Transkriptome Spasial BMKMANU S1000

Organisasi spasial sel memainkan peran penting dalam berbagai proses biologis, seperti infiltrasi kekebalan tubuh, perkembangan embrio, dll. Pengurutan transkriptome spasial, yang menunjukkan profil ekspresi gen sambil mempertahankan informasi posisi spasial, telah memberikan wawasan luas tentang arsitektur jaringan tingkat transkriptome.Dengan perkembangan teknologi, morfologi jaringan yang sangat jernih dan perbedaan struktural nyata dari ekspresi molekul spasial perlu dipelajari dengan resolusi yang lebih tinggi.BMKGENE menyediakan layanan pengurutan transkriptom spasial terpadu yang komprehensif mulai dari sampel hingga wawasan biologis.

Teknologi transkriptomik spasial memberdayakan perspektif baru dalam beragam arena penelitian dengan menyelesaikan profil ekspresi gen dengan konten spasial dalam sampel heterogen.

Chip transkriptome spasial: BMKMANU S1000

Platform: Platform Illumina NovaSeq

Hubungi kami

Detail Layanan

Bioinformatika

Hasil Demo

Skema Teknis Transkriptome Spasial BMKMANU S1000

Keunggulan BMKMANU S1000

1) Resolusi sub-seluler: Setiap area pengambilan berisi >2 juta Barcoded Spot spasial dengan diameter 2,5 µm dan jarak antar pusat spot 5 µm, sehingga memungkinkan analisis transkriptom spasial dengan resolusi sub-seluler (5 µm).

2) Analisis resolusi multi-level: Analisis multi-level yang fleksibel mulai dari 100 μm hingga 5 μm untuk menyelesaikan beragam fitur jaringan pada resolusi optimal.

3) Pembuatan profil transkriptome yang komprehensif: Transkrip yang diambil dari seluruh slide jaringan dapat dianalisis, tanpa batasan jumlah gen target dan area target.

Spesifikasi Layanan

Perpustakaan	Strategi pengurutan	Keluaran Data direkomendasikan
Perpustakaan cDNA S1000	BMKMANU S1000-Illumina PE150	60Gb/sampel

Persyaratan Sampel

Sampel	Nomor	Ukuran	Kualitas RNA
Blok jaringan tertanam OCT	2-3 blok/sampel	Kira-kira.6.8x6.8x6.8mm³	RIN≥7

Untuk rincian lebih lanjut tentang panduan persiapan sampel dan alur kerja layanan, silakan berbicara dengan aPakar BMKGENE

Alur Kerja Layanan

Desain percobaan

Pengiriman sampel

Pra-percobaan

Barcode spasial

Pembangunan perpustakaan

Pengurutan

Analisis data

Layanan purna jual

Sebelumnya: 10x Transkriptome Spasial Visium Genomik

Berikutnya: Pengurutan Genom Utuh Tumbuhan/Hewan

Data yang dihasilkan oleh BMKMANU S1000 dianalisis menggunakan perangkat lunak “BSTMatrix” yang dirancang secara mandiri oleh BMKGENE, antara lain:

1) Pembuatan matriks ekspresi gen
2) Pemrosesan gambar DIA
3) Kompatibel dengan perangkat lunak pihak ketiga hilir untuk analisis
4) “BSTViewer” online membantu memperoleh hasil visualisasi pada resolusi berbeda.

1. Pengelompokan titik

s1000 (4)