●Platform:Illumina NovaSeq 6000 dan NovaSeq X Plus
●Mode pengurutan:PE150 dan PE250
●Kontrol kualitas pustaka sebelum pengurutan
●Kontrol kualitas dan pengiriman data sekuensing:Pengiriman laporan QC dan data mentah dalam format fastq setelah demultipleksing dan penyaringan Q30 pembacaan
●Fleksibilitas layanan pengurutan:Pelanggan dapat memilih untuk melakukan pengurutan berdasarkan jalur, sel aliran, atau berdasarkan jumlah data yang dibutuhkan (pengurutan jalur parsial).
●Pengalaman luas pada platform sekuensing Illumina:dengan ribuan proyek tertutup yang melibatkan berbagai spesies.
●Pengiriman laporan QC sekuensing:dengan metrik kualitas, akurasi data, dan kinerja keseluruhan proyek pengurutan.
●Proses pengurutan yang matang:dengan waktu penyelesaian yang singkat.
●Kontrol Kualitas yang KetatKami menerapkan persyaratan QC yang ketat untuk menjamin penyampaian hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
| Platform | Sel Aliran | Mode pengurutan | Satuan | Perkiraan output |
| NovaSeq X | 10B (8 lajur) | PE150 | Jalur Tunggal Jalur Sebagian | 375Gb / Jalur |
| 25B (8 lajur) | PE150 | Jalur Tunggal Jalur Sebagian | 1000 Gb/Jalur | |
| NovaSeq 6000 | Sel aliran SP (2 jalur) | PE250 | Sel Aliran Jalur Tunggal Jalur Sebagian | 325-400 M membaca / Jalur |
| Sel aliran S4 (4 jalur) | PE150 | Sel Aliran Jalur Tunggal Jalur Sebagian | ~800 Gb / Jalur |
| Jumlah Data (X) | Konsentrasi (qPCR/nM) | Volume | |
| Pengurutan Jalur Parsial
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 GB | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Pengurutan Jalur | Per Jalur | ≥ 1,5 nM / Kumpulan pustaka | ≥ 25 μl / Kumpulan pustaka |
Selain konsentrasi dan jumlah total, pola puncak yang sesuai juga diperlukan.
Catatan: Pengurutan jalur pustaka dengan keragaman rendah memerlukan penambahan PhiX untuk memastikan penentuan basa yang akurat.
Kami menyarankan untuk mengirimkan pustaka yang telah dikumpulkan sebelumnya sebagai sampel. Jika Anda memerlukan BMKGENE untuk melakukan pengumpulan pustaka, silakan merujuk ke
Persyaratan pustaka untuk pengurutan jalur parsial.
Puncak utama seharusnya berada dalam rentang 300-450 bp.
Pustaka DNA harus memiliki satu puncak utama, tidak ada kontaminasi adaptor, dan tidak ada dimer primer.
Laporan tentang kualitas pustaka diberikan sebelum pengurutan, yang menilai jumlah pustaka dan fragmentasi.
Tabel 1. Statistik data pengurutan.
| ID Sampel | BMKID | Bacaan mentah | Data Mentah (bp) | Pembacaan bersih (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Gambar 1. Distribusi kualitas sepanjang pembacaan di setiap sampel
Gambar 2. Distribusi isi dasar
Gambar 3. Distribusi isi bacaan dalam data sekuensing