ-ի արտահայտման ակնարկ

     图片41

    Դիֆերենցիալ արտահայտված գեներ

    图片42

     

     

    ceRNA վերլուծություն

     图片43Դիֆերենցիալ արտահայտված miRNA-ներ և հարակից ՌՆԹ-ներ

    图片44 

     Բացահայտեք BMKGene-ի ամբողջ տրանսկրիպտոմային հաջորդականության ծառայությունների կողմից իրականացվող հետազոտական ​​առաջընթացները՝ հրապարակումների համադրված հավաքածուի միջոցով:

     

    Dai, Y. et al.(2022) «mRNAs, lncRNAs և miRNAs-ի համապարփակ արտահայտչական պրոֆիլները Կաշին-Բեկ հիվանդության մեջ, որոնք բացահայտված են ՌՆԹ-ի հաջորդականությամբ», Molecular Omics, 18(2), էջ 154–166:doi՝ 10.1039/D1MO00370D.

    Liu, N. nan et al.(2022) «Apis cerana-ի ցրտին դիմադրության ամբողջական երկարությամբ տրանսկրիպտոմների վերլուծություն Չանգբայ լեռան վրա ձմեռման ժամանակաշրջանում», Gene, 830, էջ 146503–146503:doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.

    Wang, XJ et al.(2022) «Մուլտի-օմիկական ինտեգրման վրա հիմնված առաջնահերթություն մրցակցող էնդոգեն ՌՆԹ-ի կարգավորման ցանցերի փոքր բջջային թոքերի քաղցկեղում. մոլեկուլային բնութագրեր և դեղերի թեկնածուներ», Սահմաններ ուռուցքաբանության մեջ, 12, էջ.904865. doi՝ 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX:

    Xu, P. et al.(2022) «lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA արտահայտման պրոֆիլների ինտեգրված վերլուծությունը բացահայտում է նոր պատկերացումներ պոտենցիալ մեխանիզմների վերաբերյալ՝ ի պատասխան գետնանուշի արմատային հանգույցների նեմատոդների», BMC Genomics, 23(1), էջ 1–12:doi՝ 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.

    Yan, Z. et al.(2022) «Ամբողջ տրանսկրիպտոմային ՌՆԹ-ի հաջորդականությունը ընդգծում է մոլեկուլային մեխանիզմները, որոնք կապված են բրոկկոլիում հետբերքահավաքի որակի պահպանման հետ կարմիր LED ճառագայթման միջոցով», Postharvest Biology and Technology, 188, p.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.

    ստանալ մեջբերում

    Գրեք ձեր հաղորդագրությունը այստեղ և ուղարկեք այն մեզ

    Ուղարկեք ձեր հաղորդագրությունը մեզ.