Pengurutan mRNA Eukariotik-NGS
Fitur
● Persiapan pustaka mRNA terarah opsional untuk memungkinkan perolehan data pengurutan spesifik untai.
● Berbagai analisis BI mencakup semua kebutuhan klien kami
Keuntungan
●Keahlian yang LuasKami telah memproses lebih dari 600.000 sampel, yang mencakup berbagai jenis sampel seperti kultur sel, jaringan, dan cairan tubuh. Kami membawa kekayaan keahlian ke setiap proyek.
●Kontrol Kualitas yang KetatKami menerapkan titik kontrol inti di semua tahapan, mulai dari persiapan sampel hingga persiapan pustaka, pengurutan, dan bioinformatika. Pemantauan kami yang cermat memastikan penyampaian hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
●Anotasi KomprehensifKami menggunakan berbagai basis data untuk memberi anotasi fungsional pada Gen yang Diekspresikan Secara Berbeda (DEGs) dan melakukan analisis pengayaan yang sesuai. Pendekatan komprehensif ini memberikan wawasan tentang proses seluler dan molekuler yang mendasari respons transkriptom, memastikan Anda mendapatkan semua informasi yang mungkin tentang data eksperimen Anda.
●Dukungan Purna JualKami memahami betapa pentingnya kehadiran, itulah sebabnya komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan masa layanan purna jual selama 3 bulan. Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menjawab pertanyaan apa pun terkait hasilnya.
Persyaratan dan Pengiriman Sampel
| Perpustakaan | Strategi pengurutan | Data yang direkomendasikan | Kontrol Kualitas |
| Diperkaya dengan Poli A | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 GB | Q30≥85% |
Contoh Persyaratan:
Nukleotida:
Persyaratan Sampel Minimum:
| Konsentrasi (ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas | |
| Perpustakaan Standar | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Kontaminasi protein atau DNA yang terlihat pada gel terbatas atau tidak ada sama sekali. | Untuk tanaman: RIN≥4.0; Untuk hewan: RIN≥4,5; 5.0≥28S/18S≥1.0; Peningkatan dasar yang terbatas atau tidak ada sama sekali |
| Perpustakaan Arah | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Kontaminasi protein atau DNA yang terlihat pada gel terbatas atau tidak ada sama sekali. | Untuk tanaman: RIN≥4.0; Untuk hewan: RIN≥4,5; 5.0≥28S/18S≥1.0; Peningkatan dasar yang terbatas atau tidak ada sama sekali |
| Tanaman | Hewan | Arthropoda | Darah utuh | Sel |
| Akar, Batang, atau Kelopak: 450 mg Daun atau Biji: 300 mg Buah: 1,2 g | Jantung atau Usus: 300 mg Organ Dalam atau Otak: 240 mg Otot: 450 mg Tulang, Rambut, atau Kulit: 1g | Serangga: 6g Krustasea: 300 mg | 1 tabung | 106 sel |
Pengiriman Sampel yang Direkomendasikan
Wadah: Tabung sentrifugasi 2 ml (Tidak disarankan menggunakan kertas timah)
Pelabelan sampel: Grup+replikasi misalnya A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...
Pengiriman:
1. Es kering: Sampel perlu dikemas dalam kantong dan dikubur dalam es kering.
2. Tabung tabel RNA: Sampel RNA dapat dikeringkan dalam tabung stabilisasi RNA (misalnya RNAstable®) dan dikirim pada suhu ruangan.
Persyaratan dan Pengiriman Sampel
Desain eksperimen
Pengiriman sampel
Ekstraksi RNA
Konstruksi perpustakaan
Pengurutan
Analisis data
Layanan purna jual
Bioinformatika
Untuk sampel yang memiliki genom referensi yang tersedia, analisis BI adalah sebagai berikut:
ØKontrol kualitas data mentah
ØPenyelarasan genom referensi
ØAnalisis struktur transkrip
ØKuantifikasi ekspresi
ØAnalisis ekspresi diferensial
ØAnotasi dan pengayaan fungsi
Untuk sampel tanpa genom referensi, berikut adalah opsi yang tersedia:
• Kontrol kualitas data mentah
•Perakitan dengan optimasi struktur
•Analisis ekspresi diferensial
•Anotasi dan pengayaan fungsi
Penyelarasan Genom Referensi
Kejenuhan Data
Korelasi sampel dan penilaian replikasi biologis
Gen yang Diekspresikan Secara Berbeda (DEGs)
Anotasi Fungsional dari DEGs
Pengayaan Fungsional dari Gen yang Diturunkan Nilainya
Jelajahi kemajuan yang difasilitasi oleh layanan pengurutan mRNA NGS eukariotik BMKGene melalui koleksi publikasi pilihan.
Huang, L. dkk. (2023) 'Triclosan dan triclocarban melemahkan kemampuan penciuman ikan mas dengan membatasi pengenalan bau, mengganggu transduksi sinyal penciuman, dan mengganggu pemrosesan informasi penciuman',Penelitian Air, 233, hlm. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ dkk. (2023) 'Aspergillus fumigatus membajak p11 manusia untuk mengalihkan fagosom yang mengandung jamur ke jalur non-degradatif',Sel Inang & Mikroba, 31(3), hal.373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. dkk. (2022) 'Faktor Transkripsi TCP yang Terlibat dalam Perkembangan Tunas Bambu Ma (Dendrocalamus latiflorus Munro)',Batasan dalam Ilmu Tanaman, 13, hlm. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. dkk. (2022) 'Genom Chrysanthemum lavandulifolium dan mekanisme molekuler yang mendasari beragam tipe kapitulum',Penelitian Hortikultura9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie dkk. (2023) 'Nanoreaktor kaskade untuk meningkatkan terapi sonodinamik pada kanker kolorektal melalui peningkatan ROS sinergis dan penghambatan autofagi',Nano Hari Ini, 49, hal. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
