-
Urutan Imunopresipitasi Kromatin (ChIP-seq)
ChIP-Seq menyediakan profil genom seluruh target DNA untuk modifikasi histone, faktor transkripsi, dan protein terkait DNA lainnya.Ini menggabungkan selektivitas kromatin imunopresipitasi (ChIP) untuk memulihkan kompleks protein-DNA spesifik, dengan kekuatan sekuensing generasi berikutnya (NGS) untuk sekuensing throughput tinggi dari DNA yang dipulihkan.Selain itu, karena kompleks protein-DNA diperoleh kembali dari sel hidup, tempat pengikatan dapat dibandingkan dalam berbagai jenis sel dan jaringan, atau dalam kondisi yang berbeda.Aplikasi berkisar dari regulasi transkripsi hingga jalur perkembangan hingga mekanisme penyakit dan seterusnya.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Sekuensing seluruh genom bisulfit
Metilasi DNA pada posisi kelima dalam sitosin (5-mC) memiliki pengaruh mendasar pada ekspresi gen dan aktivitas seluler.Pola metilasi abnormal telah dikaitkan dengan beberapa kondisi dan penyakit, seperti kanker.WGBS telah menjadi standar emas untuk mempelajari metilasi luas genom pada resolusi basa tunggal.
Platform: Illumina NovaSeq6000
-
Pengujian untuk Kromatin yang Dapat Diakses Transposase dengan Urutan Throughput Tinggi (ATAC-seq)
ATAC-seq adalah metode sekuensing throughput tinggi untuk analisis aksesibilitas kromatin lebar genom, yang penting untuk kontrol epigenetik global ekspresi gen.Adaptor pengurutan dimasukkan ke daerah kromatin terbuka oleh transposase Tn5 hiperaktif.Setelah amplifikasi PCR, perpustakaan sequencing dibangun.Semua daerah kromatin terbuka dapat diperoleh di bawah kondisi ruang-waktu tertentu, tidak hanya terbatas pada situs pengikatan faktor transkripsi, atau daerah modifikasi histon tertentu.
-
Pengurutan Bisulfit Representasi yang Dikurangi (RRBS)
Penelitian metilasi DNA selalu menjadi topik hangat dalam penelitian penyakit, dan terkait erat dengan ekspresi gen dan sifat fenotipik.RRBS adalah metode yang akurat, efisien dan ekonomis untuk penelitian metilasi DNA.Pengayaan daerah pulau promotor dan CpG dengan pembelahan enzimatik (Msp I), dikombinasikan dengan sekuensing Bisulfit, memberikan deteksi metilasi DNA resolusi tinggi.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
