Pengurutan CircRNA - Illumina
Fitur
● Penghapusan rRNA diikuti dengan persiapan pustaka terarah, memungkinkan data pengurutan spesifik untai.
● Alur kerja bioinformatika memungkinkan prediksi circRNA dan kuantifikasi ekspresi.
Keunggulan Layanan
●Keahlian yang LuasKami telah memproses lebih dari 20.000 sampel, yang mencakup berbagai jenis sampel, dan kami menghadirkan kekayaan keahlian untuk setiap proyek.
●Kontrol Kualitas yang KetatKami menerapkan titik kontrol inti di semua tahapan, mulai dari persiapan sampel hingga persiapan pustaka, pengurutan, dan bioinformatika. Pemantauan kami yang cermat memastikan penyampaian hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
●Pustaka RNA yang Lebih Komprehensif:Kami menggunakan pengurangan rRNA alih-alih pengurangan RNA linier dalam persiapan pra-perpustakaan kami, memastikan bahwa data pengurutan tidak hanya mencakup circRNA tetapi juga mRNA dan lncRNA, sehingga memungkinkan analisis gabungan dari kumpulan data ini.
●Analisis Opsional Jaringan RNA Endogen Kompetitif (ceRNA)Memberikan wawasan yang lebih mendalam tentang mekanisme pengaturan seluler.
● Dukungan Purna JualKami memahami betapa pentingnya kehadiran, itulah sebabnya komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan masa layanan purna jual selama 3 bulan. Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menjawab pertanyaan apa pun terkait hasilnya.
Persyaratan dan Pengiriman Sampel
| Perpustakaan | Platform | Data yang direkomendasikan | Kontrol Kualitas Data |
| pustaka terarah yang kekurangan rRNA | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
Contoh Persyaratan:
Nukleotida:
| Konsentrasi (ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Kontaminasi protein atau DNA yang terlihat pada gel terbatas atau tidak ada sama sekali. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; Peningkatan dasar yang terbatas atau tidak ada sama sekali |
● Tanaman:
Akar, Batang, atau Kelopak: 450 mg
Daun atau Biji: 300 mg
Buah: 1,2 g
● Hewan:
Jantung atau Usus: 450 mg
Organ Dalam atau Otak: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, Rambut, atau Kulit: 1,5g
● Arthropoda:
Serangga: 9g
Krustasea: 450 mg
● Darah utuh:2 tabung
● Sel: 106 sel
● Serum dan Plasma: 6 mL
Pengiriman Sampel yang Direkomendasikan
Wadah: Tabung sentrifugasi 2 ml (Tidak disarankan menggunakan kertas timah)
Pelabelan sampel: Grup+replika, misalnya A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pengiriman:
1. Es kering: Sampel perlu dikemas dalam kantong dan dikubur dalam es kering.
2. Tabung RNAstable: Sampel RNA dapat dikeringkan dalam tabung stabilisasi RNA (misalnya, RNAstable®) dan dikirim pada suhu ruangan.
Alur Kerja Layanan
Desain eksperimen
Pengiriman sampel
Ekstraksi RNA
Konstruksi perpustakaan
Pengurutan
Analisis data
Layanan purna jual
Bioinformatika
- Kontrol Kualitas Data
- Penyelarasan genom
- Identifikasi CircRNA
- Ekspresi CircRNA
- Analisis ekspresi diferensial
Prediksi circRNA: distribusi kromosom
circRNA yang Diekspresikan Secara Berbeda – Plot Gunung Berapi
circRNA yang diekspresikan secara berbeda – pengelompokan hierarkis
Pengayaan fungsional gen inang circRNA
Jelajahi kemajuan penelitian yang difasilitasi oleh layanan pengurutan circRNA BMKGene melalui koleksi publikasi pilihan.
Wang, X. dkk. (2021) 'CPSF4 mengatur pembentukan circRNA dan penekanan gen yang dimediasi microRNA pada karsinoma hepatoseluler',Onkogen2021 40:25, 40(25), hlm. 4338–4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. dkk. (2023) 'Transkriptom responsif X oo mengungkapkan peran RNA sirkular133 dalam ketahanan penyakit dengan mengatur ekspresi OsARAB pada padi',Penelitian Fitopatologi, 5(1), hlm. 1–14. doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. dkk. (2023) 'CPSF3 memodulasi keseimbangan transkrip sirkular dan linear pada karsinoma hepatoseluler'. doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. dkk. (2023) 'Evaluasi komprehensif circRNA pada kardiomiopati sirosis sebelum dan setelah transplantasi hati',Imunofarmakologi Internasional, 114, hal. 109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
